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目的 通过比较多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法,探索更优的致泻性大肠埃希菌(DEC)的快速溯源方法.方法 本研究采用筛选的可变数目串联重复序列(VNTR)位点,对DEC菌株进行MLVA分型,并将该方法与金标准PFGE进行比较评估.结果 PFGE分型方法将58株DEC分为43种带型,其中3种带型成簇,多样性指数(DI)值为0.965.MLVA分型方法将58株菌分为42种带型,4种型别成簇,DI值为0.955.此外,2种方法对2起暴发菌株的分型结果一致.结论 MLVA方法与PFGE方法对深圳地区的58株DEC菌株的分型能力差异无统计学意义,但MLVA具有快速、简便、通量高的特点,使得MLVA优于PFGE分型方法,在疾病监测、疾病暴发调查中将会发挥重要的应用价值.

作者:王磊;陈琼城;胡璐璐;邱亚群;林一曼;江敏;姜伊祥;石晓路;扈庆华;李迎慧

来源:疾病监测 2019 年 34卷 10期

知识库介绍

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作者:
王磊;陈琼城;胡璐璐;邱亚群;林一曼;江敏;姜伊祥;石晓路;扈庆华;李迎慧
来源:
疾病监测 2019 年 34卷 10期
标签:
致泻性大肠埃希菌 溯源 多位点可变数目串联重复序列分析 脉冲场凝胶电泳
目的 通过比较多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法,探索更优的致泻性大肠埃希菌(DEC)的快速溯源方法.方法 本研究采用筛选的可变数目串联重复序列(VNTR)位点,对DEC菌株进行MLVA分型,并将该方法与金标准PFGE进行比较评估.结果 PFGE分型方法将58株DEC分为43种带型,其中3种带型成簇,多样性指数(DI)值为0.965.MLVA分型方法将58株菌分为42种带型,4种型别成簇,DI值为0.955.此外,2种方法对2起暴发菌株的分型结果一致.结论 MLVA方法与PFGE方法对深圳地区的58株DEC菌株的分型能力差异无统计学意义,但MLVA具有快速、简便、通量高的特点,使得MLVA优于PFGE分型方法,在疾病监测、疾病暴发调查中将会发挥重要的应用价值.