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北京市儿童A族链球菌 emm基因型别及药敏特征变化分析
编辑人员丨1周前
目的:了解北京市儿童A族链球菌(GAS)M蛋白基因( emm基因)型别及药敏特征变化。 方法:回顾性研究。收集2018年、2019年、2021年北京市16区猩红热病原学监测哨点manbet官网登录 儿童临床诊断猩红热及咽部感染病例咽拭子样本分离的GAS菌株。采用PCR扩增及测序进行 emm基因分型,采用微量肉汤稀释法测定10种抗生素最低抑菌浓度(MIC)。采用 χ2检验和 Fisher′ s确切概率法进行组间比较。 结果:共收集GAS菌株557株,检测到11种 emm基因型( emm1、 emm3、 emm4、 emm6、 emm11、 emm12、 emm22、 emm75、 emm89、 emm128、 emm212)。其中 emm1型42.73%(238/557株), emm12型48.65%(271/557株),其他 emm型8.62%(48/557株)。 emm1、 emm12、其他 emm型2018年分别为37.50%(105/280株)、57.14%(160/280株)、5.36%(15/280株);2019年分别为49.05%(129/263株)、39.54%(104/263株)、11.41%(30/263株);2021年分别为28.57%(4/14株)、50.00%(7/14株)、21.43%(3/14株)。2018年和2019年≤6岁儿童组中感染 emm12型的构成比均高于>6岁儿童组(62.50%比46.88%,46.36%比30.36%),差异均有统计学意义(χ 2=7.182、6.973,均 P<0.05)。选取225株GAS进行药敏检测,结果对青霉素、左氧氟沙星、美罗培南、利奈唑胺、头孢噻肟、头孢吡肟、万古霉素7种抗生素敏感率均为100.00%,对红霉素、四环素、克林霉素的耐药率分别为:2018年88.57%(93/105株)、87.62%(92/105株)、86.67%(91/105株);2019年94.34%(100/106株)、94.34%(100/106株)、87.74%(93/106株);2021年3种抗生素耐药率100.00%(14/14株)。2018年青霉素MIC 50、MIC 90均为0.03 mg/L;2019年分别为0.03 mg/L、0.06 mg/L;2021年均为0.06 mg/L。225株GAS中207株存在耐药,且均为联合耐药,红霉素-四环素-克林霉素三重耐药占94.69%(196/207株),红霉素-克林霉素双重耐药占4.35%(9/207株),红霉素-四环素双重耐药占0.97%(2/207株)。 结论:北京市2018年、2019年、2021年儿童GAS的 emm基因型别多样,优势基因型为 emm12与 emm1,以 emm12为主导流行型别。GAS菌株对红霉素、克林霉素、四环素维持较高耐药率,对青霉素等抗生素保持敏感,但青霉素MIC 50和MIC 90呈递增趋势。
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编辑人员丨1周前
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深圳儿童酿脓链球菌分离株多基因序列分型
编辑人员丨1周前
目的:探讨酿脓链球菌,即β溶血性A族链球菌(GAS)在深圳的流行病学特征。方法:对2016年1月至2018年12月深圳市儿童manbet官网登录 分离的GAS流行克隆群进行多基因序列分型(MLST)回顾性分析。本研究中32株分属于7个不同 emm分型的GAS菌株分别来自32例患有脓疱病、蜂窝组织炎、猩红热、脓毒症、肺炎、阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征、支气管炎、过敏性鼻炎、臀部脓肿、过敏性紫癜或咽扁桃体炎的患儿,分离自咽拭子23份,痰液5份,脓液3份和血液1份。应用聚合酶链反应技术对32株GAS菌株的7对等位看家基因( gki、 gtr、 murI、 mutS、 recP、 xpt和 yqiL)进行扩增,对目标基因产物进行测序。然后将获得的每个等位基因的基因序列提交至MLST网站,以获得相应的等位基因谱。最后将等位基因谱再次提交至MLST网站,以确认序列分型(ST)。 结果:emm 1.00及其亚型、 emm 4.00、 emm 12.00及其亚型、 emm 22.00、 emm 28.00、 emm 75.00和 emm 89.00的GAS克隆群分别属于MLST分型中的ST28、ST39、ST36、ST46、ST52、ST49和ST921。 结论:2016年至2018年导致深圳地区儿童感染的GAS分离株的MLST流行克隆群分别为ST28、ST39、ST36、ST46、ST52、ST49和ST921。
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编辑人员丨1周前
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海南省2022年emm12型A族链球菌基因组及药物敏感性特征分析
编辑人员丨2周前
目的 了解海南emm12型A族链球菌(group A Streptococcus,GAS)基因组特征及对目前常用抗菌药物的敏感性,为猩红热等GAS相关疾病提供病原学数据.方法 基于2022年海南省呼吸道症候群监测获得的咽拭子分离GAS菌株,应用高通量测序技术对所分离菌株进行基因组测序和emm基因分型、基因多位点序列分型(multi-locus se-quence typing,MLST)、耐药基因与毒力基因预测,利用MEGA 10.1.8最大似然法(maximum likelihood,ML)绘制系统进化树.采用微量肉汤稀释法测定最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)进行药敏试验.结果 2022年海南呼吸道症候群监测分离的4株GAS分离株均为emm12/ST36型,毒力基因除emm基因外,共检测到7种超抗原基因speB(100%)、speI(75%)、speH(75%)、speC(100%)、ssa(100%)、sme Z(100%)、speG(100%).所有菌株均携带大环内酯类耐药基因ermB和ermTM、四环素耐药基因tet(M),均不携带耐药基因mefA,对红霉素、克林霉素、四环素耐药率100%,对青霉素仍保持高度敏感.系统进化树分析显示,海南分离株均集中在同一分支上.结论 2022年海南GAS优势基因型为emm12型,MLST分型与emm分型具有一致性.携带的耐药基因与药敏实验结果一致,海南地区青霉素等β-内酰胺类药物可继续作为GAS临床治疗首选药物,需扩大菌株量进一步监测.
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编辑人员丨2周前
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北京地区儿童A组链球菌感染临床分离株的emm分型研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解2015年北京地区分离自呼吸道感染患儿的A组链球菌(GAS)emm型别分布情况.方法 采集2015年5月至7月北京市16个区16家manbet官网登录 儿科门、急诊临床猩红热病例和咽部感染病例咽拭子标本分离的GAS菌株.应用PCR扩增联合基因测序技术,测定emm型别,并比较不同特征组间的emm基因型别差异.结果 从各区manbet官网登录 采集的咽拭子标本中分离247株GAS菌株.其中来自猩红热患儿73株(29.6%,73/247),咽部感染患儿174株(70.4%,174/247).共检测到6种emm基因型,emm12占53.4%(132/247),emm1占44.1%(109/247),其他型别(emm22、emm75、emm131、emm241)占2.5%(6/247).emm型别的分布在不同年龄组间存在差异,且差异有统计学意义(P<0.05),emm1在6~12岁年龄组中的构成比较高,emm12在1~5岁组中构成比较高.emm型别在地区、性别、疾病类型间差异无统计学意义(P>0.05).结论 2015年北京地区儿童A组链球菌的emm基因型中,主要的流行型别为emm12和emm1,其分布不同年龄组间存在差异.
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编辑人员丨2023/8/6
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116株儿童感染致病性A组链球菌流行病学特征分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究儿童感染致病性A组链球菌的流行特征,为临床感染控制提供指导. 方法 收集患儿咽拭子和皮肤化脓性感染伤口分泌物标本1921份,从中分离和鉴定致病性A组链球菌,检测emm基因分型. 结果 从1921份标本中分离出116株致病性A组链球菌,其中<3岁的学龄前儿童、3~岁的学龄儿童、≥7岁的学龄儿童分别分离出26、39和51株,分离率分别为5.32%、6.18%和6.37%,分离率差异有统计学意义(x2=70.6207,P<0.05).从男性和女性患儿中分别分离出69和47株菌株,分离率分别为6.74%和5.23%,分离率差异有统计学意义(x2=8.3448,P<0.05).分别从急性咽炎、化脓性扁桃体炎、急性风湿、皮肤化脓感染、呼吸道感染、猩红热、银屑病以及其他疾病患儿中分离出42、32、15、13、9、2、1和2株.致病性A组链球菌emm基因型1型、12型、18型、110型、65型、11型、101型、75型以及其他型别分别为49、31、10、8、7、5、1、1和4株,分别占42.24%%、26.72%、8.62%、6.90%、6.03%、4.31%、0.86%、0.86%和3.45%. 结论 致病性A组链球菌主要感染人群为>7岁的男性学龄儿童,菌株感染主要诱发急性咽炎和化脓性扁桃体炎,emm1型为流行菌株.积极监测致病性A组链球菌菌株特征有利于感染的防控.
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编辑人员丨2023/8/6
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2016年北京市昌平区A组乙型溶血性链球菌及相关菌株检测和分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 对2016年北京市昌平区猩红热病原学监测结果进行分析.方法 利用qPCR方法与传统划线分离方法检测病例携带A组乙型溶血性链球菌(GAS)的阳性率,对分离出的GAS进行emm分型.利用16S rRNA和梅里埃VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析系统对检测出的非GAS菌株进行鉴定.结果 2016年昌平区采集的132份病例样本中,通过平板划线分离检出GAS 13株(阳性率9.85%),通过qPCR检出GAS 19株(阳性率14.39%).分离出的GAS的emm型别为emm1和emm12.分离出可培养的非GAS菌种63株,分属于5个不同菌属,共计13种菌种.结论 昌平地区GAS的emm型别较为单一,利用qPCR方法比平板划线分离方法更敏感,检测出的阳性GAS率更高.通过分离咽拭子中其他菌株,同时使用16S rRNA方法和梅里埃VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析鉴定,两者阳性率有差异, 16S rRNA方法更准确.
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编辑人员丨2023/8/6
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A组链球菌致儿童急性肾小球肾炎病原学研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究致儿童急性肾小球肾炎A组链球菌 (GAS) 致病基因及耐药.方法 选取本院2014年1月-2017年6月期间收治急性链球菌感染后肾炎患儿为研究对象.采用微量肉汤稀释法测定最小抑菌浓度 (MIC) 对青霉素、红霉素、氯霉素、环丙沙星、四环素、头孢曲松和万古霉素7种临床常用抗生素进行药敏试验.设计emm基因、SpeB基因、NudA基因和NudB基因, 并进行PCR扩增.采用BLAST将产物序列与GenBank中进行同源性比对, 并对结果判读.结果 本次研究中共成功分离出GAS菌株113株, 其中2~6岁71例, 6~11岁42例.GAS分离株未对青霉素、环丙沙星和万古霉素产生耐药性.对红霉素、氯霉素、四环素和头孢曲松耐药率分别为99.12% (112株) 、90.27% (102株) 、84.96% (96株) 和2.65% (3株) .对单一抗生素耐药为7株 (6.19%), 对两种抗生素耐药13株 (11.50%), 对三种以上抗生素耐药93株 (82.30%) .GAS分型:emm2型6株, emm4型10株, emm12型72株, emm25型3株, emm49型6株, emm57型4株, emm61型12株.113株GAS中, 56株携带Aph3基因 (49.56%), 71株携带Aac6-I基因 (62.83%), 96株携带tetM基因 (84.96%), 113株携带链球菌外毒素B (100%), NudA和NudB各检出61株, 携带率为53.98%.结论 随着广谱类抗生素的应用, A组链球菌感染儿童急性肾小球肾炎日益减少, 但耐药程度越来越高.
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编辑人员丨2023/8/6
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2012-2016年天津市猩红热患儿A组链球菌病原学特征分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析天津市2012—2016年猩红热患儿A组链球菌(GAS)病原学特征.方法 以2012—2016年天津市猩红热监测点manbet官网登录 被临床诊断为猩红热患儿为研究对象,排除标准为无法配合采样的猩红热患儿,共采集575例患儿的咽拭子.采用生化方法,对咽拭子进行细菌的分离和鉴定;采用PCR方法,对分离株进行emm基因分型和超抗原基因speA、speC检测;使用K-B纸片法测定菌株对10种抗生素的耐药性.比较不同emm基因分型GAS超抗原基因携带情况,以及所有GAS对不同抗生素耐药情况.结果 共分离得到198株GAS,检出5个emm型别,即emm1/11/12/22/89,优势型别为emm12型(52.9%,100株)和emm1型(44.4%,84株).speA和speC基因的携带率分别为21.7%(41株)和76.7%(145株),emm1型GAS的speA基因携带率为33.3%(28株),高于emm12型[12.0%(12株)](χ2=12.21,P<0.001),emm1型GAS speA和speC基因同时携带率为27.4%(23株),高于emm12型[12.0%(12株)](χ2=7.01,P=0.008).对阿奇霉素、红霉素、克拉霉素、克林霉素、四环素、左氧氟沙星和氯霉素的耐药率分别为96.8%(183株)、96.3%(182株)、92.1%(174株)、92.1%(174株)、73.0%(138株)、2.1%(4株)和1.6%(3株),未发现对青霉素、头孢唑啉和万古霉素耐药,差异有统计学意义(χ2=953.28,P<0.001).结论 emm12和emm1型GAS是导致天津市儿童发生猩红热的2个优势型别,其携带speA和speC基因情况不同;GAS对青霉素、头孢唑林和万古霉素敏感,对克林霉素、克拉霉素、红霉素和阿奇霉素高度耐药.
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编辑人员丨2023/8/6
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北京市2015-2017年猩红热及咽部感染患者A组链球菌超抗原基因特征研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析2015-2017年北京市猩红热及咽部感染患者A组链球菌(GAS)超抗原基因特征.方法 采集猩红热及咽部感染患者咽拭子标本进行GAS分离鉴定,采用实时荧光PCR法检测超抗原基因(speA、speC、speG、speH、speI、speJ、speK、speL、speM、smeZ和ssa),PCR法扩增后测序确定GAS的emm基因型别.结果 2015年5月至2017年7月采集的6 801份咽拭子标本中共分离到377株GAS菌株(阳性率5.5%).超抗原基因speC、speG、speH和speK的检出率3年间出现较明显变化.共检测到45种超抗原基因谱,占比较高的2种超抗原基因谱在emm1和emm12型间分布差异均有统计学意义(x2=38.196,P<0.001;x2=72.310,P<0.001).超抗原speA、speH、speI和speJ在emm1和emm12型GAS间分布差异均有统计学意义(x2=146.154,P<0.001;x2=52.31,P<0.001;x2=58.43,P<0.001;x2=144.70,P<0.001).结论 2015-2017年北京市猩红热及咽部感染患者GAS超抗原基因speC、speG、speH和speK的检出率有较明显变化,speA、speH、speI和speJ在emm1和emm12基因型之间的分布存在差异,GAS菌株所携带的超抗原基因谱更宽,但主要流行谱未发生改变.
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编辑人员丨2023/8/6
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心肌梗死患者细胞外基质金属蛋白酶诱导因子表达量与炎症反应、MMPs/TIMPs的相关性
编辑人员丨2023/8/6
目的:研究心肌梗死患者细胞外基质金属蛋白酶诱导因子(EMM PRIN)表达量与炎症反应 、基质金属蛋白酶(MM Ps)/TIMPs的相关性.方法:选择鄄城县第二人民manbet官网登录 2014年3月 ~2017年12月期间收治的急性心肌梗死的患者以及稳定型心绞痛的患者 、分别作为AMI组和SAP组,另取同期体检的健康志愿者作为对照组.采集外周血并测定EMM PRIN的表达量,采集血清并测定炎症细胞因子 、MM Ps/TIM Ps指标的含量.结果:AMI组和SAP组患者外周血中EMMPRIN的表达量及血清中ICAM1、VCAM1、IL-1β 、IL-17、MMP2、MM P8、MM P9的含量均显著高于对照组,TGF-β1、sFGL-2、TIM P1、TIMP2的含量均显著低于对照组且AMI组患者的上述指标变化较SAP组更为显著;AMI组患者外周血中EMM PRIN的表达量及血清中ICAM1、VCAM1、IL-1β 、IL-17、MMP2、MM P8、MM P9的含量均显著高于SAP组,TGF-β1、sFGL-2、TIM P1、TIMP2的含量均显著低于SAP组.AMI组中高EMMPRIN表达量患者血清中ICAM1、VCAM1、IL-1β 、IL-17、MMP2、MM P8、MMP9的含量均显著高于低EMM PRIN表达量患者,TGF-β1、sFGL-2、TIM P1、TIMP2的含量均显著低于低EMM PRIN表达量患者.结论:心肌梗死患者外周血中EMM PRIN的高表达能够加剧炎症反应 、破坏MMPs/TIM Ps平衡.
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编辑人员丨2023/8/6