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目的:基于网络药理学探究构杞子-菊花药对治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的干预机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索构杞子、菊花的活性成分及相关靶点.利用Cytoscape3.9.1绘制"药对-活性成分-作用靶点"网络图,并进行拓扑分析筛选构杞子-菊花药对治疗DR的主要活性成分.利用GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库及药物靶标数据库检索DR相关靶点.将活性成分相关靶点与疾病靶点导入Venny2.1在线平台,绘制韦恩图,交集靶点即为枸杞子-菊花药对治疗DR的潜在靶点.将潜在靶点上传至STRING数据库构建PPI网络关系,导入Cytoscape 3.9.1软件进行可视化,PPI网络拓扑分析筛选枸杞子-菊花药对治疗DR的核心靶点.将核心靶点输入Metascape在线平台进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.将活性成分、核心靶点、信号通路导入Cytoscape 3.9.1软件构建"活性成分-作用靶点-信号通路-DR"网络图.结果:利用TCMSP数据库得到52种活性成分及247个相关靶点."枸杞子菊花药对-活性成分-作用靶点"网络分析筛

作者:徐希;齐月

来源:河南中医 2023 年 43卷 11期

知识库介绍

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作者:
徐希;齐月
来源:
河南中医 2023 年 43卷 11期
标签:
枸杞子-菊花药对 糖尿病视网膜病变 网络药理学 作用机制 Gouqizi(Fructus Lycii)-Juhua(Flos Chrysanthemi)pair diabetic retinopathy(DR) network pharmacology action mecha-nism
目的:基于网络药理学探究构杞子-菊花药对治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的干预机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索构杞子、菊花的活性成分及相关靶点.利用Cytoscape3.9.1绘制"药对-活性成分-作用靶点"网络图,并进行拓扑分析筛选构杞子-菊花药对治疗DR的主要活性成分.利用GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库及药物靶标数据库检索DR相关靶点.将活性成分相关靶点与疾病靶点导入Venny2.1在线平台,绘制韦恩图,交集靶点即为枸杞子-菊花药对治疗DR的潜在靶点.将潜在靶点上传至STRING数据库构建PPI网络关系,导入Cytoscape 3.9.1软件进行可视化,PPI网络拓扑分析筛选枸杞子-菊花药对治疗DR的核心靶点.将核心靶点输入Metascape在线平台进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.将活性成分、核心靶点、信号通路导入Cytoscape 3.9.1软件构建"活性成分-作用靶点-信号通路-DR"网络图.结果:利用TCMSP数据库得到52种活性成分及247个相关靶点."枸杞子菊花药对-活性成分-作用靶点"网络分析筛