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基于网络药理学和实验验证探讨脉络舒通丸对大鼠股骨骨折所致后肢肌肉肿胀的作用机制
编辑人员丨5天前
旨在通过网络药理学及动物实验探讨脉络舒通丸(MLST)对股骨骨折后肢体肿胀(SCFF)的作用机制.利用液质联用技术分析MLST入血成分,网络药理学预测其入血成分对SCFF的靶点和信号通路,分子对接进行验证.通过动物实验建立SCFF模型大鼠,给予不同剂量的MLST治疗,检测其肢体肿胀程度,苏木精-伊红(HE)染色检测肌肉组织病理变化,酶联免疫吸附测定法(ELISA)测定外周血白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)及肿瘤坏死因子-α(TNF-α)含量,采用Western blot测定相关信号通路表达.网络药理学结果显示,MLST与SCFF疾病作用靶点共计 153 个,关键靶点有IL-6、TNF等,涉及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇 3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路等;对主要入血成分和关键靶点进行分子对接,结合能均小于-7.0 kcal·mol-1,说明网络分析结果可靠.动物实验结果表明,与模型组相比,MLST可以减轻SCFF大鼠后肢肌肉肿胀度及其病理损伤,降低SCFF大鼠血清中IL-6、IL-1β及TNF-α水平,降低SCFF大鼠中p-AKT、p-PI3K、p-NF-κB、p-p38 MAPK、p-ERK蛋白表达.综上,MLST可能通过调节PI3K/AKT与MAPK相关信号通路蛋白的表达,降低血清中炎症因子含量,改善大鼠SCFF.
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编辑人员丨5天前
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基于细胞焦亡基因前列腺癌预后模型的构建及肿瘤微环境分析
编辑人员丨5天前
目的 基于细胞焦亡基因构建前列腺癌(PCa)预后模型并分析其肿瘤微环境.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取502例PCa患者和51例健康者的基因转录组数据、基因突变数据,提取差异表达的细胞焦亡基因.从基因表达综合(GEO)数据库中获取96例PCa患者的临床特征及细胞焦亡基因表达数据,筛选出与预后相关的细胞焦亡基因.从ImmPort数据库中下载免疫细胞数据.采用聚类分析确定PCa患者的最佳亚型分组并采用主成分分析(PCA)进行验证.对不同亚型PCa患者的差异交集基因进行基因本位(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.将单因素Cox分析获得的显著差异表达基因纳入Lasso回归模型,获取与预后相关的基因.将PCa患者随机均等分为训练集和测试集,分别进行Lasso回归分析,根据训练集风险评分的中位值将训练集、测试集分为高风险组和低风险组.采用多因素Cox回归模型分析PCa患者预后的独立影响因素并构建预后模型.应用R语言包分析细胞焦亡基因与免疫细胞含量、干细胞含量与风险评分的相关性及高低风险组患者的肿瘤突变负荷差异.结果 差异分析获得37个显著差异表达的细胞焦亡基因.根据细胞焦亡基因的表达量及临床数据分析,获得10个与PCa预后相关的细胞焦亡基因.根据累积分布函数图的K值将PCa分为A、B、C三个亚型,且经PCA分析验证分型结果可靠.GO及KEGG富集分析结果显示,109个差异交集基因主要通过细胞外基质组织(EMO)、细胞外结构组织(ESO)、肽基酪氨酸磷酸化(PTP)、肽基酪氨酸修饰(PTM)等通路激活蛋白酪氨酸激酶(PTK)、跨膜受体蛋白激酶(TRPK)等分子功能.Lasso回归模型筛选出B细胞淋巴瘤/白血病3(BCL3)、骨形成蛋白2(BMP2)、C-C趋化因子受体5(CCR5)、几丁质酶3样蛋白2(CHI3L2)、肝癌缺失蛋白1(DLC1)、主要组织相容性复合体Ⅱ类DQ alpha2(HLA-DQA2)、分泌球蛋白家族3A成员1(SC-GB3Al)、serpin家族E成员1(SERPINE1)、溶质载体家族14成员1(SLC14A1)9个与预后相关的基因.差异分析显示,训练集与测试集预后情况大致相同,且随着风险评分的升高,患者死亡人数增加.多因素Cox分析结果显示,年龄、肿瘤分期(T分期、N分期)、风险程度均是PCa患者预后的独立影响因素.预后模型预测PCa患者第6、9、12年的生存情况与患者的实际生存情况比较相符.相关性分析显示,免疫细胞与细胞焦亡基因存在相关性(P<0.01).对高风险组(n=376)与低风险组(n=126)进行差异分析,结果显示,高风险组患者的基质细胞评分和肿瘤突变负荷均明显高于低风险组,差异均有统计学意义(P<0.01).干细胞含量与风险评分呈正相关(P<0.01).结论 本文成功构建了基于细胞焦亡基因的PCa预后模型,并进行了肿瘤微环境分析,发现了 BCL3、BMP2、CCR5、CHI3L2、DLC1、HLA-DQA2、SCGB3A1、SERPINE1、SLC14A 1 9 个细胞焦亡基因,可预测 PCa 患者的预后和免疫治疗反应,有利于进一步指导临床实践.
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编辑人员丨5天前
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基于炎症大鼠代谢组学的马钱子炮制减毒存效机制研究
编辑人员丨5天前
运用动物模型、血浆药物化学及代谢组学方法,探讨马钱子炮制前后干预炎症大鼠作用机制.按不同剂量灌胃小鼠,以死亡率初步考察炮制前后毒性;建立大鼠蛋清性足跖肿胀模型,通过肿胀率和炎性因子水平评价炮制前后抗炎效果;采用高分辨质谱结合多元统计学,鉴定入血后的移行成分及相应的代谢产物;比较分析各实验组代谢轮廓及差异生物标志物,并构建其代谢通路.结果显示,高剂量下马钱子砂烫品的毒性要明显低于生品.生品和砂烫品均能显著降低大鼠足肿胀率和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白介素-1β(IL-1β)、白介素-6(IL-6)的水平,炮制前后在抗炎效果上差异无统计学意义(P>0.05).通过血浆药物分析,鉴定出了 12个移行成分,以及相应60个代谢产物,S-plot鉴定出10个差异性化合物.代谢组学实验共发现10个内源性代谢物含量发生显著变化(P<0.05),生物标志物主要涉及苯丙氨酸代谢、甘油磷脂代谢、谷氨酸及谷氨酰胺循环、精氨酸和脯氨酸代谢等途径.通过本研究确证马钱子生品和砂烫品均有较好抗炎治疗作用,高温炮制可以降低马钱子毒性;入血后有效成分应多为生物碱,经过Ⅰ相反应就容易被体内清除;马钱子炮制抗炎、镇痛、减毒机制主要与氨基酸和脂质代谢相关.该实验结果进一步阐明了起效物质基础及体内作用机制,为后续炮制工艺改进和新药研发等提供科学支撑.
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编辑人员丨5天前
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基于数据挖掘与网络药理学的中医药治疗心肌缺血的用药规律及药理分析
编辑人员丨5天前
目的 通过数据挖掘与生物信息学分析中医药治疗心肌缺血的用药规律及药理分析.方法 以"心肌缺血"作为主题词,收集相关文献并进行处方分析.将频率最高的药作为网络药理学分析对象,采用TC-MSP分析平台构建相应活性成分及靶点数据库,采用OMIM、TTD和Gencards数据库预测疾病相关的靶点基因.使用Venn取相应药组与疾病靶点的交集,将交集靶点导入STRING数据库构建蛋白相互作用网络,并将PPI网络导入Cytoscape 39.0软件筛选核心靶点,同时构建"药物-有效成分-靶点"相互作用网络.采用Metascape数据库进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析,并在微生信进行可视化处理.结果 共纳入符合要求的文献234篇,中医证型分布气虚血瘀证最多(56篇);高频药物分析,其中黄芪(159篇)、当归(138篇)、党参(127篇)的频数最高,用药靶向多集中于补虚、活血化瘀等,药性以温为主;药味以辛、甘最多;归经主要归属肝经、肺经和心经;在TCMSP数据库中筛选得到19个药物成分,根据度值排名槲皮素、木犀草素、芍药苷和异甘草素排名靠前;度值筛选出中药治疗心肌缺血排名前的核心靶点为磷脂酰肌醇3激酶(PIK3)、蛋白激酶(Akt-1)、白细胞介素6(IL-6)、血管内皮生长因子(VEGF),通过GO和KEGG的富集分析,分析出药物主要通过参与氧化应激、凋亡等生物过程以及凋亡、铁死亡等信号通路治疗心肌缺血.结论 中医药可能通过槲皮素、木犀草素等成分通过作用于PI3K、AKT1、IL-6、VEGF调节氧化应激反应、凋亡信号通路治疗心肌缺血.
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编辑人员丨5天前
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健康社会决定因素水平与脑卒中发病风险的关系——一项基于全国前瞻性队列的研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨健康社会决定因素(social determinants of health,SDOH)水平对脑卒中发病风险的影响,揭示不同SDOH水平地区人群脑卒中主要危险因素.方法:入选中国高血压调查 2012~2015 年采用分层多阶段随机抽样方法在全国 14 个省级行政区 30 个区县中抽取的 30 036 名≥35 岁的常驻居民,调查心血管疾病患病及相关危险因素情况,并于 2018~2019 年随访脑卒中事件.使用主成分分析依据社会经济和医疗资源相关 9 个指标构建SDOH得分,并根据其三分位数将研究对象分为三组:SDOH得分在≥-2.01~<-1.14 分为低SDOH组(n=8 343),≥-1.14~<0.10 分为中SDOH组(n=7 257),≥0.10~≤5.79分为高SDOH组(n=8 457).使用多因素Cox比例风险回归分析SDOH水平与脑卒中发病风险的关系.采用随机生存森林方法探究不同SDOH水平地区脑卒中的主要危险因素.结果:最终纳入 24 057 名研究对象,平均随访(4.7±0.8)年期间,669 例(2.8%)发生脑卒中.低、中和高SDOH组脑卒中的发病密度分别为 468.39/10 万人年、628.85/10 万人年和 700.39/10 万人年(Pdifference<0.05,Ptrend=0.01).与低SDOH组相比,中、高SDOH组发生脑卒中的HR(95%CI)分别为 1.91(1.54~2.36)和 1.59(1.30~1.95);随着SDOH水平升高,脑卒中发病风险呈现上升趋势(Ptrend<0.001).高龄是人群脑卒中首要危险因素,特别是高SDOH水平地区.在中SDOH水平地区,糖尿病是脑卒中的重要的可改变危险因素.低SDOH水平地区,高血压和饮酒是重要的可改变危险因素.结论:脑卒中发病风险与高SDOH水平相关联;不同SDOH水平地区脑卒中的主要危险因素不同.建议通过实施有针对性的干预措施,提高不同SDOH地区人群脑卒中防治效果.
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编辑人员丨5天前
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不同性别社区人群体成分与胰岛素抵抗关联研究
编辑人员丨5天前
目的 分析不同性别一般人群的体成分与胰岛素抵抗(Insulin Resistance,IR)之间的关系.方法 本研究数据来源于2021年中国居民心血管病及其危险因素监测项目合肥地区数据,共纳入1 144例研究对象,其中男性568人,女性 576 人.用甘油三酯(Triglyceride,TG)/高密度脂蛋白胆固醇(High Density Lipoprotein Cholesterol,HDL-C)作为 IR的替代指标,采用卡方检验分析不同体成分(体质指数(Body Mass Index,BMI)、体脂百分比(Percentage Of Body Fat,PBF)、肌肉百分比(Percentage Of Body Muscle,PBM)、腰围(Waist Circumference,WC)和内脏脂肪等级(Visceral Fat Grade,VFG)组与TG/HDL-C之间的关系,采用logistic回归分析TG/HDL-C高于切点值的体成分影响因素,用限制性立方样条探究各体成分与TG/HDL-C之间的剂量反应关系.结果 男性IR阳性检出率(TG/HDL-C高于切点值的率)为15.85%,女性为4.69%.在调整混杂因素后,logistic回归分析结果显示,与对照组相比,男性人群发生IR风险的体成分分组中,肥胖组是5.58倍(OR=5.58,95%CI:1.98~15.72),PBF第三四分位组是7.90倍(OR=7.90,95%CI:1.68~37.15),PBF 第四四分位组是 8.20 倍(OR=8.20,95%CI:1.75~38.40),PBM 第三四分位组是 0.27 倍(OR=0.27,95%CI:0.10~0.71),PBM 第四四分位组是 0.09 倍(OR=0.09,95%CI:0.02~0.44),VFG 偏高组是3.11 倍(OR=3.11,95%CI:1.45~6.68),VFG 高组是 4.28 倍(OR=4.28,95%CI:1.45~12.64),腹型肥胖是 2.21倍(OR=2.21,95%CI:1.08~4.56);女性人群发生IR风险的体成分分组中,肥胖组是6.61倍(OR=6.61,95%CI:1.08~65.66),VFG 高组是 8.52 倍(OR=8.52,95%CI:1.90~70.86)(P<0.05).限制性立方样条显示,BMI、PBF、PBM、VFG、WC均与TG/HDL-C存在剂量反应关系和近似线性关系.结论 社区居民的体成分与发生胰岛素抵抗风险密切相关,肥胖人群以及高内脏脂肪人群发生胰岛素抵抗风险较高,应加强生活方式干预,保持较高肌肉率.
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编辑人员丨5天前
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基于血清药物化学和网络药理学研究双虎肿痛宁酊剂抗炎镇痛的药效物质和作用机制
编辑人员丨5天前
目的 基于超高效液相-四极杆飞行时间串联质谱联用技术(UPLC-Q-TOF-MS/MS)方法定性鉴定双虎肿痛宁酊剂的入血药效成分,并结合网络药理学探究其抗炎镇痛的潜在作用机制.方法 通过对比含药血清、空白血清的色谱图,并结合PubChem、HMDB、MassBank数据库二级谱图及对照品裂解信息,分析鉴定双虎肿痛宁酊剂的入血成分.借助相关数据库对入血成分、疾病进行靶点收集筛选,运用Cytoscape软件进行网络可视化处理;对共有靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 在给药血清中初步鉴定出阿魏酸、新乌头碱、次乌头碱、4-羟基肉桂酸、甲芬那酸5个原形成分;涉及白细胞介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路,改善、调节疼痛和炎症反应等过程,发挥药理作用.结论 本实验通过结合UPLC-Q-TOF-MS/MS和网络药理学的方法明确了双虎肿痛宁酊剂的入血成分,初步阐明了双虎肿痛宁酊剂抗炎镇痛的作用机制,为临床应用提供了参考.
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编辑人员丨5天前
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UPLC-Q-TOF-MS联合网络药理学探究苦参治疗湿疹的作用机制
编辑人员丨5天前
目的 采用UPLC-Q-TOF-MS和网络药理学方法,从分子水平揭示苦参经皮给药对湿疹的潜在作用机制.方法 采用UPLC-Q-TOF-MS技术,结合文献数据鉴定化学成分.通过Swiss Target Prediction数据库预测作用靶点,Cytoscape 3.9.0构建蛋白质互相作用(PPI)网络图,利用Metascape数据库对靶点进行GO注释和KEGG通路分析.结果 小鼠经皮给药后推测出 14 个皮肤滞留原形成分,7 个入血原形成分.网络药理学研究得到肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、表皮生长因子受体(EGFR)等苦参治疗湿疹的核心靶点.KEGG富集分析显示与血清素能突触信号通路、花生四烯酸代谢等信号途径密切相关.结论 通过UPLC-Q-TOF-MS结合网络药理学进一步阐明苦参外用治疗湿疹的主要靶点和通路,为后续深入研究提供参考.
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编辑人员丨5天前
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中医药干预早发性卵巢功能不全相关信号通路研究进展
编辑人员丨1周前
早发性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)是指女性在40 岁之前因卵巢功能减退而导致的临床综合征.POI不仅会降低女性的生殖能力,还会对其造成巨大的心理负担和社会压力.现代医学针对POI采取的激素替代疗法(hormone replacement therapy,HRT)虽然取得了较好的临床疗效,但长期使用会增加女性罹患乳腺肿瘤、血栓栓塞症、卵巢癌等疾病的风险.近年来,中医药治疗POI因多成分、多靶点、多途径、简验廉效、不良反应小等特点备受青睐.本文查阅整理了国内外相关研究报道,发现中药单体及复方能够通过调控血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)/VEGF受体(VEGF receptor,VEGFR)通路、转化生长因子(transforming growth factor,TGF)-β/Smads通路、磷脂酰肌醇 3-激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又称Akt)通路、核因子E2 相关因子(nuclear factor erythroid-2-related factor,Nrf)-2/抗氧化应答元件(antioxidant response element,ARE)通路、核转录因子(nuclear factor,NF)-κB通路等多条信号通路,发挥调节卵巢血供、降低卵泡氧化应激及炎症反应程度、刺激卵泡增殖等作用,达到改善卵巢功能状态的效应.基于此,笔者将以信号通路作为切入点,归纳总结中药单体及复方防治POI的作用机制,以期为中医药的基础实验研究、中药临床诊疗与药物开发提供参考依据.
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编辑人员丨1周前
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基于数据挖掘的刘启泉教授治疗慢性萎缩性胃炎用药规律及机制研究
编辑人员丨1周前
目的 基于古今医案云平台及网络药理学方法,探讨刘启泉教授治疗慢性萎缩性胃炎(Chronic atrophic gastritis,CAG)的组方规律及核心药物作用机制,为CAG的治疗提供客观依据.方法 收集刘启泉教授治疗CAG门诊处方,通过古今医案云平台挖掘相关用药规律,对核心药物组合活性成分及CAG潜在靶点进行网络药理学机制分析.结果 共纳入635份医案,涉及176味中药,有42味中药使用频次超过110次,主要为清热药、理气药、补虚药及活血化瘀药;结合高频药物、关联规则及聚类分析得到治疗CAG的核心药物组合为:蒲公英、延胡索、当归、茯苓、郁金、石菖蒲、白芍、莪术、香附.网络药理学分析表明核心药物组合中8-异戊烯基山奈酚、山柰酚、β-谷甾醇等活性成分作用于蛋白激酶B1(Proteinkinase B1,AKT1)、肿瘤抑制因子p53(Tumorsuppressorp53,Tp53)、白介素-6(Interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(Tumor necrosis factor,TNF)等核心靶点;核心药物组合治疗CAG的潜在靶点主要富集在66个细胞组成、99种分子功能和683个生物过程中;生物学通路主要为癌症通路、白介素-17(Interleukin-17,IL-17)信号通路、TNF信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(Phosphoinosi-tide 3-kinase/proteinkinase B,PI3K/Akt)信号通路、p53信号通路等.结论 通过数据挖掘方法较好体现了刘启泉教授治疗CAG的用药规律,即以"肝郁热毒血瘀"为核心病机,以调肝为先,解毒、活血、补虚并用;并初步揭示了刘启泉教授治疗CAG用药的多靶点作用机制,为临床应用提供参考.
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编辑人员丨1周前