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基于microRNA表达的多囊卵巢综合征患者痰湿证生物标志物的初筛
编辑人员丨18小时前
目的:探索多囊卵巢综合征(PCOS)患者痰湿证的特征性生物标志物,为中医证候诊断的标准化提供理论依据。方法:采用队列研究的方法,收集2018年1月至2019年1月期间在山东中医药大学附属manbet官网登录 行体外受精(IVF)助孕治疗,年龄在20~37岁之间的不孕症患者。将患者分为对照组(A组,20例)、PCOS痰湿组(B组,20例)、PCOS非痰湿组(C组,20例)。采用qRT-PCR法检测3组患者血清、卵泡液、颗粒细胞中miR-183/200/223的表达水平,并用相关性分析评价其与痰湿证的关系。结果:血清中miR-223-3p在B组的相对表达量高于A组和C组,差异均有统计学意义( P均<0.001),并与胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)呈正相关( r=0.595, P=0.04)。卵泡液中miR-223-3p在B组的相对表达量高于A组( P<0.001)及C组( P=0.002),差异均有统计学意义。颗粒细胞中miR-183-5p在B组的相对表达量均高于A组( P=0.004)和C组( P=0.012),差异均有统计学意义,并与HOMA-IR呈正相关( r=0.732, P=0.007);miR-200c-3p在B组的相对表达高于A组( P=0.002)和C组( P=0.001),差异均有统计学意义,并与HOMA-IR呈正相关( r=0.704, P=0.016);miR-223-3p在B组的相对表达量高于A组( P<0.001),在C组的相对表达量也高于A组( P=0.005),差异均有统计学意义,且在B组的相对表达量与HOMA-IR呈正相关( r=0.547, P=0.042); miR-223-5p在B组的相对表达量明显低于A组( P=0.001),在C组的相对表达量也低于A组( P<0.001),差异均有统计学意义,且B组的相对表达量与HOMA-IR呈负相关( r=-0.671, P=0.024)。 结论:PCOS痰湿证有明显的胰岛素抵抗特征,microRNA在PCOS痰湿证患者体内表达存在显著性差异。miR-183-5p、miR-200c-3p与miR-223-5p可能成为诊断PCOS痰湿证卵巢局部的特异性生物标志物。
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编辑人员丨18小时前
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外泌体微小RNA-183-5p诱导淋巴管生成促进肺腺癌转移
编辑人员丨19小时前
目的:探讨外泌体微小RNA(miR)-183-5p在肺腺癌(LUAD)中作用。方法:通过定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)验证LUAD患者外周血miR-183-5p的表达,通过5-乙炔基-2’-脱氧尿苷(EdU)增殖、侵袭试验和淋巴管形成试验探讨其在LUAD中的作用。利用生物信息学预测和荧光素酶报告基因实验,确定miR-183-5p的靶基因。采用 t检验或单因素方差分析进行统计分析。 结果:miR-183-5p在LUAD患者血浆表达高于健康组(2.746±1.111比1.346±0.474, t=8.195, P<0.05),且在淋巴结(LN)转移中表达高于LN阴性者(3.503±1.304比2.320±0.706, t=4.174, P<0.05),在LUAD血浆外泌体中表达也高于健康组(2.071±0.931比0.830±0.633, t=6.039, P<0.05)。EdU增殖实验表明miR-183-5p mimic及其对照组和miR-183-5p inhibitor及其对照组个数分别为83.000±4.000、55.670±5.508、25.330±5.508、50.330±5.132,差异有统计学意义( F=65.180, P<0.05),4组中淋巴管形成实验结果分别为1.400±0.141、0.983±0.080、0.733±0.103、1.006±0.030,差异有统计学意义( F=24.150, P<0.05),Transwell各组穿膜细胞数分别为84.000±6.557、53.000±4.000、40.670±6.429、59.000±7.000,差异有统计学意义( F=26.710, P<0.05)。C端小磷酸酶类似物(CTDSPL)是miR-183-5p的靶点,上调或下调人淋巴内皮细胞(HLEC)中miR-183-5p,CTDSPL的表达呈相反改变(1.010±0.076比0.383±0.025,1.540±0.098比0.983±0.071, F=127.300, P<0.05)。 结论:外泌体miR-183-5p在LUAD癌组织和血浆中均高表达,并可能通过靶向CTDSPL诱导淋巴管生成,可能成为LUAD的标志物。
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编辑人员丨19小时前
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胃癌相关的竞争内源性RNA调控网络的构建和分析
编辑人员丨19小时前
目的:构建胃癌相关竞争内源性RNA(ceRNA)网络,探索胃癌发生、发展的分子机制。方法:应用生物芯片技术测定胃癌及对应癌旁组织的信使RNA(mRNA)、微小RNA(miRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)表达谱,应用R软件中的edgeR包筛选差异表达基因并绘制火山图,基于miRNA-lncRNA在线预测工具lncBase数据库和miRNA靶基因预测数据库预测mRNA、miRNA和lncRNA的相互作用关系,采用Cytoscape软件构建胃癌lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,根据cytohubba计算各节点degree得分筛选关键基因(hub基因)。运用注释、可视化和集成发现数据库(DAVID),对差异表达的mRNA进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。在OncoLnc数据库中,选择肿瘤基因组计划(TCGA)数据集的胃癌项目,输入hub基因,以标准化后基因表达量中位数为界值,将样本分为高表达组和低表达组,并进行生存分析。结果:共筛出差异表达的mRNA 766个,miRNA 10个,lncRNA 110个,其中90个mRNA、6个miRNA和4个lncRNA构成ceRNA网络,20个hub基因中有2个与患者预后有关。经TCGA胃癌数据库验证,LncRNA MAP3K20的反义RNA 1(MLK7-AS1)、分泌性磷酸化糖蛋白(SPP1)、硫酸酯酶1(SULF1)hsa-miR-1307-3p等基因在胃癌组织生物芯片中高表达,金属硫蛋白2A(MT2A)、金属硫蛋白1X(MT1X)等基因低表达,与TCGA胃癌数据库一致。生物学功能和通路分析显示,差异表达的mRNA主要在生物学过程(BP)和矿物吸收的通路中显著富集。在TCGA胃癌数据中,碳水化合物磺基转移酶1(CHST1)和miR-183-5p均与患者生存时间有关,CHST1表达量越高患者生存时间越短,而miR-183-5p表达量越高患者生存时间越长。结论:胃癌ceRNA网络的构建有助于深入了解胃癌的分子生物学机制,CHST1和mi-183-5p可作为胃癌预后的预测指标。
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编辑人员丨19小时前
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人类微小RNA-92a-2-5p调控HEATR1基因对胃癌细胞的生物学功能
编辑人员丨20小时前
目的:阐明人类微小RNA(hsa-miR)-92a-2-5p可通过抑制HEATR1基因对胃癌细胞生物学作用。方法:采用在线生物信息学工具(Target Scan)以及文献调研进行统计筛选,选择结合较好的5种微小RNA(miRNA):hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-20a-2-3p、hsa-miR-183-5p、hsa-miR-506-3p和hsa-miR-556,通过蛋白质印迹法(Western blot)对5种miRNAs在两种胃癌细胞株(AGS、MGC803)检测目的基因的蛋白的表达变化。使用细胞计数试剂盒(CCK-8)实验、PI-FACS细胞周期实验、克隆形成实验检测细胞增殖情况、流式细胞仪检测细胞凋亡、迁移及侵袭实验检测细胞的迁移、侵袭能力,组间比较采用 t检验。 结果:hsa-miR-92a-2-5p被证明与HEATR1存在较好的调控关系。过表达hsa-miR-92a-2-5p后,AGS、MGC803细胞中转染组克隆形成能力低于阴性对照组(83.000±2.646比150.667±7.638, t=14.500, P<0.01;264.667±9.713比288.333±6.658, t=3.481, P<0.05)。在培养96 h及120 h后,CCK-8实验显示转染组增殖能力低于阴性对照组,AGS细胞(0.380±0.032比0.612±0.019, t=10.621, P<0.01;0.912±0.093比1.590±0.008, t=12.585, P<0.01),MGC803细胞(0.588±0.042比0.967±0.025, t=13.691, P<0.01;1.052±0.028比1.559±0.013, t=28.550, P<0.01)。细胞凋亡实验显示,AGS、MGC803细胞细胞中转染组凋亡率高于阴性对照组(12.667±0.950比5.727±0.482, t=11.279, P<0.01;16.133±2.937比5.560±1.361, t=5.658, P<0.01)。AGS和MGC803细胞侵袭、转移能力转染组均低于阴性对照组,AGS细胞中(360.000±7.937比550.667±10.017, t=25.840, P<0.01;265.333±12.503比455.667±9.292, t=21.163, P<0.01),MGC803细胞中(139.667±6.110比241.000±5.568, t=21.232, P<0.01;61.333±9.292比218.333±4.619, t=26.207, P<0.01)。 结论:hsa-miR-92a-2-5p可以敲减HEATR1基因的表达,抑制胃癌细胞增殖、侵袭、转移,并促进胃癌细胞的凋亡。
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编辑人员丨20小时前
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miR-122-5p和miR-183-5p在脑出血患者中的表达水平及其与神经损伤的相关性
编辑人员丨3周前
目的 分析脑出血患者神经损伤的影响因素和微小RNA-122-5p(miR-122-5p)、微小RNA-183-5p(miR-183-5p)血清水平对患者神经损伤的诊断价值,探讨二者水平与患者神经损伤的关系.方法 选取2021年6月至2023年7月于绵阳市中心manbet官网登录 住院治疗的146例脑出血患者作为研究对象,依据美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)将患者分为轻度损伤组(85例)和中重度损伤组(61例).实时荧光定量PCR检测两组患者血清miR-122-5p、miR-183-5p水平;比较两组患者的一般临床资料和血清水平;分析患者血清miR-122-5p、miR-183-5p水平与神经损伤之间的相关性;多因素Logistic回归分析脑出血患者神经损伤程度的影响因素,并分析血清miR-122-5p、miR-183-5p水平对患者神经损伤程度的诊断价值.结果 中重度损伤组患者NIHSS评分和血清miR-122-5p水平均高于轻度损伤组,血清miR-183-5p水平则低于轻度损伤组.miR-122-5p与miR-183-5p水平之间、miR-183-5p水平与NIHSS评分之间均呈负相关;miR-122-5p水平与NIHSS评分呈正相关.多因素Logistic回归分析表明,血肿体积、NIHSS评分、血清miR-122-5p水平为脑出血患者中重度神经损伤的危险因素,miR-183-5p血清水平为其保护因素.ROC曲线分析表明,miR-122-5p和miR-183-5p血清水平可作为脑出血患者中重度神经损伤程度的诊断指标,联合诊断的ROC曲线下面积(AUC)和Youden指数更高.结论 脑出血患者的血清miR-122-5p、miR-183-5p水平与神经损伤密切相关,二者联合检测对脑出血患者神经损伤具有较高的临床诊断价值.
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编辑人员丨3周前
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血清miR-183-5p和miR-339-3p水平与急性胰腺炎患者严重程度及预后的关系
编辑人员丨1个月前
目的 探讨血清微小RNA-183-5p(miR-183-5p)和微小RNA-339-3p(miR-339-3p)水平与急性胰腺炎(AP)患者严重程度及预后的关系.方法 收集2021年7月至2023年7月该院收治的175例AP患者作为AP组,根据急性生理学与慢性健康状况评价Ⅱ(APACHE Ⅱ)评分将AP患者分为轻症组108例和重症组67例,根据预后情况,分为预后良好组114例和预后不良组61例,另选取同期于该院体检的体检健康者160例作为对照组.采用实时荧光定量PCR法检测血清miR-183-5p、miR-339-3p水平,酶联免疫吸附试验测定肿瘤坏死因子(TNF)-α、C反应蛋白(CRP)水平,Pearson相关分析 AP患者血清miR-183-5p、miR-339-3p水平与TNF-α、CRP及APACHEⅡ评分的相关性,多因素Logistic回归分析AP患者预后不良的影响因素,受试者工作特征(ROC)曲线分析血清miR-183-5p、miR-339-3p水平对预后不良发生的预测价值.结果 与对照组比较,AP组miR-183-5p水平升高,miR-339-3p水平降低,差异有统计学意义(t=17.497、19.113,均P<0.05).与轻症组比较,重症组血清miR-183-5p、TNF-α、CRP、APACHE Ⅱ评分升高,miR-339-3p水平降低(t=10.582、5.972、11.991、13.864、2.224,均 P<0.05).AP 患者血清 miR-183-5p 水平与 TNF-α,CRP,A-PACHE Ⅱ 评分呈正相关(r=0.623、0.570、0.679,均 P<0.05);miR-339-3p 水平与 TNF-α、CRP、APACHEⅡ评分呈负相关(r=-0.655、-0.600、-0.756,均P<0.05).预后不良组血清miR-183-5p水平高于预后良好组,miR-339-3p水平低于预后良好组,差异有统计学意义(t=5.324、5.436,均P<0.05).TNF-α、CRP、A-PACHE Ⅱ评分、miR-183-5p是AP患者发生预后不良的独立危险因素,miR-339-3p是预后不良的保护因素(均P<0.05).miR-183-5p、miR-339-3p水平和二者联合预测AP患者预后不良的曲线下面积分别为0.760、0.731、0.836,二者联合预测价值高于单独预测(Z=2.952、2.892,均P<0.05).结论 AP患者血清中miR-183-5p水平升高,miR-339-3p水平降低,二者与患者病情程度和预后密切相关,可能作为AP病情和预后评估的标志物.
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编辑人员丨1个月前
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结肠癌组织中miR-183-5p和THEM4的表达水平及临床意义
编辑人员丨2024/3/16
目的:研究结肠癌组织中微小RNA-183-5p(miR-183-5p)和硫酯酶超家族成员4(THEM4)的表达水平及其临床意义.方法:收集河北中石油中心manbet官网登录 96例结肠癌患者为研究对象,在进行根治切除术过程中收集患者结肠癌组织及癌旁正常组织.检测结肠癌组织及癌旁正常组织中miR-183-5p和THEM4 mRNA的相对表达水平.分析两者的相关性及其与预后的关系.Cox回归分析影响结肠癌患者预后的危险因素.结果:与癌旁正常组织相比,结肠癌组织中miR-183-5p表达水平升高(P<0.05),THEM4 mRNA表达水平降低(P<0.05).结肠癌组织中miR-183-5p与THEM4 mRNA表达呈负相关(r=-0.529,P<0.05).miR-183-5p高表达组生存率低于低表达组(P<0.05),THEM4高表达组生存率显著高于低表达组(P<0.05).TNM分期(Ⅲ~Ⅳ)、miR-183-5p高表达、THEM4低表达是结肠癌患者不良预后的危险因素(P<0.05).结论:结肠癌织中miR-183-5p表达水平升高,THEM4表达水平降低,两者均与患者临床病理特征及预后密切相关.
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编辑人员丨2024/3/16
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甲状腺相关性眼病表观遗传学的研究进展
编辑人员丨2023/12/16
甲状腺相关性眼病(TAO)的发生与发展及其表观遗传的关系密切。其中,TAO的发生与脱氧核糖核酸甲基化所引起的差异基因表达、非编码核糖核酸(RNA)调控及微小RNA(miRNA)相关。miRNA-155和miRNA-146a通过参与免疫炎症及脂肪组织的增殖分化等参与TAO的病理过程;miRNA-21的表达与TAO的活动性及严重程度相关;miRNA-130a和miRNA-27在TAO眼眶成纤维细胞的成脂分化及脂肪组织增生中发挥着重要作用;miRNA-199a-3p和miRNA-199a-5p可增加患者眼眶脂肪组织的氧化应激和血管生成;TAO患者的miRNA-183和miRNA-96在外周血分化簇(CD)4+T细胞中表达升高,参与TAO病程的调节免疫;miRNA-29可通过抑制转化生长因子β1信号通路抑制细胞纤维化;miRNA-143可通过直接靶向胰岛素样生长因子-1受体,间接降低促甲状腺素受体和核苷酸结合寡聚域样受体热蛋白结构域相关蛋白3浓度,调节TAO的炎症反应。此外,长链非编码RNA、环状RNA、转运RNA衍生片段及组蛋白修饰的表观遗传调控亦与TAO的发病相关。
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编辑人员丨2023/12/16
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微小RNA与他克莫司治疗相关性的研究进展
编辑人员丨2023/10/21
他克莫司治疗窗窄,个体间的药动学/药效学差异较大.以往研究表明临床指标和遗传因素可能是影响他克莫司剂量选择的重要因素,但这对个体差异的解释仍有限.近年来,微小RNA(miRNA)作为一种潜在的生物标志物和特异性治疗靶点受到广泛关注,该文汇总分析了与他克莫司代谢相关的miRNA研究进展,期望能够为该药临床个体化用药研究提供新的思路.目前关于miRNA与他克莫司相关性的研究,以miRNA对CYP3A5的影响居多,涉及miR-29a-3p、miR-99a-5p、miR-532-5p、miR-500a-5p等;与CYP3A4表达相关进而影响他克莫司药动学的miRNA,如miRNA-627-5p;作用于钙调磷酸酶进而影响他克莫司体内作用的miRNA,如miR-582-5p;肾移植患者尿液外泌体中与他克莫司剂量呈正相关的miRNA,如miR-155-5p和miR-223-3p,但这两种miRNA通过何种途径影响他克莫司浓度尚未阐明;可能与他克莫司体内不良反应相关的miRNA,如 miR-26b、miR-145、miR-183、miR-21-5p,miR-199a-5p 和 miR-214-3p、miR33a 有关.研究提示,miRNAs 能够在预测他克莫司疗效和不良反应方面提供新的生物标志物和干预靶点.
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编辑人员丨2023/10/21
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Luminex技术筛选胃癌复发外周血微小RNA指纹图谱
编辑人员丨2023/8/6
目的 应用Luminex技术筛选胃癌复发外周血微小RNA(miRNA,miR)指纹图谱.方法 选取胃癌复发和未复发患者各100例及对照健康人100例,应用Luminex技术筛选外周血中5种miRNAs表达,另外选择50例胃癌患者动态观察血清miRNAs表达变化,筛选胃癌复发外周血microRNAs分子组合.结果 miR-10b、miR-21、miR-183、miR-371-5p、miR-378 5种miRNAs在胃癌患者术前血清中的表达显著高于健康对照组,其在胃癌组和健康对照组表达中位数分别为:miR-10b(8.25比3.25)、miR-21(11.18比3.25)、miR-183(22.86比4.13)、miR-371-5p(13.57比3.37)、miR-378(18.19比3.99),均P=0.000.术后血清miR-10b在早期胃癌复发组与未复发组比较上调不明显(7.41比7.33,P=0.336).50例动态观察的患者中,复发组术后血清miR-21、miR-371-5p、miR-378、miR-183均显著下调,复发后,血清miR-21、miR-3716p、miR-378显著上调,但miR-183上调不显著(复发组比未复发组中位数分别为1.99、1.14),提示miR-183可以从组合中剔除.结论 筛选出miR-21、miR-371-5p、miR-378 3种miRNAs分子组合作为胃癌复发外周血microRNAs指纹图谱,能够早期预测胃癌复发.
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编辑人员丨2023/8/6