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目的 通过网络药理学方法研究"栀子-刺五加"药对调节重度抑郁症(MDD)的药理机制,为MDD的治疗提供新的辅助治疗手段.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取栀子、刺五加的有效成分,并通过Pubchem数据库、Swiss Target Prediction数据库获取其作用靶点;通过GeneCards数据库获取MDD的疾病靶点,再通过Bioinformatic数据库绘制"栀子-刺五加"有效成分靶点与MDD疾病靶点韦恩图获取两者的交集靶点即为潜在治疗靶点;通过STRING获取潜在治疗靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.2 软件构建PPI网络图并进行拓扑分析;借助David数据库及R语言包对潜在治疗靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过R语言从GEO数据库获取MDD的差异表达基因(DEGs)并进行差异分析,再通过Bioinformatic数据库获取"栀子-刺五加"调节MDD的核心DEGs并进行统计学分析.结果 筛选出栀子有效成分32 个,刺五加有效成分31 个,有效成分靶点572 个,MDD疾病靶点10033 个,两者取交集共得到潜在治疗靶点 497 个;据Degree值筛选出核心成分有齐墩果酸(Oleanolic Acid)、熊果酸(Ursolic Acid)、烯醇酸B(Gardenolic Acid B)等;PPI网络拓扑分析显示关键治疗靶点有Akt1、白蛋白(AL

作者:杨法智;徐向青

来源:河北中医 2023 年 45卷 10期

知识库介绍

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作者:
杨法智;徐向青
来源:
河北中医 2023 年 45卷 10期
标签:
抑郁症 栀子 刺五加 网络药理学 Depression Gardenia Acanthopanax Network pharmacology
目的 通过网络药理学方法研究"栀子-刺五加"药对调节重度抑郁症(MDD)的药理机制,为MDD的治疗提供新的辅助治疗手段.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取栀子、刺五加的有效成分,并通过Pubchem数据库、Swiss Target Prediction数据库获取其作用靶点;通过GeneCards数据库获取MDD的疾病靶点,再通过Bioinformatic数据库绘制"栀子-刺五加"有效成分靶点与MDD疾病靶点韦恩图获取两者的交集靶点即为潜在治疗靶点;通过STRING获取潜在治疗靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.2 软件构建PPI网络图并进行拓扑分析;借助David数据库及R语言包对潜在治疗靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过R语言从GEO数据库获取MDD的差异表达基因(DEGs)并进行差异分析,再通过Bioinformatic数据库获取"栀子-刺五加"调节MDD的核心DEGs并进行统计学分析.结果 筛选出栀子有效成分32 个,刺五加有效成分31 个,有效成分靶点572 个,MDD疾病靶点10033 个,两者取交集共得到潜在治疗靶点 497 个;据Degree值筛选出核心成分有齐墩果酸(Oleanolic Acid)、熊果酸(Ursolic Acid)、烯醇酸B(Gardenolic Acid B)等;PPI网络拓扑分析显示关键治疗靶点有Akt1、白蛋白(AL