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根据GenBank上发表的IBV S2基因序列,自行设计了两对引物,分别扩增SD/97/02株S2基因的上游1100bp部分和下游的900bp部分,两段序列拼接后包含了S2全基因的序列.将此两段分别克隆入pGEM T-easy载体,测序后将序列用分析软件DNASTAR和网上的BLAST软件进行分析,结果表明,S2基因比S1基因相对来说更保守,位于氨基酸第560~600位很可能是与囊膜锚着的部位,而S2与S1的交界处以HRRRR为特征,这不同于常规的RRF/SRR.

作者:潘杰彦;陈德胜;戴亚斌;陈溥言

来源:病毒学报 2001 年 17卷 4期

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作者:
潘杰彦;陈德胜;戴亚斌;陈溥言
来源:
病毒学报 2001 年 17卷 4期
标签:
传染性支气管炎病毒 腺胃分离株 S2基因 序列分析
根据GenBank上发表的IBV S2基因序列,自行设计了两对引物,分别扩增SD/97/02株S2基因的上游1100bp部分和下游的900bp部分,两段序列拼接后包含了S2全基因的序列.将此两段分别克隆入pGEM T-easy载体,测序后将序列用分析软件DNASTAR和网上的BLAST软件进行分析,结果表明,S2基因比S1基因相对来说更保守,位于氨基酸第560~600位很可能是与囊膜锚着的部位,而S2与S1的交界处以HRRRR为特征,这不同于常规的RRF/SRR.