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基于hnRNPF调控的TLR4/NF-κB信号通路研究肾元颗粒对糖尿病肾脏病炎症的影响
编辑人员丨3周前
目的:基于hnRNPF调控的TLR4/NF-κB信号通路探讨肾元颗粒对db/db糖尿病肾脏病小鼠炎症的影响及其作用机制.方法:将16只SPF级db/db小鼠随机分为模型组和肾元颗粒组,予0.2%腺嘌呤模型饲料;另取8只同背景系野生小鼠作为空白组,予普通饲料.肾元颗粒组予以肾元颗粒混悬液灌胃给药,模型组和空白组小鼠予等量双蒸水灌胃,连续12周.给药12周后代谢笼收集小鼠24 h尿液,取各组小鼠血清、肾脏组织.生化检测各组小鼠血清肌酐(SCr)、血尿素氮(BUN)、谷丙转氨酶(ALT);ELISA法检测尿液中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白(NGAL)水平;PAS染色光镜观察肾组织病理改变;R-T PCR法检测小鼠肾脏组织中TLR4 mRNA、IL-6 mRNA、IKKα mRNA、NF-κB P65 mRNA、TNF-α mRNA、hnRNPF mRNA表达水平;Western blotting检测肾脏组织中hnRNPF、TLR4蛋白表达及IKKα、NF-κB P65磷酸化水平.结果:模型组小鼠血清SCr、BUN、ALT显著高于空白组(P<0.05);肾元颗粒组小鼠血清SCr、BUN、ALT显著低于模型组(P<0.05).模型组小鼠尿液NGAL水平显著高于空白组(P<0.05);肾元颗粒组小鼠尿液NGAL水平明显低于模型组(P<0.05).与空白组比较,模型组小鼠肾脏组织病变严重;与模型组比较,肾元颗粒组小鼠肾脏病变有所改善.模型组小鼠肾脏组织中TLR4 mRNA、IL-6 mRNA、IKKα mRNA、NF-κB P65 mRNA、TNF-α mRNA相对表达量高于空白组(P<0.05),hnRNPF mRNA相对表达量低于空白组(P<0.05);肾元颗粒组小鼠肾脏组织中TLR4 mRNA、IL-6 mRNA、IKKα mRNA、NF-κB P65 mRNA、TNF-α mRNA相对表达量低于模型组(P<0.05),hnRNPFmRNA相对表达量高于模型组(P<0.05).模型组小鼠肾脏组织中hnRNPF蛋白相对表达量低于空白组(P<0.05),TLR4蛋白相对表达量及IKKα、NF-κB P65磷酸化水平高于空白组(P<0.05);肾元颗粒组小鼠肾脏组织中hnRNPF蛋白相对表达量高于模型组(P<0.05),TLR4蛋白相对表达量及IKKα、NF-κB P65磷酸化水平低于模型组(P<0.05).结论:肾元颗粒可能通过hnRNPF调控的TLR4/NF-κB信号通路,抑制db/db糖尿病肾脏病小鼠炎症反应,从而改善相关生化指标,减轻肾脏损害.
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编辑人员丨3周前
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HNRNPF促进前列腺癌的增殖、迁移和侵袭
编辑人员丨2024/3/16
目的 研究核不均一核糖核蛋白F(heterogeneous nuclear ribonucleoproteins F,HNRNPF)在前列腺癌中的表达、临床相关性及其对前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响.方法 使用TCGA和GEO数据库分析HNRNPF在前列腺癌中的表达特征、免疫浸润特征及其与前列腺癌患者临床病理特征的相关性.使用RNA干扰在前列腺癌细胞PC-3和DU145中沉默HNRNPF基因,使用CCK-8、EdU和集落形成实验检测细胞增殖能力的改变,使用Transwell和划痕愈合实验检测细胞迁移、侵袭能力的改变.结果 相比正常前列腺组织,HNRNPF在前列腺癌组织中的表达量显著升高.HNRNPF的表达量与前列腺癌患者的T分期、Gleason评分、前列腺特异性抗原以及多种免疫细胞的浸润水平显著相关.HNRNPF高表达的患者总生存期和疾病特异性生存期较短.沉默HNRNPF基因显著抑制了PC-3和DU145细胞的增殖、迁移、侵袭能力.结论 HNRNPF是一个在前列腺癌中高表达的基因,具有显著临床相关性,且能够促进前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭.
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编辑人员丨2024/3/16
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miR-139通过沉默B细胞转位基因3(BTG3)抑制肝细胞癌细胞的增殖
编辑人员丨2023/8/6
目的 初步阐明miR-139在肝细胞癌(HCC)发展过程中的作用及其介导的信号通路.方法 通过CCK-8实验验证miR-139对HCC增殖的影响;运用TargetScan、MiRanda、Clip-seq和miRDB四组数据库对miR-139下游可能存在的通路进行预测,结合文献回顾,寻找出miR-139在HCC中可能存在的靶点.Western blot法验证靶点受miR-139调节的情况,双荧光素酶报告基因分析验证miR-139与靶点的相关性.结果 通过CCK-8实验证明,miR-139具有抑制肝癌细胞增殖的作用;利用4个数据库交叉比对和文献回顾,筛选得到5个感兴趣的潜在基因,包括细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂(ICK)、B细胞异位基因3(BTG3)、含CUB和LCCL结构域盘状蛋白2(DCBLD2)、真核起始因子4F(EIF4G2)和核不均一核糖核蛋白F(HNRNPE).Western blot实验和双荧光素报告分析发现miR-139在肝细胞肝癌中具有直接抑制BTG3基因表达的作用.结论 miR-139可以直接调控BTG3基因的表达,影响肝癌细胞增殖.
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编辑人员丨2023/8/6
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低氧微环境下胶质瘤干细胞表型的改变与RNA结合蛋白相关
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究低氧微环境下胶质瘤干细胞表型变化与RNA结合蛋白表达之间的关系.方法1% O2的低氧条件培养胶质瘤干细胞U87MG-SLC和GSC5,20% O2为常氧对照.分别利用MTS实验和肿瘤球形成实验检测其增殖能力和自我更新能力;Western blot检测干性相关蛋白和RNA结合蛋白表达水平的变化;通过吸光度扫描进行统计分析.结果 低氧条件下肿瘤干细胞的增殖能力下降(P<0.05),自我更新能力上升(P<0.05),HIF-1α和干性标志物Nestin和SOX2上调(P<0.01;P<0.05).与常氧组相比,低氧组胶质瘤干细胞的多种RNA结合蛋白表达水平发生变化:hnRNPF、UNRIP以及HuD表达水平上调(P<0.05),PCBP2和UNR表达水平下调(P<0.01;P<0.05),而其他RNA结合蛋白(hnRNPK、ADAR1、PCBP1、CIRP、EBP1、eEF1A、PTBP1、PTBP2)表达水平没有显著性变化.结论 低氧微环境下,胶质瘤干细胞的表型变化与RNA结合蛋白hnRNPF、UNRIP、HuD、PCBP2和UNR表达水平相关.
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编辑人员丨2023/8/6
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hnRNPF在胰腺癌中的表达及临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的:研究核内不均一性核糖核蛋白F(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F,hnRNPF)mRNA水平在胰腺癌中的表达及临床意义.方法:采用TCGA全基因组mRNA测序资料研究hnRNPF在消化系统肿瘤与正常组织间的差异,分析其表达水平与临床病理资料的相关性,并进行生存分析判断其预后价值.结果:hnRNPF在不同消化系统肿瘤中的表达较正常组织明显增高,差异具有统计学意义(P <0.001),其中胰腺癌中差异倍数最大.hnRNPF在胰腺癌组织中的表达与肿瘤TNM分期(P=4.95E-03)、浸润深度(P=5.22E-03)相关,与年龄、性别、淋巴结浸润、慢性胰腺炎病史无统计学差异.hnRNPF在胰腺癌组织中的表达高低与总生存期有统计学意义(P =0.034 31).结论:hnRNPF mRNA在不同的消化系统肿瘤中表达都增高,在胰腺癌中,hnRNPF高表达是预后不良的因素,可以作为判断预后的有效生物标志物.
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编辑人员丨2023/8/6
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前列腺癌相关基因、癌组织差异表达基因及预后相关基因筛选
编辑人员丨2023/8/5
目的 筛选前列腺癌(PCa)相关基因、癌组织关键差异表达基因和预后相关基因,为PCa患者提供新的研究靶点.方法 选择GEO数据库中GSE104131数据集,对PCa组织基因进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),获得与PCa组织相关性最高的关键基因模块及与关键基因模块、PCa均高度相关的关键基因,然后对关键基因模块进行信号通路富集分析.基于GSE69223、GSE104131数据集,比较PCa组织及正常癌旁组组中的关键基因表达水平,筛选有统计学差异的关键基因(关键差异表达基因).最后基于GEPIA2数据库,对不同关键差异表达基因水平的PCa患者进行生存分析,筛选与PCa预后相关的基因.结果 WGCNA分析获得棕色模块为关键基因模块,其主要富集于内质网中的蛋白质加工通路;关键基因有14个,分别是P4HB、ERGIC1、FOXA1、RP11-498C9.2、HNRNPF、CANT1、SYNGR2、HID1、EIF2AK1、MARCKSL1、NME1、ST14、HPN、RAB3D;与正常癌旁组织比较,关键基因在PCa组织中表达水平均高(P<0.05),14个关键基因均为关键差异表达基因.P4HB、ERGIC1、RP11-498C9.2高表达较低表达的患者DFS更长,HNRNPF低表达患者较高表达的患者OS更长(P<0.05).P4HB、ERGIC1、RP11-498C9.2、HNRNPF为PCa预后相关基因.结论 PCa相关基因、癌组织关键差异表达基因均为14个,其中P4HB、ERGIC1、RP11-498C9.2及HNRNPF为PCa预后相关基因.
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编辑人员丨2023/8/5