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一起由空肠弯曲菌引起的食源性疾病事件调查
编辑人员丨1周前
目的:调查2019年舟山市某学校发生的一起食源性疾病事件原因,为今后预防控制食源性疾病事件提供参考。方法:开展病例搜索、个案调查和现场卫生学调查,采集10份病例、5份食堂工作人员和4份食物市场来源样本开展空肠弯曲菌及其他病原体检测,采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法进行细菌分子分型。开展病例-对照研究,分析可疑餐次和可疑食物。结果:本次疫情共搜索到疑似病例41例,其中男生27例(30.34%),女生14例(29.79%),年龄为(14.56±2.48)岁。临床症状主要表现为腹泻39例(95.12%)和腹痛32例(78.05%)和发热29例(70.73%)。实验室检测结果显示,5份病例粪便样本、1份食堂工作人员肛拭子样本、2份市售三黄鸡食物原材料样本均培养出空肠弯曲菌。PFGE结果显示,5份病例样本中的空肠弯曲菌具有同源性,与1份食堂人员和2份市售三黄鸡样本中的空肠弯曲菌不具有同源性。病例对照分析显示7日午餐E套餐( OR=3.275,95% CI:1.043~10.285)和9日午餐F套餐( OR=12.804,95% CI:4.224~38.812)为可疑暴露餐次。 结论:这是一起因空肠弯曲菌污染食物引起的食源性疾病事件,今后应加强对空肠弯曲菌的食品安全风险监测。
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编辑人员丨1周前
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胎儿弯曲菌龟亚种中国分离株的种群结构、毒力基因及耐药性分析
编辑人员丨1周前
目的:了解胎儿弯曲菌龟亚种( Campylobacter fetus subsp. testudinum, Cft)的分子流行病学特征。 方法:对本实验室2010—2022年收集的15株胎儿弯曲菌龟亚种进行全基因组测序,结合GenBank公布的全球 Cft基因组数据进行流行病学分析;MLST-GrapeTree分析 Cft的群体遗传结构;核心基因组单核苷酸多态性位点(cgSNP)构建 Cft的系统发育树,rhierBAPS确定其种群结构;CARD、ResFinder及VFDB注释 Cft的耐药及毒力基因; E-test法进行药敏试验,并参考CLSI-M45空肠/大肠弯曲菌药敏标准进行结果解释。 结果:基于基因组平均核苷酸一致性(ANI)分析,共纳入全球41株 Cft基因组信息,其中人类来源24株,动物来源13株,未知来源4株。流行病学资料显示,24株人类来源菌株中,20株感染对象为黄种人,1例为白种人(配偶是亚裔),其余未知,差异分布具有统计学意义。13株动物来源菌株均分离自爬行动物,包括龟类6株、蛇类4株、蜥蜴类3株。MLST分型显示,中国分离株以ST46为主要序列型,美国则以ST15为主要序列型;Grapetree显示,中国分离株的遗传多态性高于美国分离株;通过cgSNP及BAPS重建的系统发育发现全球 Cft构成6个种群,中国分离株呈散在分布且与动物源菌株亲缘关系密切;美国分离株相对较集中(SC3),且以ST15克隆传播为主;毒力基因分析显示,与鞭毛、糖基化系统及黏附素相关的毒力基因在 Cft中携带率为100.00%,而与侵袭性相关的Ⅳ型分泌系统 virB4、 virB9、 virD4因子及 tetO外排泵基因均存在于新发现的ST74中;15株中国分离株的体外药物敏感性试验结果表明, Cft对环丙沙星耐药率为46.67%,对红霉素敏感性为100.00%。 结论:全球 Cft的群体结构呈现出较高的遗传多态性且感染人群多伴有基础免疫性疾病,其感染可能与食入或接触爬行类动物有关;本次研究发现的中国临床分离株主要流行型为ST46及新发现ST74型别,应引起我们的关注。
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编辑人员丨1周前
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2020年我国20个省份禽肉来源弯曲菌的耐药性及基因组特征分析
编辑人员丨1周前
目的:分析2020年我国20个省份禽肉来源弯曲菌的耐药性及基因组特征。方法:收集2020年来自全国零售禽肉制品中的弯曲菌265株(空肠弯曲菌:244株;结肠弯曲菌:21株),采用琼脂稀释法测定菌株对9种抗生素的耐药表型;对筛选出的38株耐药菌进一步开展全基因组测序,分析其携带耐药基因、毒力基因、序列型和遗传多样性特征。结果:265株弯曲菌对四环素、萘啶酸和环丙沙星的耐药率最高(84%~100%),多重耐药率达53.2%;其中结肠弯曲菌对红霉素、阿奇霉素、泰利霉素、庆大霉素、克林霉素的耐药率高于空肠弯曲菌(均 P<0.05)。38株弯曲菌基因组中β-内酰胺类(100%,38/38)、喹诺酮类(94.7%,36/38)、四环素类(81.6%,31/38)和氨基糖苷类(50%,19/38)抗生素耐药基因携带率较高;空肠弯曲菌携带毒力基因种类和数量要明显多于结肠弯曲菌;20株测序空肠弯曲菌共获得19个序列型,18株测序结肠弯曲菌共获得17个序列型,共发现5个新的序列型,菌株表现出较高的遗传多样性。 结论:我国禽肉来源弯曲菌耐药现象较为严重,耐药和毒力基因在弯曲菌中分布广泛,弯曲菌存在遗传多样性。
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编辑人员丨1周前
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一起空肠弯曲菌导致急性胃肠炎暴发事件的病原特征分析
编辑人员丨1周前
目的:对一起急性胃肠炎暴发事件进行实验室检测分析。方法:对暴发事件中采集的病例粪便标本、厨师粪便标本、环境涂抹、食品原材料等样本进行实时荧光定量PCR检测和细菌分离培养分析。对分离菌株进行PFGE分型分析并对病例分离株进行抗生素敏感性检测和全基因组测序分析。结果:4例病例粪便标本空肠弯曲菌核酸检测阳性,其中1例未服用抗生素的病例分离到空肠弯曲菌;从4份生鸡样本中获得12个空肠弯曲菌单菌落和7个结肠弯曲菌单菌落。病例分离株对萘啶酸、环丙沙星、氯霉素、氟苯尼考和四环素耐药;基因组测序分析确定该菌株为ST10075型,并确定其染色体上含有 cmeABCR、 tetO/M和 blaOXA-61等耐药元件,而23S rRNA的2 074和2 075位点均未发生突变, gyrA基因的257位点发生了C-T的突变。 结论:实验室检测结果表明空肠弯曲菌的感染可能是导致此次急性胃肠炎暴发的主要病原。
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编辑人员丨1周前
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2016-2021年上海市儿童感染性腹泻哨点监测分析
编辑人员丨1周前
目的:了解2016-2021年上海市儿童感染性腹泻的流行特征及病原谱特征,为上海市儿童感染性腹泻防控策略的制定提供科学依据。方法:采用多阶段系统抽样方法,在上海市5家儿童感染性腹泻监测点医疗机构的儿科肠道门诊或儿科门/急诊中开展腹泻症状监测,收集患者人口学信息和流行病学资料等,同时采集患者粪便标本,送至医疗机构所在区CDC开展12种细菌和5种病毒的病原学检测,分析比较2016-2021年不同人群、季节和时期的病原谱等特征。统计学分析采用 χ2检验。 结果:2 456例感染性腹泻患者中,常见肠道病原总阳性率为45.11%(1 108/2 456),单一细菌感染阳性率为16.00%(393/2 456),单一病毒感染阳性率为20.81%(511/2 456),混合感染为8.31%(204/2 456)。以致病性大肠埃希菌(12.95%,318/2 456)、诺如病毒(10.91%,268/2 456)、轮状病毒(7.49%,184/2 456)、沙门菌(5.82%,143/2 456)和空肠弯曲菌(4.68%,115/2 456)为主。儿童感染性腹泻病患者病原谱呈现明显的季节变化,夏季以细菌感染为主,6月达到高峰(34.50%,69/200),冬季以病毒感染为主,1月达到高峰(48.10%,101/210)。不同年龄组、人群和季节检出阳性率差异有统计学意义( χ 2=160.53, P<0.001; χ2=14.80, P=0.003; χ2=27.21, P<0.001)。2020-2021年儿童感染性腹泻年均病例数(284例)较2016-2019年大幅下降(472例);病原谱发生了显著的变化( χ2=39.02, P=0.001),细菌( χ2=11.73, P<0.001)与病毒( χ2=14.22, P<0.001)的阳性率均明显下降;但腺病毒阳性率上升。 结论:上海市儿童感染性腹泻患者的病原谱呈现明显的季节变化,以致病性大肠埃希菌、诺如病毒和轮状病毒为主要的腹泻病原。近年来肠道腺病毒腹泻增多,2020-2021年儿童感染性腹泻就诊数及阳性率均显著下降。应针对不同年龄、季节、病原和时期的感染性腹泻采取特异性的防控措施。
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编辑人员丨1周前
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食源性腹泻弯曲菌快速鉴定方法评估及耐药性检测
编辑人员丨1周前
目的:研究并评估适合临床实验室开展的食源性腹泻弯曲菌检测方法及抗菌药物敏感性试验。方法:分为预实验和大样本验证。(1)预实验:收集2017年9月至2018年1月就诊于北京地区某三甲manbet官网登录 食源性腹泻患者粪便标本400份。采用双孔滤膜培养法及改良头孢哌酮-木炭-脱氧胆酸盐(CCD)琼脂培养法在微需氧环境中培养48 h,挑选可疑菌落进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定,同时进行实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测空肠弯曲菌及结肠弯曲菌。(2)大样本验证:收集2018年4月至2019年3月就诊于北京不同地区不同级别3家manbet官网登录 肠道门诊食源性腹泻患者粪便标本2 062份,进行qPCR检测及培养。阳性菌株按照美国临床与实验室标准化协会及美国国家肠道细菌耐药监测中心推荐的纸片扩散法及琼脂稀释法进行药物敏感性试验并进行结果判读。采用卡方检验比较3种检测方法的检测结果及2种抗菌药物敏感性试验的一致性。结果:预实验中qPCR、双孔滤膜培养法及改良CCD琼脂培养法检测弯曲菌(空肠弯曲菌/结肠弯曲菌)的检出率分别是9.0%(36/400)、5.0%(20/400)和3.5%(14/400),差异有统计学意义(χ2=11.772, P<0.01)且qPCR阴性,培养法均为阴性。大样本验证中,qPCR的检出率为8.1%(168/2 062),其中空肠弯曲菌7.0%(144/2 062),结肠弯曲菌1.2%(24/2 062)。qPCR阳性标本进行双孔滤膜培养法培养,阳性率为61.9%(104/168),其中空肠弯曲菌为58.3%(84/144),结肠弯曲菌为83.3%(20/24),与预实验检出率差异无统计学意义( P>0.1)。空肠弯曲菌和结肠弯曲菌对环丙沙星耐药率分别为94.0%(94/100)和100.0%(24/24),对红霉素耐药率分别为6.0%(6/100)和33.3%(8/24),两种抗菌药物敏感性试验方法一致性较好(Kappa值>0.75)。 结论:qPCR快速、灵敏、操作简单,适合临床实验室常规开展。双孔滤膜培养法检出率显著高于改良CCD琼脂培养法,弯曲菌对喹诺酮类药物显示出极高的耐药率,已不适用于北京地区弯曲菌食源性腹泻的治疗,应选择大环内酯类抗菌药物。
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编辑人员丨1周前
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辽宁省鲜禽肉中空肠弯曲菌耐药表型和耐药基因及毒力基因分析
编辑人员丨2周前
目的 了解辽宁省市售鲜禽肉中空肠弯曲菌耐药表型和耐药基因遗传特征及毒力基因携带情况,为防控提供基础数据.方法 本研究采用琼脂稀释法检测9株来源于辽宁省各市市售鲜禽肉中的空肠弯曲菌的耐药表型,并对菌株进行全基因组测序,将全基因组序列与抗生素抗性基因数据库(CARD)和致病菌毒力因子(VFDB)数据库以及PubMLST数据库比对,获得基因组中的耐药基因、毒力基因和多位点序列分型(MLST)的情况.结果 9株空肠弯曲菌中8株携带介导四环素类抗生素耐药基因tet(O),耐药表型中有6株对四环素耐药.1株空肠弯曲菌耐5种抗生素,分别对萘啶酸、环丙沙星、庆大霉素、链霉素和四环素耐药.全基因组测序分析表明9株空肠弯曲菌分属6个MLST型别,以ST45和ST2274为主,多重耐药株为ST8089,耐药基因型与表型相关联.毒力基因cadF、jlpA、peb1A、rpoN、ciaB、cheY、cdtB、cdtC、htrB和waaF的携带率都为100%,flaA和cdtA的携带率均为78%.2株空肠弯曲菌携带13种毒力基因.结论 辽宁省地区鲜禽肉中空肠弯曲菌存在耐药情况,并携带多种耐药基因和毒力基因,有一定程度的引起食源性疾病的风险,因此应加强空肠弯曲菌感染监测.
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编辑人员丨2周前
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脑出血继发吉兰-巴雷综合征二例报道并文献复习
编辑人员丨1个月前
吉兰-巴雷综合征(Guillain-Barré syndrome,GBS)是一种自身免疫介导的外周神经炎症性疾病,常继发于感染,空肠弯曲菌是最常见的感染病原。GBS常以对称性肢体肌力下降为首发症状,重者累及呼吸肌,导致呼吸衰竭[1]。本研究总结了2例重症脑出血继发GBS合并有严重意识障碍和神经功能缺损的患者的诊治经验,结合既往文献报道,分析重症脑出血继发GBS的早期诊断与治疗的可行性和危险因素,现报道如下。
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编辑人员丨1个月前
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2021-2022年上海市金山区人源与禽源空肠弯曲菌的耐药性及多位点序列分型
编辑人员丨2024/6/8
[目的]了解上海市金山区人源与禽源空肠弯曲菌的耐药性现状及多位点序列分型(MLST)情况.[方法]收集2021-2022年金山区腹泻患者的粪便样品,采集金山区2家禽类养殖场禽类及相关样品进行空肠弯曲菌检测,对检出空肠弯曲菌进行微量肉汤稀释法药敏试验测定最小抑菌浓度(MIC),并选取部分菌株进行全基因组测序和MLST分析.[结果]共收集腹泻病样品823件,检出空肠弯曲菌32株,检出率3.89%.禽类相关样品600件,检出空肠弯曲菌62株,检出率10.33%.人源多重耐药达93.75%(30/32),禽源多重耐药达100.00%(62/62).人源与禽源空肠弯曲菌耐药率排名前4位分别为阿奇霉素(人源100.00%、禽源100.00%),萘啶酸(人源93.75%、禽源87.10%),环丙沙星(人源90.63%、禽源98.39%),四环素(人源84.38%、禽源98.39%).人源空肠弯曲菌中耐药性相对较低者为红霉素、氯霉素、泰利霉素.禽源空肠弯曲菌中耐药性相对较低者为红霉素、克林霉素、氟苯尼考.MLST分析显示选取的16株菌分为9种ST型,其中禽源空肠弯曲菌进化关系比较集中,人源空肠弯曲菌比较分散.且发现1株禽源空肠弯曲菌与2株人源空肠弯曲菌有较近的亲缘关系.[结论]该地区腹泻病患者中空肠弯曲菌感染严重,检出率仅次于沙门氏菌及副溶血性弧菌.禽源空肠弯曲菌感染比较普遍,两者耐药均较严重,应该加强监测与控制.MLST分析显示禽源与人源空肠弯曲菌均出现新序列型别,说明出现新的变异,须持续监测,避免新菌株的出现而引起流行.禽源与人源出现亲缘关系较近的分离株,揭示空肠弯曲菌从禽向人传播的证据,应该加强养殖场相关样品的空肠弯曲菌监测.
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编辑人员丨2024/6/8
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2017-2022年四川省生肉中常见致病菌污染状况调查研究
编辑人员丨2024/6/1
目的 了解四川省生肉中常见致病菌污染水平,为食品安全监管提供参考.方法 2017-2022年在四川省采集生禽肉和生畜肉共1763份,按照食品安全国家标准方法检测沙门菌、单核细胞增生李斯特菌、空肠弯曲菌、小肠结肠炎耶尔森菌和致泻大肠埃希菌,利用x2检验(或Fisher精确检验)进行率的差异比较,以P<0.05为差异有统计学意义.结果 沙门菌、单核细胞增生李斯特菌、空肠弯曲菌、小肠结肠炎耶尔森菌和致泻大肠埃希菌总检出率分别为26.65%、9.95%、7.66%、0.40%和1.24%.沙门菌在生禽肉和生畜肉的检出率分别为27.40%和24.11%,鸭肉检出率(36.00%)高于(x2=11.711,P=0.008)鸡肉(25.70%),猪肉检出率(30.77%)高于(x2=8.746,P=0.026)牛肉(13.75%);单核细胞增生李斯特氏菌在羊肉中的检出率(30.77%)高于(x2=13.611,P=0.002)猪肉(5.59%),在冷却肉(13.95%)和冷冻肉(22.48%)的检出率高于(x2=50.632,P<0.001)鲜肉(6.78%),在超市的检出率(17.00%)高于(x2=16.723,P=0.004)农贸市场(8.62%);空肠弯曲菌在生禽肉中的检出率(12.60%)高于(x2=84.318,P<0.001)生畜肉(0.81%),且在生禽肉中的检出率较稳定,为12.22%~13.53%,空肠弯曲菌在鲜肉中的检出率(9.46%)高于(x2=30.667,P<0.001)冷却肉(0.76%)和冷冻肉(0.85%).结论 四川省生肉中常见致病菌污染较为严重,需连续监测,加强监管.
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编辑人员丨2024/6/1