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POU3F3对垂体瘤细胞增殖和周期的影响及其作用机制
编辑人员丨12小时前
目的:探讨POU3F3对垂体瘤细胞增殖和周期的影响及其作用机制。方法:选取2016年6月到2019年12月驻马店市中心manbet官网登录 手术切除的150例垂体瘤和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析POU3F3和微小RNA(miRNA,miR)-127-5p表达水平;采用短发卡RNA(shRNA)和过表达技术在RC-4BC垂体瘤细胞中分别敲降POU3F3和过表达miR-127-5p,采用Lipo2000过表达采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和流式细胞术分析POU3F3和miR-127-5p对细胞增殖和周期的影响;采用生物信息学和双荧光素酶报告基因分析POU3F3和miR-127-5p及其靶基因关系;采用蛋白质印迹法(Western blot)分析POU3F3和miR-127-5p对靶基因表达的影响。组间比较采用 t检验。 结果:与癌旁组织中POU3F3表达水平(1.10±0.19)比较,垂体腺癌组织中POU3F3表达水平(2.84±0.22)显著增加,差异有统计学意义。与癌旁组织中miR-127-5p表达水平(1.04±0.15)比较,垂体腺癌组织中miR-127-5p表达水平(0.34±0.11)显著下调,差异有统计学意义。与对照shRNA组细胞G 0/G 1期、S期和G 2/M期[(37.54±3.45)%、(39.10±3.90)%和(20.58±2.87)%]比较,POU3F3 shRNA组细胞G 0/G 1期比例(64.33±6.24)%显著增加,而S期和G 2/M期比例[(20.14±3.01)%和(14.33±2.88)%]显著下调,差异有统计学意义。与对照mimic组细胞G 0/G 1期、S期和G 2/M期[(35.66±4.02)%、(40.89±4.61)%和(25.33±2.19)%]比较,miR-127-5p minic组细胞G 0/G 1期比例显著增加[(59.48±6.14)%],而S期和G 2/M期比例[(24.23±2.71)%和(17.59±1.99)%]显著下调,差异有统计学意义。miR-127-5p与POU3F3存在碱基配对,FOXD1是miR-127-5p靶基因。与对照shRNA组和对照mimic组细胞FOXD1蛋白表达水平(1.16±0.21、0.97±0.14)比较,POU3F3 shRNA组和miR-127-5p mimic组细胞FOXD1蛋白表达水平(0.22±0.15、0.32±0.12)显著下降,差异有统计学意义。 结论:POU3F3通过miR-127-5p/ FOXD1调控垂体腺癌细胞增殖和周期。
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编辑人员丨12小时前
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动态对比增强磁共振成像联合血清微小RNA-486-5p在胰腺癌诊断及手术可切除性评估的应用
编辑人员丨13小时前
目的:探究动态对比增强磁共振成像(DCE-MRI)联合血清微小RNA(miR)-486-5p对胰腺癌诊断及手术可切除性评估价值。方法:选取2019年6月至2023年6月烟台市烟台山manbet官网登录 收治136例胰腺占位患者为研究对象,患者均接受DCE-MRI扫描及血清miR-486-5p检测,以手术病理为诊断金标准,以实际手术切除为手术可切除性标准,通过诊断试验四格表评价DCE-MRI、血清miR-486-5p及两者联合对胰腺癌诊断、手术可切除性评估价值,组间比较采用Mann-Whitney U检验和 χ2检验。 结果:136例患者经病理诊断确诊胰腺癌(胰腺癌组)98例,非胰腺癌(良性病变组)38例。胰腺癌组血清miR-486-5p表达为3.48(1.41~7.64),显著高于良性病变组的1.02(0.36~1.58)( Z=3.162, P<0.05)。DCE-MRI联合血清miR-486-5p诊断胰腺癌的敏感度、特异度、准确度、与病理诊断的一致性Kappa值分别为97.95%(96/98)、81.58%(31/38)、93.38%(127/136)、0.829。98例胰腺癌患者中,最终实际行手术切除35例(可切除组),不可切除63例(不可切除组)。可手术组血清miR-486-5p表达为2.05(1.01~3.72),显著低于不可切除组的4.88(2.95~10.01)( Z=3.882, P<0.05)。DCE-MRI联合血清miR-486-5p预测胰腺癌可切除的敏感度、特异度、准确度、与实际手术切除的一致性Kappa值分别为77.14%(27/35)、100.00%(63/63)、91.84%(90/98)、0.813。 结论:DCE-MRI联合血清miR-486-5p能提高胰腺癌诊断敏感度及准确度,且预测手术可切除性与实际手术切除一致性更高。
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编辑人员丨13小时前
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基于生物信息学筛选结直肠癌关键长链非编码RNA及LINC00174的作用机制
编辑人员丨13小时前
目的:应用生物信息学技术筛选结直肠癌(CRC)关键长链非编码RNA(lncRNA),并对筛选出的LINC00174在CRC中的作用机制进行初步分析。方法:对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中638例CRC和51例癌旁组织的RNA数据分析,应用Wilcoxon检验识别筛选差异表达明显的RNA;Pearson相关性检验确定lncRNA-mRNA关系对;在Starbase v3.0数据库中确定与lncRNA-mRNA关系对中RNA分子存在互作关系的微小RNA(miRNA,miR)。对TCGA数据库中CRC临床数据使用R软件包的"survival"和"survminer"方法进行生存分析,探讨lncRNA-mRNA关系对预测预后的价值。用STRING数据库及metascape平台对mRNA编码蛋白(ZNF692)的功能进行分析。收集40例新鲜的CRC及癌旁组织,应用荧光实时定量PCR(qRT-PCR)对筛选出的RNA检测,验证生物信息学结果。符合正态分布的计量资料采用均数±标准差( ± s)表示,各指标间关系采用 t检验及Person相关分析。 结果:与癌旁组织比较,CRC组织中上调的LncRNA为820,下调的为951;上调的mRNA为1 628,下调为3127。分析后确定2775对候选lncRNA-mRNA,其中501对与患者生存有关。进一步通过功能分析发现LINC00174-ZNF692对可能在CRC进展中有重要作用。结果显示,LINC00174、ZNF692在CRC组织中表达水平(14.52±0.97、17.12±0.72)高于癌旁组织(13.50±0.60、15.53±0.44, W=26 747、31 438, P<0.01);LINC00174与ZNF692呈正相关( r=0.58, P<0.01)。生存分析结果显示,LINC00174-ZNF692对高表达是CRC患者预后差的标志( χ2=5.52, P<0.05),其风险比( HR)为1.51(1.05~2.20)( P<0.05)。对Starbase v3.0数据库分析显示,ZNF692通过海绵吸附miR-200b-3p与LINC00174形成内源性竞争RNA(ceRNA)机制发挥作用。富集分析显示,ZNF692蛋白在泛素介导的蛋白降解、mRNA监控、核苷酸切除修复等过程。组织验证结果显示,LINC00174、ZNF692在CRC水平(2.65±1.23、1.19±0.33)明显高于癌旁组织(0.83±0.39、0.42±0.17, t=8.92、13.12, P<0.01);miR-200b-3p在CRC水平(0.35±0.13)明显低于癌旁组织(0.82±0.22, t=-11.63, P<0.01)。Pearson分析显示,CRC组织中LINC00174与ZNF692呈正相关( r=0.81, P<0.01);LINC00174与miR-200b-3p、ZNF692与miR-200b-3p均呈负相关( r=-0.75、-0.53, P<0.01)。 结论:LINC00174可能通过海绵吸附机制调控miR-200b-3p/ZNF692轴在CRC进展中发挥重要作用。
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编辑人员丨13小时前
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来自人骨髓间充质干细胞低表达微小RNA-127-5p的细胞外囊泡促进激素性股骨头坏死疾病进展
编辑人员丨13小时前
目的:观察激素性股骨头坏死(SONFH)患者来源骨髓间充质干细胞(BMSCs)分泌的低表达微小RNA(miR)-127-5p细胞外囊泡(EVs)对正常BMSCs增殖及成骨分化的影响。方法:骨髓来源于郑州大学第一附属manbet官网登录 10例需行全髋关节置换手术的患者(激素性股骨头坏死5例,非股骨头坏死5例),提取其中的BMSCs进行培养。使用差速离心法分离SONFH-BMSCs-EVs并用蛋白质印迹法(Western blot)和纳米颗粒跟踪分析(NTA)鉴定。将正常BMSCs中加入SONFH-BMSCs-EVs作为实验组,对照组加入等量磷酸盐缓冲液(PBS),用噻唑蓝(MTT)法检测SONFH-BMSCs-EVs对BMSCs的增殖的影响。分别取两组第3代BMSCs,提取总RNA,使用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)检测miR-127-5p的表达差异。取第3代BMSCs进行成骨诱导,诱导过程中加入miR-127-5p mimic、miR-127-5p NC,分别用茜素红染色、MTT法、半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶(Caspase)-3/7活性细胞凋亡检测,来检验miR-127-5p对BMSCs增殖及成骨分化的影响。采用单因素方差分析和 t检验进行统计学分析。 结果:SONFH-BMSCs-EVs为大小不均的圆形膜性囊泡,粒径范围在40~200 nm之间且表达CD63、CD9标志蛋白。共聚焦显微镜下显示EVs可以被BMSC摄取。MTT法显示实验组(0.98±0.20)增殖活性低于对照组(0.40±0.13, t=5.39, P<0.01)。RT-PCR显示实验组miR-127-5p的相关表达(1.03±0.21)明显低于对照组(0.58±0.12, t=4.05, P<0.01)。茜素红染色显示SONFH+miR-127-5p mimic(Smm)组成骨分化染出红色的阳性率远远高于SONFH(S)组。MTT法和Caspase-3/7活性细胞凋亡检测显示Smm组相较于S组,促进增殖(Smm组1.51±0.18,S组1.09±0.17, t=3.84, P<0.01),减少凋亡(Smm组0.59±0.12,S组1.02±0.12, t=5.56, P<0.01)。 结论:SONFH患者来源的BMSCs分泌的低表达miR-127-5p EVs可以抑制正常BMSCs增殖及成骨分化。
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编辑人员丨13小时前
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重症肺炎患儿血清miR-221和miR-127的表达水平及临床意义
编辑人员丨13小时前
目的:分析重症肺炎患儿血清微小RNA-221(miR-221)和微小RNA-127(miR-127)的表达及其临床意义。方法:前瞻性选取2017年1月至2019年12月期间于河北省邯郸市中心manbet官网登录 就诊的重症肺炎患儿151例作为重症肺炎组,根据在院期间患儿预后分为死亡组(16例)和存活组(135例),另选取同期在本院进行健康查体的健康儿童80例作为正常对照组。使用微阵列分析重症肺炎组和正常对照组中的miRNAs表达,选择上调或下调(选择依据为差异表达变化≥2倍阈值和 P<0.05)最显著的miRNAs。检测入组对象血清miR-221、miR-127及炎症因子[C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-8(IL-8)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)]水平,分析重症肺炎组血清miR-221和miR-127与上述炎症指标的相关性,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析miR-221和miR-127对重症肺炎的诊断及预后预测的价值。 结果:重症肺炎组患儿血清miR-221和miR-127水平低于正常对照组,而CRP、PCT、IL-6、IL-8、TNF-α水平高于正常对照组(均 P<0.05)。血清miR-221与CRP、PCT、TNF-α呈负相关(均 P<0.05),血清miR-127与CRP、PCT、IL-6、IL-8呈负相关(均 P<0.05)。死亡组患儿血清miR-221、miR-127水平均低于存活组(均 P<0.05)。miR-221、miR-127联合诊断重症肺炎的曲线下面积(AUC)为0.871,联合预测重症肺炎患儿预后的AUC为0.851。 结论:重症肺炎患儿血清miR-221和miR-127水平降低,与部分炎症因子水平呈负相关,二者联合检测对重症肺炎的诊断及预后预测具有较高的临床价值。
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编辑人员丨13小时前
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多囊卵巢综合征的circRNA-miRNA-mRNA调控网络生物信息学分析及其验证
编辑人员丨13小时前
目的:通过构建多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)患者卵丘颗粒细胞的环状RNA(circular RNA,circRNA)-微小RNA(microRNA,miRNA)-信使RNA(messenger RNA,mRNA)调控网络,并进行临床标本验证,以探寻PCOS发病机制并提供诊疗靶点。方法:使用R软件分析来自基因表达图谱(gene expression omnibus,GEO)数据库的数据,得到差异表达的circRNA、miRNA、mRNA;使用CircInteractome、Starbase数据库,预测构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。回顾性研究收集2018年1月至2018年12月期间于郑州大学第二附属manbet官网登录 生殖医学部就诊的PCOS患者(记为PCOS组, n=40)和因男方或者输卵管因素治疗的患者(记为对照组, n=20)的卵丘颗粒细胞,提取RNA后进行实时荧光定量PCR(real time quantitative PCR,RT-qPCR)验证。 结果:筛选出278个差异表达mRNA、23个差异miRNA和2402个差异circRNA( P<0.05和 |log 2FC|>0.8);构建256条circRNA-miRNA-mRNA调控网络,包含13个mRNA、2个miRNA和40个circRNA;临床验证后提示,妊娠相关血浆蛋白A(pregnancy-associated plasma protein A,PAPPA)、hsa-miR-127-3p、hsa_circ_0086809/hsa_circ_0063556及其调控网络与PCOS相关( P=0.004、 P=0.002、 P=0.014、 P=0.003)。 结论:卵丘颗粒细胞中PAPPA 、hsa-miR-127-3p 、hsa_circ _0086809/hsa_circ _0063556的表达水平及其调控网络与PCOS发生相关。
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编辑人员丨13小时前
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基于癌症基因组图谱数据库肺腺癌预后风险模型的建立
编辑人员丨13小时前
目的:构建基于微小RNA(miRNA,miR)表达量的肺腺癌预后列线图风险模型,研究其对肺腺癌患者生存的预测价值。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载获取肺腺癌miRNA表达数据,包括miRNAseq和临床数据。应用R 3.6.2软件中的edgeR包筛选肺腺癌组织和正常肺组织的差异基因,以│logFC│>2, P<0.05为筛选条件。应用单因素回归分析、LASSO回归分析、多因素Cox回归分析筛选与预后明显相关的miRNAs,建立风险评分(risk score)方程,构建列线图模型。应用内部验证法和图像校准法、受试者工作特征曲线(ROC)评价模型的特异性和敏感性。通过风险评分及生存曲线对患者进行生存分析。分析miRNAs在各种族表达差异。 结果:识别127个差异miRNA,下调16个,上调111个。单因素回归分析得到14个与预后相关的miRNAs,LASSO回归分析得到13个与预后相关的miRNAs( P<0.05)。多因素回归分析结果显示hsa-miR-1293、hsa-miR-450a-1、hsa-miR-5571、hsa-miR-3189、hsa-miR-490、hsa-miR-142、hsa-miR-31、hsa-miR-548v是显著的预测因素( P<0.05)。应用这8个miRNA构建列线图模型,Concordance值(0.701)及图像校准显示该列线图预测能力较好。1、3、5年曲线下面积(AUC)为0.721、0.748、0.733。生存分析结果显示高风险组较低风险组生存率低( P<0.05),随着风险评分数值的升高,死亡人数增多。KM生存曲线显示hsa-miR-1293、hsa-miR-5571、hsa-miR-490、hsa-miR-142、hsa-miR-31、hsa-miR-548v与肺腺癌生存预后相关( P<0.05)。另外这8个miRNAs表达种族差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:成功构建基于miRNAs表达预测肺腺癌预后的列线图模型,其预测准确性较高。
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编辑人员丨13小时前
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环状RNA PLCE1靶向作用于微小RNA-127-5p/热休克蛋白70信号轴对结直肠癌细胞化疗耐药的影响
编辑人员丨14小时前
目的:观察结直肠癌细胞中环状RNA PLCE1(circPLCE1)靶向作用于微小RNA(miR)-127-5p/热休克蛋白(HSP)70对细胞5-氟尿嘧啶(5-Fu)/奥沙利铂(OXA)化疗耐药的影响。方法:选取108例结直肠癌组织标本作为研究对象。采用定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)分析癌组织中circPLCE1的表达水平与临床病理特征及化疗耐药的关系;培养耐药的结直肠癌细胞SW480/R和HCT116/R,分别敲低/过表达circPLCE1,利用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)和流式细胞法观察两者对细胞化疗耐药的影响;利用转录组测序及蛋白质印迹法(Western blot)分析circPLCE1表达水平与结直肠癌细胞凋亡通路的关系;利用双荧光素酶报告基因实验及Western blot分析circPLCE1和miR-127-5p的关系及miR-127-5p的下游靶基因。计数资料比较采用 χ2检验,计量数据比较采用 t检验。 结果:qRT-PCR实验结果显示,circPLCE1表达量与患者淋巴结转移、远处转移、TNM分期(Ⅲ+Ⅳ期)和CapeOX方案化疗耐药相关(51.9%比25.9%、14.8%比3.7%、53.7%比25.9%、37.5%比12.5%, χ2=7.636、3.967、8.694、5.333, P<0.05)。在SW480/R和HCT116/R细胞中敲低circPLCE1表达后行细胞耐药实验,结果显示细胞活力下降,凋亡水平升高(2.66±0.12比4.85±0.12、3.47±0.24比5.82±0.41, t=13.410、4.912, P<0.05);过表达circPLCE1后行细胞耐药实验,结果显示细胞活力升高,凋亡水平下降(8.69±0.29比2.58±0.12、5.19±0.12比2.80±0.07, t=19.580、17.020, P<0.05)。蛋白印迹实验表明在SW480/R细胞中敲低circPLCE1表达后B细胞淋巴瘤/白血病-2(bcl-2)/bcl-2相关X蛋白(bax)比值、半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶(Caspase)-3蛋白表达水平升高(1.00±0.03比2.18±0.11、1.00±0.05比1.38±0.08, t=9.970、4.250, P<0.05),过表达circPLCE1后bcl-2/bax比值、Caspase-3蛋白表达水平降低(1.00±0.05比0.42±0.02、1.00±0.03比0.71±0.03, t=10.340、6.330, P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验结果表明miR-127-5p靶向circPLCE1(1.00±0.03比0.57±0.02, t=12.082, P<0.05)和HSP70的3’端非编码区(3’UTR)(1.00±0.03比0.66±0.04, t=6.438, P<0.05)。在SW480和HCT116细胞中,敲低circPLCE1表达后HSP70蛋白表达降低(1.00比0.61±0.03、1.00比0.60±0.05, t=12.130、8.729, P<0.05),过表达circPLCE1后HSP70蛋白表达升高(1.00比1.92±0.06、1.00比1.35±0.09, t=15.580、4.068, P<0.05)。 结论:circPLCE1可通过靶向作用于miR-127-5p/HSP70信号轴调控结直肠癌细胞5-Fu/OXA化疗耐药。
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编辑人员丨14小时前
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基于测序的肝细胞癌血浆外泌体微小RNA-1248的差异表达及功能分析
编辑人员丨14小时前
目的:筛选血浆外泌体微小核糖核苷酸(microRNA)作为肝细胞癌(HCC)的诊断标志物,并分析候选miRNA在HCC进展中可能发挥的作用。方法:2018年10月至2019年2月收集12例于广州市第一人民manbet官网登录 初诊为"HCC"的患者及12例健康志愿者血浆样本,利用超速离心法收集血浆外泌体,经动态光散射法及蛋白质免疫印迹法鉴定后,提取RNA进行测序。通过定量聚合酶链反应(qPCR)验证候选外泌体miRNA差异表达量,使用 t检验分析各miRNA表达量差异。通过生物信息学方法预测候选miRNA的靶基因及可能调控的通路,分析其在HCC进展过程中发挥的作用,组间比较采用 t检验。 结果:以差异表达倍数2倍以上(Fold change>2.0或<0.5,且 P<0.05)作为标准,分别比较HCC患者术前、术后及健康志愿者血浆外泌体miRNA的差异表达结果,结合两次结果,筛选表达同时上/下调miRNA共12个。其中,表达上调6个(miR-2115-3p、miR-214-3p、miR-511-5p、miR-1299、miR-10a-5p、miR-375-3p),表达下调6个(miR-219a-2-3p、miR-127-3p、miR-9-5p、miR-383-5p、miR-212-5p、miR-1248)。qPCR验证候选miRNA在HCC患者及健康志愿者血浆外泌体中的表达差异,HCC组miR-1248表达低于健康志愿者组(9.046 ΔCt比7.597 ΔCt, t=2.849, P<0.05)。 结论:血浆外泌体miR-1248有作为HCC的诊断标志物的潜力。血浆外泌体miR-1248可通过调控受体细胞的细胞外基质受体相互作用、介导代谢重编程抑制HCC进展。
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编辑人员丨14小时前
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微小RNA-30a-5p激活Wnt/β-连环蛋白信号通路对胃癌细胞增殖与侵袭的作用机制
编辑人员丨14小时前
目的:探讨人微小RNA(has-miR)-30a-5p调控Wnt/β-连环蛋白(β-catenin)信号通路对胃癌细胞增殖及侵袭的影响及其作用机制。方法:体外培养胃癌MKN-45细胞;在所研究胃癌细胞系中使用小干扰RNA(siRNA)转染建立miR-30a-5p的敲除和过表达模型,胃癌MKN-45细胞分为3组:miR-30a-5p小干扰RNA(miR-30a-5p inhibitor)组,miR-30a-5p过表达RNA组和空白对照组(NC),荧光定量聚合酶链反应(qPCR)和蛋白质印迹法(Western blot)检测Wnt/β-catenin信号通路相关标志物Cyclin D1(CCND1)基因的表达水平;双荧光素酶报告基因实验验证miR-30a-5p与Wnt信号通路下游关键基因CCND1的靶向调节关系;在培养的胃癌细胞MKN-45中加入Wnt/β-catenin信号通路抑制剂-银杏双黄酮,分为miR-30a-5p inhibitor组、miR-30a-5p inhibitor+银杏双黄酮组、miR-30a-5p Inhibitor NC组及miR-30a-5p Inhibitor NC+银杏双黄酮组,应用细胞计数试剂盒(CCK-8)实验验证各组细胞的增殖能力,细胞迁移实验(Transwell)验证各组细胞的侵袭能力。各组间比较采用 t检验。 结果:qPCR实验结果显示过表达miR-30a-5p能够显著抑制CCND1在mRNA的表达(0.58±0.05, t=11.39, P<0.01),Western blot实验结果显示,CCND1蛋白水平,miR-30a-5p inhibitor组较NC组明显上升(284 437±2 127比215 273±4 097, t=25.95, P<0.01),miR-30a-5p mimics组较NC组明显下降(85 586±309比197 661±948, t=194.70, P<0.01);双荧光素酶实验结果显示过表达miR-30a-5p后野生组中WNT信号通路活性较对照组显著降低(0.39±0.03, t=13.96, P<0.01);CCK-8结果显示2 d后miR-30a-5p inhibitor+银杏双黄酮组细胞抑制率明显高于miR-30a-5p inhibitor组[(93.09±4.18)%比(146.42±5.80)%, t=12.92, P<0.01];miR-30a-5p Inhibitor NC+银杏双黄酮组细胞抑制率明显高于miR-30a-5p Inhibitor NC组[(53.80±3.54)%比(100.00±2.18)%, t=19.25, P<0.01]。Transwell结果显示miR-30a-5p inhibitor+银杏双黄酮组穿膜细胞量明显低于miR-30a-5p inhibitor组[(63.67±9.61)个比(100.00±10.44)个, t=4.44, P<0.05];miR-30a-5p Inhibitor NC+银杏双黄酮组穿膜细胞量明显低于miR-30a-5p Inhibitor NC组[(19.33±6.66)个比(45.00±4.58)个, t=5.50, P<0.01]。 结论:miR-30a-5p可以调控Wnt/β-catenin信号通路,过表达miR-30a-5p后可抑制Wnt/β-catenin信号通路降低胃癌细胞中Cyclin D1(CCND1)的表达,进一步影响胃癌的增殖与侵袭。
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编辑人员丨14小时前