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广东省潮州市2022年非伤寒沙门菌病原学特征
编辑人员丨6天前
目的 分析2022年潮州市非伤寒沙门菌血清型、耐药性及分子流行病学特征,为有效防控食源性疾病的发生提供病原学支持.方法 2022年通过广东省潮州市哨点监测和食品风险监测,分离人源非伤寒沙门菌和食品来源非伤寒沙门菌,并对菌株开展血清学分型、药敏试验和全基因组测序分析.结果 2022年潮州市腹泻监测粪便标本共采集1 257份,检出非伤寒沙门菌58株,分离率4.61%;116份食品标本中检出非伤寒沙门菌2株,分离率1.72%.幼儿期为感染的主要年龄段(14/144,9.72%).6月份检出率最高(12/123,9.76%).58株人源非伤寒沙门菌可分成12种血清型,其中鼠伤寒沙门菌检出率最高(44/58,75.86%).药敏结果示,55株存在耐药,耐药率91.67%,其中氨苄西林、四环素、氯霉素和链霉素的耐药率较高,分别为76.67%、70.00%、67.67%和60.00%;49株具有多重耐药性,多重耐药率占81.67%.分子特征示,通过多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)60株沙门菌菌株可分成14个序列分型(sequence typing,ST),鼠伤寒沙门菌ST34占主导优势,全基因组单核苷酸多态性(whole genome single nucleotide poly-morphism,wg-SNP)进化分析示,本研究菌株间表现为较高的遗传异质性,鼠伤寒沙门菌聚类分布,临床样本肠炎沙门菌进化关系较为接近.结论 2022年潮州市人源非伤寒沙门菌血清型多样,其中鼠伤寒沙门菌占优势,多重耐药情况严重,分子分型呈现进化多样性特点.
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编辑人员丨6天前
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上海市浦东新区2013-2017年感染性腹泻病原流行特征分析
编辑人员丨1周前
目的:了解2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原流行特征,为制定监测方案和开展感染性腹泻防治工作提供科学依据。方法:2013年1月至2017年12月,根据地理位置、覆盖人群和就诊量,在本区3所三级manbet官网登录 、9所二级manbet官网登录 和2所社区卫生服务中心开展腹泻病原主动监测,填写门诊病例个案调查表,采集粪便样品进行5类病毒和8类细菌的病原学检测。结果:共纳入感染性腹泻病例9 301例,病原阳性率为55.7 %(5 179)。单一病毒、单一细菌和混合感染的阳性率分别为26.7 %(2 481)、17.0 %(1 579)和12.0 %(1 119)。单一病毒阳性病例中,诺如病毒阳性率最高(15.4 %,1 428/9 301),其次为轮状病毒(7.2 %,667/9 301);单一细菌阳性病例中,致泻性大肠埃希菌阳性率最高(6.7 %,619/9 301),其次为非伤寒沙门菌(3.3 %,305/9 301);混合感染病例中,病毒-细菌阳性率最高(4.9 %,459/9 301)。诺如病毒(17.0 %,838/4 938)和致泻性大肠埃希菌(7.2 %,354/4 938)阳性率在20~59岁年龄组最高,轮状病毒(9.4 %,178/1 896)和非伤寒沙门菌(4.9 %,93/1 896)阳性率在0~4岁年龄组最高。诺如病毒年度流行呈现春季和秋季2个高峰,轮状病毒呈现冬季高峰,致泻性大肠埃希菌呈现夏季高峰,非伤寒沙门菌呈现夏季小高峰。 结论:2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原阳性率高,诺如病毒、轮状病毒和致泻性大肠埃希菌是本地区优势病原体,病原在不同年龄组分布存在差异,优势病原季节性流行特征明显。
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编辑人员丨1周前
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广州地区腹泻患儿非伤寒沙门菌感染的流行病学特征
编辑人员丨1周前
目的:了解广州地区腹泻患儿感染非伤寒沙门菌(NTS)的流行病学特征和临床表现,为我国儿童NTS感染的防治提供依据。方法:2019年1月至12月在广州市妇女儿童医疗中心的3个院区利用分层抽样收集腹泻患儿粪便标本570份,非腹泻儿童粪便标本296份,通过细菌培养,挑取相应菌落使用沙门菌诊断血清进行初步血清诊断,再用系统生化法进行确诊,同时使用结构化问卷收集研究对象基本信息。结果:腹泻患儿组NTS检出率为6.67%(38/570例,95% CI:4.90%~9.02%),非腹泻儿童组NTS检出率为1.01%(3/296例,95% CI:0.34%~2.93%),2组NTS检出率比较差异有统计学意义( χ2=13.805, P<0.05; OR=6.976,95% CI:2.135~22.796);男、女腹泻患儿NTS检出率比较差异无统计学意义( χ2=0.395, P>0.05; OR=1.254,95% CI:0.619~2.541);NTS检出率在<2岁儿童中为5.30%(22/416例,95% CI:3.52%~7.88%),在>2岁儿童组中为10.40%(16/154例,95% CI:6.50%~15.21%),2组NTS检出率比较差异有统计学意义( χ2=4.700, P<0.05; OR=2.076,95% CI:1.060~4.068);NTS检出率在门诊腹泻患儿中为5.40%(25/460例,95% CI:3.70%~7.89%),在住院腹泻患儿中为11.80%(13/110例,95% CI:7.04 %~19.18%),2组NTS检出率比较差异有统计学意义( χ2=5.813, P<0.05; OR=2.332,95% CI:1.152~4.721);NTS腹泻患儿检出率在春季为4.60%(10/217例,95% CI:2.52%~8.28%),在夏季为8.50%(12/141例,95% CI:4.93%~14.29%),在秋季为9.60%(15/144例,95% CI:6.41%~16.48%),在冬季为1.50%(1/168例,95% CI:0.11%~3.30%),不同季节NTS检出率比较差异有统计学意义( χ2=9.404, P<0.05)。NTS检出阳性与阴性的患儿临床出现发热、呕吐、腹痛、血便和糊状便的发生率比较差异均有统计学意义(均 P<0.05)。NTS分型以肠炎沙门菌为主,其次为鼠伤寒沙门菌。 结论:NTS是广州地区引起儿童腹泻的重要细菌性病原体之一,男女感染率无差异,2岁以上儿童多发,秋季高发,容易出现发热、呕吐、腹痛、血便和糊状便的临床表现。NTS分型以肠炎沙门菌为主,其次为鼠伤寒沙门菌。实验室检测可为NTS相关腹泻的诊治提供参考。
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编辑人员丨1周前
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不容忽视的沙门菌菌血症及其播散性感染
编辑人员丨1周前
沙门菌属是肠杆菌科中最复杂的菌属。目前全球已分离出2 600多个血清型,其中200多个血清型对人体有致病性。沙门菌属根据临床表型分为伤寒沙门菌和非伤寒沙门菌,主要通过污染的食物及水源感染而致病。感染沙门菌的多数患者表现为急性胃肠炎,病程大多自限。少部分患者出现肠道外播散性感染,表现为菌血症与继发的迁徙病灶(如骨髓、关节、心瓣膜、动脉等);这类患者往往存在基础疾病,感染后临床表现多不典型,早期确诊率低,治疗效果欠佳,疾病总体预后差,病死率高。因此,临床医生应高度重视沙门菌菌血症及其播散性感染。
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编辑人员丨1周前
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非伤寒沙门菌对喹诺酮类药物的耐药分子机制研究
编辑人员丨1周前
通过回顾性研究分析,探究非伤寒沙门菌(NTS)对喹诺酮类药物的耐药性及耐药机制。以南方医科大学第五附属manbet官网登录 2020年5月至2021年2月临床标本中分离的105株NTS为研究对象,采用VITEK2 Compact全自动鉴定药敏分析系统和血清学实验对菌株进行鉴定;用琼脂稀释法检测菌株对环丙沙星、左氧氟沙星和萘啶酸的敏感性;对105株NTS 进行全基因组测序,采用Abricate等软件分析菌株的耐药相关基因,包括质粒介导的喹诺酮耐药基因(PMQR)和喹诺酮耐药决定区(QRDR);采用SISTR和MLST分析血清型和ST型,并构建系统发育树。结果显示,分离的NTS主要为ST34鼠伤寒沙门菌(53.3%)。药敏结果显示NTS对环丙沙星、左氧氟沙星和萘啶酸的耐药率分别为30.4%、1.9%和22.0%,对环丙沙星、左氧氟沙星的中介率为27.6%、54.2%;62株喹诺酮类非敏感株中共有46株(74.2%)携带PMQR基因,主要为 qnrS1(80.4%),其次为 aac( 6′) -Ib-cr(15.2%);QRDR突变分析共有14株和8株NTS分别存在 gyrA和 parC基因突变, gyrA均为第87位氨基酸位点突变,分别为Asp87Tyr、Asp87Asn、Asp87Gly, parC检出Thr57Ser突变。综上,本研究发现,NTS对喹诺酮类药物耐药性相对较高,携带 qnrS1基因主要导致NTS对环丙沙星和左氧氟沙星的敏感性下降,发生 gyrA:87位点突变主要导致NTS对萘啶酸耐药;同时携带多种PMQR和存在QRDR突变,可导致NTS对3种喹诺酮类药物耐药。鼠伤寒沙门菌在临床分离株中存在克隆传播现象,需进一步加强流行病学的监测。
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编辑人员丨1周前
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广东省2018-2022年侵袭性非伤寒沙门菌病原学特征分析
编辑人员丨1周前
目的:了解2018-2022年广东省侵袭性非伤寒沙门菌(iNTS)的血清型分布、耐药性以及分子流行情况,为沙门菌侵袭性感染的防治提供科学依据。方法:对2018-2022年广东省分离自血液和粪便样本的沙门菌进行血清学鉴定、药敏试验、多位点序列分型(MLST)和全基因组测序。同时利用微生物基因注释系统对测序结果开展耐药基因与毒力因子注释。结果:136株iNTS分为25种血清型,肠炎沙门菌占38.24%(52/136)。以鼠伤寒变种沙门菌作为对照计算其余iNTS血清型的 OR值,奥雷宁堡、里森和波摩那3种沙门菌血清型的 OR值较高,分别为423.50、352.92和211.75。iNTS耐药率在0.74%~66.91%之间,普遍低于非iNTS株(3.90%~77.21%)。iNTS耐药以氨苄西林和四环素为主,耐药率分别为66.91%(91/136)和50.00%(68/136),而对环丙沙星(5.88%,8/136)、头孢他啶(5.88%,8/136)、庆大霉素(5.13%,7/136)和头孢西丁(0.74%,1/136)耐药率较低。iNTS携带多种耐药基因与毒力因子,但尚未发现共同毒力因子分布特征。MLST聚类分析显示,iNTS分为26种序列型别,ST11型占38.24%(52/136)。 结论:2018-2022年广东省iNTS以肠炎沙门菌为主,其中奥雷宁堡、里森和波摩那3种血清型可能与更高的侵袭性感染风险有关。iNTS对临床一线治疗药物(头孢类和氟喹诺酮类抗生素)敏感,序列呈现高度多样性且具有明确的系统发育分支,以ST11型为本地优势克隆群。
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编辑人员丨1周前
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侵袭性非伤寒沙门菌血清型和耐药性分析
编辑人员丨1周前
目的:分析7株侵袭性非伤寒沙门菌(iNTS)的血清型和耐药性。方法:针对收集的7株iNTS菌株,开展血清学鉴定、药物敏感性实验以及全基因组测序,并对血清型、MLST型和耐药基因进行鉴定、注释和分析。结果:7株iNTS菌株中,包含1株鼠伤寒血清型和2株Ⅰ 4,[5],12:i:- (ST34型)、2株肠炎血清型、1株科瓦利斯血清型和1株未知血清型Ⅰ 4,[5],12:d:-(ST279型),其中6株为单相菌,沙门菌二相鞭毛基因缺失或假基因化可能有助于增强沙门菌侵袭性。未发现替加环素、氨曲南、阿米卡星及头孢类、碳青霉烯类抗生素耐药株,存在1株八重耐药鼠伤寒沙门菌。耐药基因与耐药表型基本相符。结论:本研究中的iNTS菌株存在八重耐药株,整体耐药水平尚低但不可忽视。
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编辑人员丨1周前
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儿童来源肠道沙门菌肠道亚种非 A~ F群血清型分离株的耐药性及分子流行病学和毒力基因分布
编辑人员丨1周前
目的:分析肠道沙门菌肠道亚种非A~F群血清型分离株的耐药性、分子流行病学和毒力基因分布情况,以明确其流行特点,为临床诊疗提供流行病学依据。方法:针对浙江大学医学院附属儿童manbet官网登录 2017—2020年收集的11株肠道沙门菌肠道亚种非A~F群血清型分离株,进行血清分型及抗菌药物敏感性试验,并进行全基因组测序,进而对测序结果进行血清型、多位点序列分型和毒力基因分析。结果:本院肠道沙门菌肠道亚种非A~F群血清型分离株检出率较低,占比1.13%。11株菌株中,包含长湾尼血清型3株,非丁伏斯血清型2株,汪兹沃思、波摩那、凯杜古、厄班那、浦那、库马西血清型各1株。11株非A~F群肠道沙门菌肠道亚种分离株中除2株多重耐药株外,其余菌株对绝大多数抗菌药物均敏感,且最低抑菌浓度(MIC)均处于较低水平。11株菌共检测出9种ST型,3株长湾尼血清型菌株均为ST3918,其他分离株分别为不同的ST型。通过核心基因组构建进化树显示3株长湾尼血清型菌株亲缘关系紧密。11株菌株共检测出毒力基因103种,包含分泌系统相关基因78种,黏附相关基因21种,镁吸收相关基因2种,抗菌肽耐药性相关基因1种,伤寒毒素相关基因1种。结论:本院肠道沙门菌肠道亚种非A~F群血清型分离株的检出率较低,对常见抗菌药物敏感性较高,ST型及亲缘关系呈多样性分布。临床实验室应关注肠道沙门菌肠道亚种非A~F群血清型分离株的检出,并持续关注其耐药性和毒力基因变化。
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编辑人员丨1周前
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2015—2018年河南省儿童腹泻患者分离的非伤寒沙门菌病原特征及耐药性
编辑人员丨1周前
目的:了解河南省5岁以下腹泻儿童粪便标本中检出非伤寒沙门菌的病原学特征和耐药情况。方法:以2015—2018年河南省5个监测点采集的4 250份5岁以下腹泻儿童患者粪便为研究对象,标本进行肠道菌的分离培养,沙门菌阳性菌株进行血清分型和药敏试验,采用卡方检验分析耐药性年度变化趋势,对数据进行回顾性分析。结果:4 250份粪便标本中非伤寒沙门菌检出率为8.73%(371/4 250),0~1岁年龄组幼儿检出率最高,为51.75%;5~10月份是检出高峰;最常见的血清型是肠炎沙门菌(36.93%),其次是4,5,12:i:-型沙门菌(14.82%)和鼠伤寒沙门菌(14.02%);非伤寒沙门菌对氨苄西林和磺胺异噁唑的耐药率均>80%,对头孢他啶、头孢吡肟和头孢西丁较敏感;不同年份的菌株对头孢吡肟、左氧氟沙星、环丙沙星、阿米卡星、多西环素、氯霉素、复方新诺明的耐药差异有统计学意义( P<0.05); 86.52%的分离株为多重耐药菌。 结论:河南省5岁以下儿童感染非伤寒沙门菌的血清型分布呈多样性,主要是肠炎沙门菌,对常用的抗菌药物均存在耐药问题,大多数分离菌株产生了多重耐药。
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编辑人员丨1周前
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厦门地区儿童侵袭性非伤寒沙门菌感染临床特征和耐药性分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨厦门地区儿童侵袭性非伤寒沙门菌感染的临床特征、血清型及抗菌药物耐药性。方法:回顾性队列研究。分析厦门市儿童manbet官网登录 感染科、骨科和普外科2016年1月至2021年12月经血液、脑脊液、骨髓等无菌体液或深部脓液培养确诊的29例侵袭性非伤寒沙门菌感染患儿的临床表现、治疗、预后、血清型和抗菌药物耐药性等资料。根据临床疾病诊断标准,比较败血症和非败血症两组患儿的炎症指标、血清型分布及药物耐药性差异。组间比较采用Mann-Whitney U检验和 χ2检验。 结果:29例患儿中男17例、女12例,就诊年龄14(9,25)月龄,<1岁10例(34%),1~<3岁15例(52%),≥3岁4例(14%)。4至9月发病25例(86%)。败血症组19例(66%),其中2例合并化脓性脑膜炎;非败血症组10例(34%),其中菌血症7例、局部化脓感染3例(骨髓炎2例、阑尾炎穿孔伴腹膜炎1例)。发热29例(100%),腹泻、腹痛18例(62%),咳嗽、流涕10例(34%)。经有效抗菌药物治疗,治愈18例(62%)、好转11例(38%)。败血症组C反应蛋白高于非败血症组[25.2(16.1,56.4)比3.4(0.5,7.5)mg/L, Z=-3.81, P<0.001]。非伤寒沙门菌血清型主要为C群10例(34%)、B群9例(31%)、E群7例(24%)。抗菌药物敏感性试验示对亚胺培南、厄他培南和哌拉西拉他唑巴坦的敏感率均为100%(31/31),头孢他啶、头孢曲松、头孢吡肟的敏感率分别为94%(29/31)、94%(29/31)、97%(30/31),氨苄西林、氨苄西林舒巴坦、复方新诺明的耐药率分别为51%(16/31)、48%(15/31)、48%(15/31),头孢唑林、头孢替坦、妥布霉素、庆大霉素、阿米卡星的耐药率均为100%(31/31)。败血症组和非败血症组对头孢他啶、头孢曲松、氨曲南、氨苄西林舒巴坦、氨苄西林、复方新诺明和环丙沙星的耐药率差异均无统计学意义( χ2=0.31、0.31、0.00、0.02、0.02、0.02、0.26,均 P>0.05)。 结论:厦门地区儿童侵袭性非伤寒沙门菌感染主要发生于3岁以下婴幼儿,主要表现为发热、腹痛、腹泻。C反应蛋白可作为提示败血症的实验室指标。推荐三代头孢菌素作为抗感染治疗的首选药物。
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编辑人员丨1周前