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目的 运用网络药理学方法和分子对接技术探讨甘草治疗异位性皮炎(AD)的潜在有效成分及作用机制.方法 2021年9月至2022年4月利用TCMSID数据库结合文献调研收集甘草的化学成分,根据各成分的靶点选择性、成药性、潜在毒性等性质进行成分过滤;运用SEA、SwissTargetPrediction、PPB2以及TargetNet平台对甘草化学成分进行靶点预测并利用Python代码对预测靶点名称进行标准化和不同网站的靶点结果合并;通过OMIM和GeneCards5.0数据库检索AD的相关靶点;将AD靶点与甘草成分预测靶点取交集后运用Cytoscape 3.9.0软件构建"中药-成分-靶点"网络,并获得甘草成分抗AD的潜在靶点和活性成分;采用DAVID V6.8数据库对甘草成分抗AD的潜在靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并构建"中药-靶点-通路"网络;利用String数据库和Cytoscape 3.9.0软件构建蛋白相互作用(PPI)网络;通过整合"中药-成分-靶点"网络、"中药-靶点-通路"网络和PPI网络,构建"中药-成分-靶点-通路"网络,并筛选得到甘草抗AD的核心靶点;最后使用MOE软件对甘草抗AD的活性成分与核心靶点进行分子对接.结果 筛选得到甘草活性成分29个,成分抗AD潜在靶点47个;"中药-成分-靶点"网络显示甘草查尔酮C、芒柄花素、异甘草素、异甘草苷、甘草酸

作者:杨素青;沈成英;周莉华;李靖阳;申宝德;胡建新

来源:安徽医药 2023 年 27卷 8期

知识库介绍

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作者:
杨素青;沈成英;周莉华;李靖阳;申宝德;胡建新
来源:
安徽医药 2023 年 27卷 8期
标签:
甘草 皮炎,特应性 网络药理学 靶点预测 分子对接 Licorice Dermatitis,atopic Network pharmacology Target prediction Molecular docking
目的 运用网络药理学方法和分子对接技术探讨甘草治疗异位性皮炎(AD)的潜在有效成分及作用机制.方法 2021年9月至2022年4月利用TCMSID数据库结合文献调研收集甘草的化学成分,根据各成分的靶点选择性、成药性、潜在毒性等性质进行成分过滤;运用SEA、SwissTargetPrediction、PPB2以及TargetNet平台对甘草化学成分进行靶点预测并利用Python代码对预测靶点名称进行标准化和不同网站的靶点结果合并;通过OMIM和GeneCards5.0数据库检索AD的相关靶点;将AD靶点与甘草成分预测靶点取交集后运用Cytoscape 3.9.0软件构建"中药-成分-靶点"网络,并获得甘草成分抗AD的潜在靶点和活性成分;采用DAVID V6.8数据库对甘草成分抗AD的潜在靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并构建"中药-靶点-通路"网络;利用String数据库和Cytoscape 3.9.0软件构建蛋白相互作用(PPI)网络;通过整合"中药-成分-靶点"网络、"中药-靶点-通路"网络和PPI网络,构建"中药-成分-靶点-通路"网络,并筛选得到甘草抗AD的核心靶点;最后使用MOE软件对甘草抗AD的活性成分与核心靶点进行分子对接.结果 筛选得到甘草活性成分29个,成分抗AD潜在靶点47个;"中药-成分-靶点"网络显示甘草查尔酮C、芒柄花素、异甘草素、异甘草苷、甘草酸