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直肠癌与直肠黏膜菌群相关性研究
编辑人员丨1周前
目的:通过对直肠癌患者肿瘤部位和癌旁部位及健康直肠黏膜菌群进行分析,探讨直肠黏膜菌群与直肠癌的关系。方法:选取2018年7月至2019年9月温州医科大学附属第一manbet官网登录 行直肠癌根治手术的94例直肠癌患者肿瘤黏膜(CM组)和癌旁黏膜(AM组),100例健康者直肠黏膜(NM组)作为研究对象。细菌培养定量检测患者和正常黏膜主要细菌,高通量测序分析3组黏膜菌群,实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)法检测双歧杆菌等关键菌丰度差异。正态分布资料采用 t检验,非正态分布资料采用K-W检验。 结果:培养显示双歧杆菌在直肠癌肿瘤黏膜高于健康者(6.60±0.81比5.66±0.68, t=10.312, P<0.01)、乳酸杆菌在直肠癌肿瘤黏膜高于健康者(6.58±0.59比5.44±0.71, t=13.527, P<0.01)、肠球菌在直肠癌肿瘤黏膜高于健康者(6.22±0.87比4.64±0.80, t=12.351, P<0.01)。16SrRNA扩增子焦磷酸测序显示直肠癌患者CM及AM菌群多样性和丰富度均显著高于NM,qPCR结果显示NM中嗜黏液艾肯曼菌、消化球菌、长双歧杆菌、两歧双歧杆菌丰度分别是CM的12.55倍( t=13.500, P<0.05)、4.89倍( t=10.960, P<0.05)、2.27倍( t=8.242, P<0.05)、1.97倍( t=5.230, P<0.05)。 结论:直肠癌患者直肠黏膜菌群与健康人存在显著差异,直肠癌患者的肿瘤局部黏膜菌群多样性及丰度均发生了明显变化,局部黏膜菌群改变可能在直肠癌发生发展中发挥了一定作用。
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编辑人员丨1周前
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大鼠尘肺病模型肠道与呼吸道共有差异菌群和代谢产物相关性研究
编辑人员丨1周前
目的:筛选大鼠肠道和呼吸道共有差异菌群和差异代谢物,分析大鼠肠道菌群和代谢物的变化在大鼠尘肺病进展中可能的作用。方法:于2020年4月,将18只SD大鼠随机分为3组(对照组、煤矿粉尘组和二氧化硅组,每组各6只)。煤矿粉尘组和二氧化硅组大鼠采用非气管暴露法分别灌注1 ml 50 mg/ml煤矿井下粉尘悬浊液和二氧化硅悬浊液,对照组大鼠灌注同等剂量灭菌生理盐水。染尘24周后采集大鼠粪便、咽拭子和肺灌洗液。采用16SrDNA基因测序技术和UHPLC-QTOF-MS非靶向代谢组学技术检测各组大鼠粪便、咽拭子和肺灌洗液中菌群和代谢物,筛选肠道和呼吸道共有差异菌群和共有差异代谢物。并采用Spearman法对差异菌群和代谢物进行相关性分析。结果:与对照组比较,煤矿粉尘组门水平下共筛选到9种肠道和呼吸道共有差异菌群,属水平下共筛选到9种肠道和呼吸道共有差异菌属,主要为厚壁菌门、放线菌门、链球菌属、乳杆菌属;与对照组比较,二氧化硅组门水平下共筛选到9种共有差异菌群,属水平下共筛选到5种共有差异菌群,主要为变形菌门、放线菌门、异杆菌属、粘液杆菌属。与对照组比较,煤矿粉尘组共筛出7种共有差异代谢物,标桩菌素、芳樟醇氧化物和异亮氨酸-亮氨酸在肠道和呼吸道中均上调;二氧化硅组与对照组比较,共筛出19种共有差异代谢物,其中二乙醇胺、1-氨基环丙烷羧酸、异亮氨酸-亮氨酸、鞘氨醇、棕榈酸、二氢鞘氨醇、1,2-二油酰基-sn-甘油-3-磷脂酰胆碱、1-硬脂酰-2-油酸甘油酯磷酸化胆碱在肠道和呼吸道中均上调。结论:尘肺病大鼠肠道和呼吸道菌群存在移位现象,大鼠在尘肺病进展过程中存在脂质代谢失衡。
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编辑人员丨1周前
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粪菌移植对阿霉素肾病小鼠肠道菌群紊乱改善的实验研究
编辑人员丨1周前
目的:研究粪菌移植对阿霉素诱导的肾病综合征小鼠模型的作用。方法:将27只SPF级雄性Balb/c小鼠随机分为3组,分别为空白对照组、阿霉素模型组(Dox组)、阿霉素+粪菌移植(FMT组),其中后两组使用阿霉素尾静脉注射构建肾病综合征小鼠模型,并分别给予PBS或粪菌溶液灌胃,最后分别收集粪便标本以及24 h尿液标本,考马斯亮蓝法-蛋白定量检测24 h尿蛋白,16 s微生物组学测序和生物信息学分析各组小鼠肠道菌群的变化情况和分布特征。结果:与空白对照组相比,Dox组小鼠24 h尿蛋白定量(0.48±0.61 vs 1.71±0.63, P<0.001)明显升高,肠道菌群多样性Shannon指数(7.15±0.29 vs 6.98±0.49)呈减少趋势,肠道菌群紊乱;与Dox组小鼠相比,FMT组24 h尿蛋白定量(1.71±0.63 vs 0.91±0.48, P<0.05)和血肌酐水平(12.47±4.16 vs 7.77±0.75, P<0.05)显著下降,肠道菌群多样性Shannon指数(6.98±0.49 vs 7.09±0.28)呈现增加趋势,肠道菌群紊乱明显改善,产短链脂肪酸细菌富集增加。 结论:粪菌移植可减少阿霉素诱导的肾病小鼠的尿蛋白,改善肠道菌群的紊乱。
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编辑人员丨1周前
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骨髓间充质干细胞联合常温机械灌注对肝移植急性排斥反应大鼠肠道菌群的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨骨髓间充质干细胞(BMSCs)联合常温机械灌注(NMP)对肝移植急性排斥反应大鼠肠道菌群的影响。方法:2020年4月至10月,选取24只雄性Lewis大鼠为供体,24只雄性Brown Norway大鼠为受体,"二袖套"法建立大鼠肝移植急性排斥反应模型,根据以下处理肝脏方法将大鼠分为四组:假手术组(Sham组)、NMP组(NMP组)、NMP/BMSCs组(BMP组)和他克莫司组(FK506组),在术后第7天处死各组大鼠,苏木精-伊红(HE)染色观察肝脏病理学;生化分析仪检测血清中谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)和碱性磷酸酶(ALP)的含量;酶联免疫吸附测定(ELISA)和实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)分别检测血清和肠道组织中肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白细胞介素-6(IL-6)的含量;对各组大鼠粪便标本进行高通量测序,获得16SrDNA数据。两组间数据比较采用独立样本 t检验,多组数据比较采用单因素方差分析。 结果:BMP组肝窦内充血、炎性细胞浸润程度减轻;排斥活动指数(RAI)(4.17±0.75)低于NMP组(7.67±0.82, t=7.720, P<0.05),差异有统计学意义;血清ALT、AST和ALP[(254.02±35.55) U/L、(457.42±131.22) U/L、(169.60±65.61) U/L]水平低于NMP组[(362.22±57.73) U/L、(741.67±87.19) U/L、(269.93±43.51) U/L, t=3.909、4.419、3.196 P<0.05],差异有统计学意义;肠道菌群丰度增加,变形菌门占比下降,阿克曼菌科占比上升,花生四烯酸代谢、上皮细胞的细菌侵袭通路丰度下降;血液中炎性因子TNF-α和IL-6[(66.01±12.46) pg/ml、(130.3±9.67) pg/ml]浓度低于NMP组[(127.1±17.85) pg/ml、(169.9±8.25) pg/ml, t=6.276、6.975, P<0.05],差异有统计学意义;肠组织中炎性因子TNF-α和IL-6[(1.85±0.17)、(3.47±0.22)]的mRNA水平低于NMP组[(2.71±0.34)、(9.45±1.34), t=3.955、7.604, P<0.05],差异有统计学意义。 结论:BMSCs联合NMP可以减轻大鼠肝移植术后急性排斥反应,同时对大鼠肠道菌群紊乱具有调节作用。
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编辑人员丨1周前
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达格列净对初诊2型糖尿病患者胰岛β细胞功能及肠道菌群的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨达格列净对新诊断2型糖尿病(T2DM)患者肠道菌群及胰岛β细胞功能的影响。方法:本研究为随机对照试验。选取2018年12月至2019年9月在江苏省盐城市亭湖区人民manbet官网登录 住院的52例新诊断T2DM患者作为研究对象,同时选取体检中心20名健康体检者作为正常对照组。T2DM患者住院后在专科护士的指导、糖尿病饮食的基础上予胰岛素强化治疗,血糖达标1周后停用胰岛素,采用随机数字表法分为达格列净组(剂量为10 mg,1次/d)和二甲双胍组(剂量为0.5~1.0 g,2次/d)。两组均用药12周。收集两组患者治疗前及治疗后的一般资料并检测临床指标,包括体重指数(BMI)、腰围、血尿酸、糖化血红蛋白(HbA 1c)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、空腹血糖(FPG)、餐后2 h血糖(2hPG)、稳态模型评估胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)、稳态模型评估β细胞功能指数(HOMA-β)等指标。同时收集两组患者治疗前及治疗后的粪便标本,通过16SrDNA测序检测粪便的菌群组成。组内各指标的比较采用配对样本 t检验,组间各指标的比较采用单因素方差分析或Kruskal-Wallis秩和检验。采用Spearman相关分析法分析肠道菌群与T2DM临床相关指标的相关性。 结果:达格列净组26例,二甲双胍组26例。与二甲双胍组治疗后比较,达格列净组治疗后BMI、腰围、血尿酸、LDL-C、HOMA-IR水平下降,HDL-C、HOMA-β水平升高,差异均具有统计学意义( P<0.05)。二甲双胍组、达格列净组和正常对照组分别有13、11和20例最终成功收集了粪便标本。二甲双胍组和达格列净组患者治疗后肠道菌群多样性显著增加(均 P<0.05),与二甲双胍组治疗后比较,达格列净组治疗后肠杆菌属、普氏梭杆菌属丰度水平明显降低,而普拉梭菌属和普雷沃菌属丰度明显升高,差异均具有统计学意义( P<0.05)。Spearman相关分析结果显示,布劳特菌属、丹毒丝菌属丰度与FPG、2hPG、HbA 1c水平均呈正相关( r值分别为0.41、0.41、0.43,0.44、0.46、0.46;均 P<0.01),普拉梭菌属丰度与FPG、2hPG、HbA 1c水平呈负相关( r值分别为-0.36、-0.34,-0.46,均 P<0.01)。 结论:在新诊断T2DM患者中,达格列净在降低体重、增加胰岛β细胞功能和改善胰岛素抵抗方面优于二甲双胍,两组治疗12周后都能改变肠道菌群组成结构,但达格列净和二甲双胍在改变特定菌群丰度水平方面有差异。
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编辑人员丨1周前
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变应性鼻炎及非变应性鼻炎患者鼻腔微生态特征分析
编辑人员丨1周前
目的:探究变应性鼻炎(AR)及非变应性鼻炎(nAR)患者的鼻腔菌群特征及差异菌的致病作用。方法:选取2022年2—7月于哈尔滨医科大学附属第二manbet官网登录 鼻科门诊就诊的AR患者35例、nAR患者35例为试验组,选取同期体检的健康人群20名为对照组,合计男性39例,女性51例,年龄8~55岁。利用16SrDNA高通量测序分析3组受试者鼻腔菌群相对丰度特征,使用R软件进行Alpha多样性指数分析,利用LEfSe、Metastats、 t检验进行组间差异分析,同时利用R软件分析菌群的作用及与环境因子的关系。 结果:3组样本的菌群构成存在显著差异,AR组内金黄色葡萄球菌( P=0.032)、丙曲棒状杆菌( P=0.032)的相对丰度显著高于nAR组,鼠李乳杆菌、昆可乳杆菌、产碱菌( P值分别为0.016、0.005、0.001)的相对丰度显著低于nAR组,nAR组内嗜黏蛋白阿克曼菌的相对丰度高于对照组( P=0.009)。环境因子相关性分析显示昆可乳杆菌与IgE呈负相关关系( P=0.044),鼠李乳杆菌与年龄呈正相关关系( P=0.019)。分别构建5个属的AR、nAR随机森林预测模型,AR组肺炎链球菌-FF10、黄体假单胞菌、副氏假单胞菌、熊不动杆菌和固氮杆菌模型的曲线下面积(AUC)为100%(95%CI:100%~100%),nAR组副氏假单胞菌、固氮杆菌、巴拉蒂梭菌、土瑞酸杆菌和黄链球菌模型的AUC为98.4%(95%CI:94.9%~100%)。 结论:AR、nAR患者与健康受试者鼻腔菌群相对丰度显著不同,菌群丰度的改变与AR及nAR的发生具有显著关系。菌群的联合检测具有诊断AR及nAR患者的潜力。
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编辑人员丨1周前
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心房颤动患者肠道菌群变化及其与导管消融术后复发的相关性
编辑人员丨2周前
目的 利用16S rDNA测序技术检测心房颤动患者肠道菌群的多样性及丰度变化,探究导管消融术后未复发与复发患者的肠道菌群差异并分析其相关性.方法 采用前瞻性队列研究的方法,根据标准纳入2021年1月至5月我院收治的53例房颤患者作为房颤组,患者均行导管消融术,根据术后是否复发房颤将其再分为未复发组与复发组.未复发组患者47例,复发组患者6例.选取同期性别、年龄等匹配的健康体检者29例作为健康组.所有入选者均使用16S rDNA测序法检测肠道菌群.采用生物信息学方法分析房颤组与健康组、复发组与未复发组之间的肠道菌群差异.结果 在alpha多样性上,房颤组患者肠道菌群多样性低于健康组.在门水平和纲水平,健康组与房颤组肠道菌群结构差异均无统计学意义(均P>0.05).房颤组患者肠道 Dinococcus-Thermophilus(Q=0.020,P=0.001)、Thermoleophilia(Q=0.023,P<0.001)、WSP-1 菌纲(Q=0.025,P<0.001)、Ktedonobacteria(Q=0.028,P<0.001)、Thermomicrobia(Q=0.037,P<0.001)、Bacillales(Q=0.018,P<0.001)、Tepidisphaerales(Q=0.025,P<0.001)、JG30-KF-CM45 菌目(Q=0.029,P<0.001)、JG30-KF-AS9 菌目(Q=0.032,P<0.001)、DA111 菌科(Q=0.039,P<0.001)、BIrii41 菌科(Q=0.045,P<0.001)相对丰度均低于健康组.在属水平,房颤组和健康组菌群差异无统计学意义(P>0.05).复发组患者肠道Proteobacteria、Spirochaetae、Betaproteobacteria、Epsilonproteobacteria、Spirochaetes、JG30_KF_AS9、Burkhold-eriales、Campylobacterales、Spirochaetales、Enterococcaceae、Alcaligenaceae 相对丰度增高,未复发组中 Neis-seriales、Neisseriaceae、Christensenellaceae、Rikenellaceae 相对丰度增高.两个亚组间 Proteobacteria 的 LDA 得分最高,LDA得分>4.结论 房颤组患者较健康组肠道菌群多样性降低,但群落结构没有显著差异.肠道菌群失调的房颤患者进行导管消融术后较易复发,这可能是导管消融术后患者房颤复发的潜在预测因素.
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编辑人员丨2周前
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麻芥六君子联合方组对变应性鼻炎模型大鼠治疗与鼻黏膜菌群的影响
编辑人员丨3周前
目的 比较联合处方麻芥颗粒与六君子颗粒及其单独处方对变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)小鼠鼻黏膜紧密连接蛋白、炎症因子、鼻黏膜菌群的影响,研究联合处方麻芥颗粒与六君子颗粒及其单独处方治疗变应性鼻炎大鼠的机制.方法 将60只小鼠随机分为6组,每组10只,除空白组外,其余5组用卵清蛋白诱导AR模型后,根据所给药物分为模型组、六君子组、麻芥组、联合组、辛芩组.用反转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reac-tion,RT-PCR)法检测AR大鼠鼻黏膜紧密连接蛋白(tight junction,TJ)和肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)和转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)的基因表达水平,并采用16SrDNA测序法评价鼻黏膜菌群结构的变化.结果 各治疗组均能显著降低AR大鼠行为学得分;各治疗组均能显著下调血清中免疫球蛋白E(immunoglobulin E,IgE)水平;麻芥组、联合组、辛芩组显著提升连接蛋白-1(claudin-1)mRNA表达(P<0.05),各治疗组均能显著提升闭合蛋白(occludin)mRNA表达水平(P<0.05);除六君子组外各治疗组均降低AR大鼠鼻黏膜TNF-α的表达(P<0.05);除六君子组外各治疗组对AR大鼠鼻黏膜TGF-β的mRNA表达均显著上调(P<0.05).各治疗组均可提升AR大鼠鼻黏膜菌群多样性和相对丰度;在门水平上,与空白组比较,AR大鼠模型组变形菌丰度升高,这种变化被除辛芩组外的各治疗组逆转;在科水平上,相较于空白组,模型组肠杆菌相对丰度显著降低;在麻芥颗粒联合六君子颗粒组中以乳杆菌科(Lactobacilliaceae)相对丰度最为丰富,与模型组对比显著升高(P<0.01);在麻芥组、六君子大鼠中检测到芽孢菌科(Bacillaceae)与葡萄球菌科(Staphylococcaceae)相对丰度升高(P<0.01);线性判别分析(linear dis-criminant analysis,LDA)得分结果检测到AR大鼠富集大肠杆菌志贺菌属,六君子组富集芽孢杆菌、麻芥组富集芽孢杆菌与粪便细菌、联合组富集乳杆菌等厚壁菌属.结论 麻芥颗粒联合六君子颗粒可使炎症因子表达量恢复至正常水平并提高变应性鼻炎大鼠TJ蛋白表达水平而增强鼻黏膜屏障功能,其作用机制可能是通过调整鼻黏膜菌群多样性与相对丰度.
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编辑人员丨3周前
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学龄前阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征儿童肠道菌群特征分析
编辑人员丨3周前
目的:探讨学龄前阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)儿童与正常儿童肠道菌群的差异.方法:选取2023年7月至2023年11月期间新疆医科大学第一附属manbet官网登录 儿科门诊收治的学龄前OSAHS儿童30例作为OSAHS组,选取同期于新疆医科大学第一附属manbet官网登录 健康管理中心体检健康的儿童30例作为对照组.利用16SrDNA扩增子测序技术对肠道菌群进行分析.采用Spearman法分析睡眠质量与肠道菌群门、属水平丰度的相关性.结果:OSAHS组和对照组共发现2588个扩增子序列变异(ASVs),OSAHS组检出特有ASVs 1034个,对照组检出特有ASVs 1554个.OSAHS组Chao1指数和Observed otus指数显著低于对照组(P<0.05),两组间Shannnon指数、Simpson指数、Goods coverage指数、Peilou-e指数均差异无统计学意义(P>0.05).OSAHS组与对照组间肠道菌群群落结构存在显著差异(P<0.05).在门水平上,OSAHS组拟杆菌门的相对丰度低于对照组,厚壁菌门的相对丰度、厚壁菌门/拟杆菌门的比例高于对照组(P<0.05).在属水平上,OSAHS组与对照组组优势菌群相对分度比较差异无统计学意义(P>0.05).在门水平上,睡眠质量与拟杆菌门呈正相关(P<0.05).在属水平上,睡眠质量与双歧杆菌属、乳杆菌属呈负相关,与拟杆菌属呈正相关(P<0.05).阻塞性呼吸暂停低通气指数(OAHI)与肠杆菌属呈负相关(P<0.05).最低血氧饱和度(LSaO2)与肠杆菌属呈正相关(P<0.05).平均血氧饱和度(MSaO2)与X.Eubacterium._eligens_group呈正相关(P<0.05).结论:与正常儿童的肠道菌群的种类和相对丰度相比,学龄前OSAHS儿童的厚壁菌门/拟杆菌门比例升高,可能存在肠道菌群失调.睡眠质量在门、属水平上与拟杆菌门、双歧杆菌属、乳杆菌属明显相关.
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编辑人员丨3周前
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习练路氏八段锦对纤维肌痛患者肠道微生态的影响
编辑人员丨1个月前
目的:观察路氏八段锦对纤维肌痛(FM)患者肠道微生态的影响.方法:选取2019年6月至2022年5月中国中医科学院广安门manbet官网登录 收治的完成12周路氏八段锦习练且干预后疼痛视觉模拟评分法评分改善不小于50%的FM患者10例.在路氏八段锦习练前后留取新鲜粪便样本,提取粪便样本的总DNA,根据16S rDNA编码基因的V3-V4高变区设计引物进行扩增,使用HiSeq平台进行高通量测序,比较干预前后肠道菌群的差异.结果:路氏八段锦可以显著降低FM患者疼痛视觉模拟评分法、修订版纤维肌痛症影响问卷、贝克抑郁量表和多维疲劳量表评分.测序后共获得1 404 904条有效序列,平均每个样本序列数有70 245.2条,平均有效长度419.75 bp.路氏八段锦干预前后患者肠道微生物的Alpha和Beta多样性差异无统计学意义,干预后多个菌在门和属水平都有相应增高或降低的趋势,但差异无统计学意义,线性判别分析的结果表明韦荣氏球菌属为干预前相对丰度增加且差异有统计学意义的菌属.结论:路氏八段锦可能通过调节以韦荣氏球菌属为代表的肠道微生物发挥治疗FM的作用.
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编辑人员丨1个月前