换一批
换一批基于生物信息技术分析GINS1基因在肺癌中的表达及意义
摘要：
背景与目的 肺癌是全球最常见的恶性肿瘤,大多数患者初次诊断时已发生转移,因此寻找肺癌新的诊断标志物并探索其在肺癌发生中的作用具有重要价值.基于生物信息数据探讨分析肺癌中GINS1基因与肺癌预后的相关性具有重要意义.方法 检索Oncomine、EGPIA、TCGA、Human protein atlas等基因数据库,分析GINS1基因在肺癌中的表达差异.应用蛋白质免疫印记法检测肺癌及癌旁组织中GINS1蛋白的表达水平,应用Kaplan-Meier进行患者生存分析,并利用String-DB数据库分析GINS1蛋白相互作用网络.结果 对Oncomine、GEPIA和The Human Protein Atlas数据库中肺癌与癌旁组织蛋白表达数据进行差异性分析,发现GINS1蛋白在肺癌组织中显著高表达,特别以肺腺癌、肺鳞癌中表达明显增加;通过生存分析发现高表达GINS1肺腺癌患者生存期明显低于低表达者,高表达患者预后更差;利用String-DB数据库发现与GINS1蛋白关联最为密切的为GINS蛋白家族(GINS2、GINS3、GINS4),其次为CDC45、MCM蛋白家族(MCM2、MCM3、MCM4、MCM5、MCM6、MCM7),富集分析发现互作蛋白主要参与DNA复制和细胞周期.结论 GINS1基因在肺癌组织中显著高表达,与患者预后相关,其有可能成为肺癌诊断及药物治疗的新靶点.
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