目的 建立变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)技术与焦磷酸测序技术对小核核糖核蛋白多肽N(small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N,SNRPN)基因rs220030位点的分型方法.建立应用焦磷酸测序技术分析CpG甲基化状态的方法,探讨rs220030位点用于亲缘等位基因判定的可行性. 方法 应用DGGE技术对97例上海地区汉族家系血样rs220030位点进行分型,同时应用焦磷酸测序技术对其中25例血液来源的家系样本的rs220030位点分型,并对两种方法在SNP分型结果上进行比较.通过重亚硫酸盐修饰联合焦磷酸测序技术分析随机2组家系样本rs220030位点上游CpG甲基化状态,判断甲基化是否有亲缘相关性. 结果 经DGGE检测97例家系血样rs220030位点分型结果为C纯合子20例,T纯合子29例,C/T杂合子48例.经焦磷酸测序检测25例血液来源的家系样本结果与DGGE检测结果一致.经重亚硫酸盐修饰联合焦磷酸测序技术分析,2组血液来源的家系子代的rs220030位点上游CpG甲基化状态均与母亲较相似.结论 相比DGGE技术,焦磷酸测序技术更精确、方便,适合大样本、高通量SNP分型.重亚硫酸盐修饰联合焦磷酸测序技术可以精确分析CpG甲基化状态.rs220030位点可用于亲缘等位基因判定.
作者：李辉；徐红梅；赵赟；李备栩；周怀谷；赵子琴
来源：法医学杂志 2013 年 29卷 2期
