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目的 基于网络药理学探究桂枝—甘草治疗病态窦房结综合征(sick sinus syndrome,SSS)的药理机制,为今后新药成分开发及规范指导临床提供科学依据.方法 检索TCMSP数据库获取桂枝—甘草的活性成分及相关靶点,利用Uniprot数据库进行基因标准化,进而构建中药—活性成分—基因网络.通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库检索SSS的疾病靶点,利用韦恩图获取交集靶点,借助STRING数据库及Cytoscape3.7.2构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络模型,获取关键靶点,通过Metascape网站及微生信在线构图进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,利用AutoDock对核心靶点进行分子对接验证.结果 收集并筛选桂枝—甘草核心成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、柚皮素等;PPI结果显示白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、蛋白激酶B(protein kinase B,AKT1)、白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、血管内皮细胞生长因子(vascular endothelial growth factor-A,VEGFA)关系作用最强;GO分析选取主要富集条目1686条,细胞组成1511条,分子功能65条,主要生物学过程为110条,KEGG富集

作者:张佳新;侯平

来源:环球中医药 2023 年 16卷 4期

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作者:
张佳新;侯平
来源:
环球中医药 2023 年 16卷 4期
标签:
病态窦房结综合征 桂枝 甘草 网络药理学 分子对接 靶点预测
目的 基于网络药理学探究桂枝—甘草治疗病态窦房结综合征(sick sinus syndrome,SSS)的药理机制,为今后新药成分开发及规范指导临床提供科学依据.方法 检索TCMSP数据库获取桂枝—甘草的活性成分及相关靶点,利用Uniprot数据库进行基因标准化,进而构建中药—活性成分—基因网络.通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库检索SSS的疾病靶点,利用韦恩图获取交集靶点,借助STRING数据库及Cytoscape3.7.2构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络模型,获取关键靶点,通过Metascape网站及微生信在线构图进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,利用AutoDock对核心靶点进行分子对接验证.结果 收集并筛选桂枝—甘草核心成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、柚皮素等;PPI结果显示白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、蛋白激酶B(protein kinase B,AKT1)、白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、血管内皮细胞生长因子(vascular endothelial growth factor-A,VEGFA)关系作用最强;GO分析选取主要富集条目1686条,细胞组成1511条,分子功能65条,主要生物学过程为110条,KEGG富集