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目的 运用网络药理学和分子对接技术研究甘草泻心汤治疗白塞病(BD)的分子机制,为今后的研究提供参考.方法 运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取甘草泻心汤中七味药材的有效成分与作用靶点,并利用UniProt数据库将作用靶点基因加以注释和整合.通过GeneCard、PharmGkb、TTD、OMIM、DrugBank数据库获得BD疾病靶点,并与药物作用靶点取交集.使用Cytoscape 3.8.0 软件构建药物-成分-疾病靶点网络图;使用STRING数据库构建蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络,并用Cytoscape 3.8.0 软件进行分析;使用R×64 4.0.5 软件和脚本对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用 AutoDock Tools对核心靶点及核心成分进行分子对接验证.结果 共筛选出甘草泻心汤 236 个成分、3480 个靶点,986 个BD疾病靶点,63 个药物与疾病交集靶点,筛选出槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、豆甾醇、黄芩甙元、富马碱、汉黄芩素7 个核心成分,前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、白细胞介素18(IL-18)、CC趋化因子配体2(CCL2)、基质金属蛋白酶9(MMP-9)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、CXC 趋化因子配体 8(CXCL8)7 个核心靶点.共得到1804个GO条目,106 条KEGG通路,包含晚期糖

作者:郜晨静;罗亚萍;张宁;郝梦桃

来源:河北中医 2024 年 46卷 3期

知识库介绍

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作者:
郜晨静;罗亚萍;张宁;郝梦桃
来源:
河北中医 2024 年 46卷 3期
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贝赫切特综合征 甘草泻心汤 药理作用分子作用机制(中药) 网络药理学 分子对接 Behcet's disease Gancao Xiexin Decoction Molecular mechanism of the pharmacological action(Chinese medicine) Network pharmacology Molecular docking
目的 运用网络药理学和分子对接技术研究甘草泻心汤治疗白塞病(BD)的分子机制,为今后的研究提供参考.方法 运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取甘草泻心汤中七味药材的有效成分与作用靶点,并利用UniProt数据库将作用靶点基因加以注释和整合.通过GeneCard、PharmGkb、TTD、OMIM、DrugBank数据库获得BD疾病靶点,并与药物作用靶点取交集.使用Cytoscape 3.8.0 软件构建药物-成分-疾病靶点网络图;使用STRING数据库构建蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络,并用Cytoscape 3.8.0 软件进行分析;使用R×64 4.0.5 软件和脚本对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用 AutoDock Tools对核心靶点及核心成分进行分子对接验证.结果 共筛选出甘草泻心汤 236 个成分、3480 个靶点,986 个BD疾病靶点,63 个药物与疾病交集靶点,筛选出槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、豆甾醇、黄芩甙元、富马碱、汉黄芩素7 个核心成分,前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、白细胞介素18(IL-18)、CC趋化因子配体2(CCL2)、基质金属蛋白酶9(MMP-9)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、CXC 趋化因子配体 8(CXCL8)7 个核心靶点.共得到1804个GO条目,106 条KEGG通路,包含晚期糖