目的 基于生物信息学方法筛选调控Rab23表达以及影响头颈部鳞状细胞癌预后相关的MicroiRNA(miRNA)并验证,为进一步探讨头颈部鳞状细胞癌的发生和侵袭作用机制提供新的研究思路和方法.方法 依据miRWalk数据库筛选调控Rab23表达的潜在miRNA,根据TCGA公共数据库和miRWalk数据库筛选影响头颈部鳞状细胞癌生存期的差异表达miRNA,双重筛选交集后确定调控Rab23表达及影响头颈部鳞状细胞癌预后相关的miRNA分子,再通过实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)、蛋白免疫印迹和双荧光素酶实验进行结果验证.结果 筛选出250个差异表达miRNA,其中8个是潜在调控Rab23表达的miRNA.hsa-miR-363-3p是既能调控Rab23表达,又可显著影响头颈部鳞状细胞癌预后的miRNA.RT-qPCR、蛋白免疫印迹实验证实hsa-miR-363-3p与Rab23在肿瘤细胞和转染细胞模型中呈负调控;双荧光素酶实验验证hsa-miR-363-3p能够靶向作用于Rab23基因.结论 hsa-miR-363-3p参与靶向调控Rab23表达,可能参与了头颈部鳞状细胞癌的侵袭和转移的作用机制.

为明确珠子参、羽叶三七和秀丽假人参3 种药用植物叶绿体基因组特征与系统发育关系,该文以秦巴山区 3 种人参属药用植物为研究对象,运用生物信息学技术,分析其叶绿体基因组特征及密码子使用偏好性,并探讨三者之间的亲缘关系.结果表明:(1)3 种人参属药用植物的叶绿体基因组为典型的四分体结构,序列全长为 156 071～156 104 bp,总 GC 含量为 38.10%,基因组大小相似度较高.(2)均注释到 133 个基因,包括 88 个蛋白编码基因、37 个tRNA基因和 8 个rRNA基因.(3)3 种人参属药用植物叶绿体密码子使用偏好性相似,密码子第 3 位碱基以 A/U 结尾为主,密码子使用模式在受到突变影响的同时,主要受到自然选择的影响.(4)系统发育结果显示,3 种人参属药用植物的亲缘关系较近,并且秀丽假人参同羽叶三七亲缘关系更近.综上认为,秀丽假人参与珠子参基源植物之间存在近缘关系,这项发现对于珠子参中药材的资源开发利用和分子鉴定,以及进一步研究人参属物种的分类、系统发育和进化机制提供了重要依据.

铁死亡被认为是一种铁依赖性、非凋亡形式的调节性细胞死亡,主要由活性氧产生和铁稳态失衡导致严重脂质过氧化而引发的,它可诱导相关因子可通过不同途径直接或间接影响谷胱甘肽过氧化物酶,导致抗氧化能力下降和细胞中脂质活性氧积累,最终导致氧化细胞死亡.同时,铁死亡受到了多种途径调控,如铁代谢、线粒体活性、氧化还原稳态以及与疾病相关信号通路等.据研究报道,铁死亡代谢途径失调可影响肝癌的发生、发展.目前铁死亡导致疾病的分子机制知之甚少,但铁死亡相关基因和通路与肝癌进展有关.研究发现,Wnt/β-catenin 信号通路异常激活与肝癌的复发、侵袭、转移以及免疫逃逸有关,且与铁死亡之间存在密切的联系.该通路可通过调控铁死亡的发生从而进一步加重肝癌的恶化.目前该领域在肝癌中已取得一定的实质性进展.因此,在本综述中通过概述铁死亡的分子机制及其在肝癌中的作用,探讨其影响肝癌进展的过程,同时,具体分析Wnt/β-catenin 信号通路调控铁死亡的发生过程,为未来肝癌的治疗提供可靠的科学理论依据.

目的:探索白花丹醌(Plumbagin,PLB)对肝癌类干细胞增殖迁移及干性转录因子表达的影响.方法:采用多细胞肿瘤球体模式培养富集肝癌类干细胞,设置肝癌细胞组与肝癌类干细胞组,PLB浓度0、5、7.5、10 μmol/L组,药物作用时间为24 h,采用MTT法、平板克隆实验、悬浮干细胞成球实验和划痕实验检测细胞增殖、体外成球和迁移能力;qRT-PCR和Western blotting检测干性基因和干性蛋白的表达.结果:成功富集肝癌HepG2类干细胞,与肝癌HepG2细胞组比较,肝癌HepG2类干细胞组细胞克隆形成率降低、划痕愈合率和体外成球率升高,差异具有统计学意义(P<0.05);与PLB 0 μmol/L组比较,PLB 5、7.5、10 μmol/L组,肝癌HepG2类干细胞克隆形成率、体外成球率和划痕愈合率均降低,EpCAM、BMI1、c-MYC、Oct-4、Nanog干性相关基因及Notch信号通路mRNA的表达水平降低,c-MYC蛋白表达水平降低,差异具有统计学意义(P<0.05).结论:PLB可抑制肝癌HepG2类干细胞增殖、迁移及体外成球能力,从而抑制肝癌细胞干性,其机制可能与下调EpCAM、BMI1、c-MYC、Oct-4、Nanog干性相关基因和Notch信号通路mRNA的表达水平,以及c-MYC蛋白的表达水平有关.

为探明蛇足石杉COBRA基因家族成员分子生物信息学特征及组织表达规律,该文基于蛇足石杉的全长转录组数据,通过生物信息学技术对该家族成员(HsCOBRAs)的理化性质、结构域、保守基序、顺式作用元件、基因表达量等进行分析.结果表明:(1)在蛇足石杉全长转录组中共筛选出 24 个HsCOBRAs家族成员,其中酸性蛋白 9 个,稳定蛋白 11 个,疏水性蛋白 5 个,具有跨膜结构的蛋白 7 个,具有信号肽的蛋白 3个.(2)亚细胞定位在细胞壁、叶绿体、细胞核、细胞膜上.(3)结构分析发现HsCOBRAs有 7 种结构域和 6种保守基序,部分成员具有高度保守的CCVS结构.(4)HsCOBRAs具有CAAT-box、TATA-box等 45 种顺式作用元件.(5)HsCOBRA2 在叶、孢子、茎、芽胞中的表达量均最高.该研究结果可为HsCOBRAs的进一步研究及生物学功能验证等提供理论依据.

1 以下词汇在文中首次出现时可直接用英文或英文缩略词ABC (亲和素-生物素过氧化物酶体系) Akt(蛋白激酶B) Annexin V(膜联蛋白V) BCA (二喹啉甲酸) BCIP(5-溴-4-氯-3-吲哚基磷酸盐) Bcl-2(B 淋巴细胞瘤-2 基因) BrdU(5-溴脱氧尿嘧啶核苷)

遗传性血管性水肿(hereditary angioedema,HAE)是一种罕见的常染色体显性遗传病,以反复发作的皮肤黏膜水肿为特征,按其发病机制可分为C1(complement factor 1,C1)抑制物含量减少或功能缺陷型HAE,近年来发现因血管生成素或激肽原等基因突变导致的C1抑制因子正常型.HAE发作最常累及皮肤、胃肠道及上呼吸道,当出现喉头水肿时可能导致呼吸困难危及生命,因此需要进行预防性治疗.弱雄激素达那唑是长期预防性治疗的主要选择之一[1].

目的 探讨阑尾黏液性肿瘤(appendiceal mucinous neoplasms,AMNs)的临床病理及分子病理特征,比较低级别阑尾黏液性肿瘤(low grade appendiceal mucinous neoplasm,LAMN)与高级别阑尾黏液性肿瘤(high grade appendiceal mucinous neoplasm,HAMN)的差异性.方法 回顾性分析 2015 年 1 月至 2021 年 9 月西南医科大学附属manbet官网登录 确诊的 32 例阑尾黏液性肿瘤(appendiceal mucinous neoplasms,AMNs)患者的临床病理资料,并选择 10 例样本进行高通量测序分析.结果 大部分AMNs患者出现消化道肿瘤标志物阳性.HAMN患者出现远处转移、死亡的比例比LAMN患者高.AMNs突变基因主要为KRAS、GNAS、BRAF.AMNs患者普遍存在MTHFR和NQO1 基因多态性.LAMN和HAMN患者的TMB均较低,两者比较差异无统计学意义(P>0.05).结论 AMNs有特殊的临床病理及分子病理改变,但 HAMN与LAMN之间没有显著性差异.

25岁女性患者,因掌跖角化25年、牙龈及牙周反复炎症20年就诊.皮肤科情况:双侧掌跖轻度角化伴局部脱屑,指端、掌指关节伸侧及足背角化性红斑.口腔科情况:咬合错乱,牙龈增生,牙龈炎及牙周炎.全外显子基因检测到CTSC C.1015C＞T错义纯合突变.诊断:掌跖角化-牙周破坏综合征.患者因口腔病变接受正畸治疗,因掌跖角化症状较轻,未进一步治疗.

目的 基于单细胞测序数据及蛋白质相互作用分析探究B细胞在慢阻肺病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)发病机制中的可能作用.方法 在基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中获取COPD和类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)模型小鼠外周血的单细胞测序数据,通过降维聚类及人工注释的方法筛选出B细胞,采用R软件以差异倍数(fold change,FC)≥1.2 且P<0.05 为条件筛选差异基因,比对COPD和RA模型小鼠数据获得共同差异基因,形成蛋白通路,并利用基因本体论(gene ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和蛋白质互作网络分析对人类COPD肺组织单细胞测序数据进行验证.结果 COPD模型小鼠的B细胞单细胞测序结果显示,与RA模型小鼠B细胞数据共同的差异基因为Cd74(log2 FC=0.26,P<0.001)、Ctla2a(log2 FC=-0.33,P<0.001)、H2-Ab1(log2 FC=0.33,P<0.001)、H2-Aa(log2 FC=0.36,P<0.001)、Rpl14(log2 FC=0.28,P<0.001)、Akap12(log2 FC=-0.58,P<0.001)、H2-Eb1(log2 FC=0.42,P<0.001)、Bcl2(log2 FC=0.29,P<0.001),所形成的蛋白通路涉及MHCⅡ类分子介导的抗原加工和呈递、自身免疫、淋巴细胞活化等.上述差异基因在人类COPD肺组织单细胞测序数据中也表现出趋势相同的差异表达,形成类似蛋白通路,其中Cd74、H2-Aa、H2-Eb1、Bcl2 分别对应人类同源基因 CD74(log2 FC=0.80,P<0.001)、HLA-DQA1(log2 FC=0.84,P<0.001)、HLA-DRB1(log2 FC=0.49,P<0.001)、BCL2(log2 FC=0.40,P=0.034).且与对照组相比,人类COPD肺组织数据中B细胞的占比明显增高.结论 B细胞过度增殖/活化及B细胞抗原提呈作用增强可能导致自身免疫应答,进而参与COPD的发生、发展,并导致肺组织不可逆性的损伤.