您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览8 | 下载12

目的 探讨子痫前期患者相较正常孕妇胎盘组织中差异化表达基因及其临床意义,旨在揭示子痫前期可能的发病机制,为临床治疗奠定基础.方法 选择23例足月正常妊娠孕妇为对照组,26例子痫前期患者为观察组;对照组平均分娩孕周为40周,观察组平均分娩孕周为35周;两组平均年龄差异无统计学意义(P>0.05);两组均符合入组标准.采用Trizol法,选择对照组中的3例及观察组中的6例,提取其胎盘组织mRNA,将mRNA逆转录成cDNA,构建出文库.以Illumina HiSeq X10高通量测序平台对mRNA表达谱进行测序分析,在分子水平以FDR<0.05且|log2 FC|>1.2为标准筛选出两组胎盘组织差异表达基因.对差异表达基因进行GO term、KEGG pathway及DO term分析,应用生物信息学方法分析与子痫前期发生、发展密切相关的基因及关键信号通路.利用实时荧光定量PCR,选择对照组20例,观察组20例,验证差异表达基因.结果 9例测序样本均建库成功,样本标记为正常妊娠组(CK)、早发型子痫前期组(T1)、晚发型子痫前期组(T2),每组设置3个生物学重复,分别记作CK-1、CK-2、CK-3、T1-1、T1-2、T1-3、T2-1、T2-2、T2-3.平均每个文库的测序数据Q30>90%,说明测序数据质量可信,可用于后续进一步分析.观察组与对照组比较,观察组共发现51个差异化基因,其中12个基因表达上调,39

作者:金璟;何路路;陈园;张丽;刘国成

来源:广东医学 2023 年 44卷 9期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:8 | 下载:12
作者:
金璟;何路路;陈园;张丽;刘国成
来源:
广东医学 2023 年 44卷 9期
标签:
子痫前期 高通量测序 差异表达基因 生物信息学 preeclampsia high-throughput sequencing differentially expressed genes bioinformatics
目的 探讨子痫前期患者相较正常孕妇胎盘组织中差异化表达基因及其临床意义,旨在揭示子痫前期可能的发病机制,为临床治疗奠定基础.方法 选择23例足月正常妊娠孕妇为对照组,26例子痫前期患者为观察组;对照组平均分娩孕周为40周,观察组平均分娩孕周为35周;两组平均年龄差异无统计学意义(P>0.05);两组均符合入组标准.采用Trizol法,选择对照组中的3例及观察组中的6例,提取其胎盘组织mRNA,将mRNA逆转录成cDNA,构建出文库.以Illumina HiSeq X10高通量测序平台对mRNA表达谱进行测序分析,在分子水平以FDR<0.05且|log2 FC|>1.2为标准筛选出两组胎盘组织差异表达基因.对差异表达基因进行GO term、KEGG pathway及DO term分析,应用生物信息学方法分析与子痫前期发生、发展密切相关的基因及关键信号通路.利用实时荧光定量PCR,选择对照组20例,观察组20例,验证差异表达基因.结果 9例测序样本均建库成功,样本标记为正常妊娠组(CK)、早发型子痫前期组(T1)、晚发型子痫前期组(T2),每组设置3个生物学重复,分别记作CK-1、CK-2、CK-3、T1-1、T1-2、T1-3、T2-1、T2-2、T2-3.平均每个文库的测序数据Q30>90%,说明测序数据质量可信,可用于后续进一步分析.观察组与对照组比较,观察组共发现51个差异化基因,其中12个基因表达上调,39