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目的 采用代谢组学技术研究深静脉血栓形成(deep venous thrombosis,DVT)大鼠尿液中代谢物谱,筛选出可用于DVT诊断和法医学鉴定的小分子生物标志物. 方法 建立下腔静脉完全结扎DVT大鼠模型,分为模型组、假手术组和对照组,每组各10只.模型组和假手术组大鼠在建模后48h于代谢笼中收集24h尿液,同时对照组收集24h尿液.核磁共振检测其代谢物谱,SIMCA-P 14.1软件进行模式识别,通过正交偏最小二乘法-判别分析(orthogonal PLS-DA,OPLS-DA)模型中的变量权重重要性排序(variable importance in projection,VIP)值结合Mann-Whitney U检验,寻找尿液中差异代谢物.结果 模型组、假手术组和对照组大鼠尿液的代谢轮廓呈现显著性差异.通过偏最小二乘法-判别分析(partial least squares method-discriminant analysis,PLS-DA)模型可以有效判别模型组、假手术组与对照组.与对照组大鼠相比,DVT大鼠尿液中亮氨酸、谷氨酰胺、肌酸、肌酐和蔗糖水平上调,3-羟基丁酸、乳酸、丙酮、α-酮戊二酸、柠檬酸和马尿酸水平下调.结论 DVT大鼠尿液中的差异代谢物有望成为该疾病的候选生物标志物,该结果可为DVT的诊断、治疗和法医学鉴定提供研究基础.

作者:曹洁;吕晓革;李宇;靳茜茜;储晓云;王英元;孙俊红

来源:法医学杂志 2018 年 34卷 3期

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作者:
曹洁;吕晓革;李宇;靳茜茜;储晓云;王英元;孙俊红
来源:
法医学杂志 2018 年 34卷 3期
标签:
法医病理学 代谢组学 深静脉血栓形成 核磁共振 模式识别 大鼠 尿
目的 采用代谢组学技术研究深静脉血栓形成(deep venous thrombosis,DVT)大鼠尿液中代谢物谱,筛选出可用于DVT诊断和法医学鉴定的小分子生物标志物. 方法 建立下腔静脉完全结扎DVT大鼠模型,分为模型组、假手术组和对照组,每组各10只.模型组和假手术组大鼠在建模后48h于代谢笼中收集24h尿液,同时对照组收集24h尿液.核磁共振检测其代谢物谱,SIMCA-P 14.1软件进行模式识别,通过正交偏最小二乘法-判别分析(orthogonal PLS-DA,OPLS-DA)模型中的变量权重重要性排序(variable importance in projection,VIP)值结合Mann-Whitney U检验,寻找尿液中差异代谢物.结果 模型组、假手术组和对照组大鼠尿液的代谢轮廓呈现显著性差异.通过偏最小二乘法-判别分析(partial least squares method-discriminant analysis,PLS-DA)模型可以有效判别模型组、假手术组与对照组.与对照组大鼠相比,DVT大鼠尿液中亮氨酸、谷氨酰胺、肌酸、肌酐和蔗糖水平上调,3-羟基丁酸、乳酸、丙酮、α-酮戊二酸、柠檬酸和马尿酸水平下调.结论 DVT大鼠尿液中的差异代谢物有望成为该疾病的候选生物标志物,该结果可为DVT的诊断、治疗和法医学鉴定提供研究基础.