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目的 运用网络药理学结合分子对接技术探讨蛇床子治疗阿尔茨海默病的作用机制.方法 借助TCMSP数据库获取蛇床子的活性成分及潜在作用靶点;检索 GeneCards、OMIM、DisGeNET 数据平台得到阿尔茨海默病的潜在作用靶点,筛选两者共同靶点;应用Cytoscape 3.7.1 构建蛋白相互作用(PPI)网络图并筛选发挥治疗作用的关键靶点,再借助R语言进行基因本体(GO)功能分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用AutoDock Vina软件,对核心靶点和药物主要活性成分进行分子对接,验证网络分析结果.结果 蛇床子包含主要活性成分 20 个,化学成分与疾病共同靶点 56 个,网络拓扑分析显示B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、雌激素受体α(ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶 2(PTGS2)、糖原合成酶激酶 3β(GSK3B)、半胱氨酸蛋白水解酶 3(CASP3)为关键靶点,通过调控神经活性配体-受体的相互作用、钙信号通路、p53 信号通路、多种细胞凋亡、磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路等发挥治疗作用.分子对接验证中受体与配体之间的结合能均≤-5.0 kcal/mol,结合性良好,其中O-乙酰二氢欧山芹酯、邻-异戊酰基二氢山芹醇、蛇床子素与核心靶点 GSK3B、PTGS2、Bcl-2 的对接亲合度较高.结论 蛇床子可通过多

作者:吴东霖;张鼎;秦红玲;李姿;晏杨;胡跃强

来源:现代药物与临床 2024 年 39卷 3期

知识库介绍

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吴东霖;张鼎;秦红玲;李姿;晏杨;胡跃强
来源:
现代药物与临床 2024 年 39卷 3期
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蛇床子 阿尔茨海默病 网络药理学 分子对接 O-乙酰二氢欧山芹酯 邻-异戊酰基二氢山芹醇 蛇床子素 Cnidii Fructus Alzheimer's disease network pharmacology molecular docking O-acetylcolumbianetin O-isovalerylcolum bianetin osthol
目的 运用网络药理学结合分子对接技术探讨蛇床子治疗阿尔茨海默病的作用机制.方法 借助TCMSP数据库获取蛇床子的活性成分及潜在作用靶点;检索 GeneCards、OMIM、DisGeNET 数据平台得到阿尔茨海默病的潜在作用靶点,筛选两者共同靶点;应用Cytoscape 3.7.1 构建蛋白相互作用(PPI)网络图并筛选发挥治疗作用的关键靶点,再借助R语言进行基因本体(GO)功能分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用AutoDock Vina软件,对核心靶点和药物主要活性成分进行分子对接,验证网络分析结果.结果 蛇床子包含主要活性成分 20 个,化学成分与疾病共同靶点 56 个,网络拓扑分析显示B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、雌激素受体α(ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶 2(PTGS2)、糖原合成酶激酶 3β(GSK3B)、半胱氨酸蛋白水解酶 3(CASP3)为关键靶点,通过调控神经活性配体-受体的相互作用、钙信号通路、p53 信号通路、多种细胞凋亡、磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路等发挥治疗作用.分子对接验证中受体与配体之间的结合能均≤-5.0 kcal/mol,结合性良好,其中O-乙酰二氢欧山芹酯、邻-异戊酰基二氢山芹醇、蛇床子素与核心靶点 GSK3B、PTGS2、Bcl-2 的对接亲合度较高.结论 蛇床子可通过多