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目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨半夏泻心汤治疗胃食管反流病(gastroesophageal reflux disease,GERD)的作用机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索半夏泻心汤组方中药活性成分,并通过Swiss Target Prediction 数据库筛选活性成分相关作用靶点.在DisGeNET 数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)和GeneCards数据库中检索疾病相关靶点及潜在作用靶点.将潜在作用靶点与其对应的活性成分导入Cytoscape 3.9.0 软件构建"半夏泻心汤-活性成分-靶点"网络并进行拓扑分析筛选核心活性成分,构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,拓扑分析筛选关键靶点,并构建关键靶点的PPI 网络筛选核心靶点.将关键靶点导入DAVID 数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.运用Autodock Vina 软件将核心活性成分与核心靶点进行对接.结果:共获得140 个中药活性成分、1 111 个相关靶点及4 176 个疾病相关靶点.将活性成分相关靶点与GERD 靶点进行映射,得

作者:罗安;胡佳

来源:河南中医 2022 年 42卷 12期

知识库介绍

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作者:
罗安;胡佳
来源:
河南中医 2022 年 42卷 12期
标签:
胃食管反流病 半夏泻心汤 作用机制 网络药理学 分子对接 《伤寒论》 张仲景
目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨半夏泻心汤治疗胃食管反流病(gastroesophageal reflux disease,GERD)的作用机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索半夏泻心汤组方中药活性成分,并通过Swiss Target Prediction 数据库筛选活性成分相关作用靶点.在DisGeNET 数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)和GeneCards数据库中检索疾病相关靶点及潜在作用靶点.将潜在作用靶点与其对应的活性成分导入Cytoscape 3.9.0 软件构建"半夏泻心汤-活性成分-靶点"网络并进行拓扑分析筛选核心活性成分,构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,拓扑分析筛选关键靶点,并构建关键靶点的PPI 网络筛选核心靶点.将关键靶点导入DAVID 数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.运用Autodock Vina 软件将核心活性成分与核心靶点进行对接.结果:共获得140 个中药活性成分、1 111 个相关靶点及4 176 个疾病相关靶点.将活性成分相关靶点与GERD 靶点进行映射,得