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为研究肠道气泡堆积对银鲳(Pampus argenteus)肠道菌群的影响,2019年3月于东海水产研究所福鼎研究中心采集了15尾肠道气泡堆积的银鲳为病鱼组,15尾健康银鲳为健康鱼组,并通过16SrDNA基因DNA高通量测序技术结合LEfSe分析方法,对两组样品间菌群结构和多样性进行对比分析.结果 显示,病鱼组肠道菌群多样性与健康鱼组无显著差异(P>0.05),但病鱼组肠道菌群的均匀度和相对丰度都显著低于健康鱼组(P<0.05).两组样品的优势菌群均为变形菌门(Proteobacteria),且相对丰度都较大(超过97%).此外,利用LEfSe分析两组样品发现,病鱼组中如根瘤菌(Rhizobium)、栖热菌(Thermus)等好氧菌丰度显著高于健康鱼组,而不动肝菌(Acinetobacter)、微酸菌(Ilumatobacter)等显著低于健康鱼组,蓝细菌(Cyanobacteria)相对丰度显著高于健康鱼组.由此可以表明,肠道气泡堆积很可能会引发肠道菌群紊乱.

作者:郑迪;王倩;王磊;施兆鸿;彭士明

来源:动物学杂志 2020 年 55卷 2期

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作者:
郑迪;王倩;王磊;施兆鸿;彭士明
来源:
动物学杂志 2020 年 55卷 2期
标签:
银鲳 气泡堆积 高通量测序 肠道菌群
为研究肠道气泡堆积对银鲳(Pampus argenteus)肠道菌群的影响,2019年3月于东海水产研究所福鼎研究中心采集了15尾肠道气泡堆积的银鲳为病鱼组,15尾健康银鲳为健康鱼组,并通过16SrDNA基因DNA高通量测序技术结合LEfSe分析方法,对两组样品间菌群结构和多样性进行对比分析.结果 显示,病鱼组肠道菌群多样性与健康鱼组无显著差异(P>0.05),但病鱼组肠道菌群的均匀度和相对丰度都显著低于健康鱼组(P<0.05).两组样品的优势菌群均为变形菌门(Proteobacteria),且相对丰度都较大(超过97%).此外,利用LEfSe分析两组样品发现,病鱼组中如根瘤菌(Rhizobium)、栖热菌(Thermus)等好氧菌丰度显著高于健康鱼组,而不动肝菌(Acinetobacter)、微酸菌(Ilumatobacter)等显著低于健康鱼组,蓝细菌(Cyanobacteria)相对丰度显著高于健康鱼组.由此可以表明,肠道气泡堆积很可能会引发肠道菌群紊乱.