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目的 探讨轴丝动力蛋白中链基因1(DNAI1)在肺腺癌(LUAD)中的表达情况以及对肺腺癌侵袭能力的影响.方法 微阵列基因芯片筛选肺腺癌组织(3例)与癌旁组织(3例)的差异表达基因;聚类热图(heatmap)、火山图(volcano plot)展示筛选后mRNA的表达和分布情况;利用DAVID数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析;STRING数据库和Cytoscape 3.6.1软件进行蛋白相互作用(PPI)分析并筛选核心基因(Hub基因);结合DEGs、Ualcan数据库中各Hub基因在肺腺癌中的差异表达情况选择目的基因DNAI1;Real-time PCR、Western blotting检测DNAI1在人正常肺上皮细胞系BEAS-2B和肺腺癌细胞系H1299、A549中的表达情况;过表达DNAI1后观察细胞形态学变化;侵袭实验检测对A549细胞侵袭能力的影响.结果 基因芯片结果筛选出86个上调基因和396个下调基因;差异基因参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控,凋亡过程的负调控,蛋白结合等功能,在胞内广泛分布,与代谢途径和癌症相关途径等信号通路有密切联系;DEGs和Ualcan数据库显示,筛选出的10个Hub基因中,DNAI1在肺腺癌组织中下调且差异表达较为显著;Real-time PCR和Western blotting结果显示,相较于人正常肺上皮细胞系BEAS-2B,DNAI1在肺腺癌细胞系H1299、A549中低表达;过表达DNAI1

作者:张琳;王雪婷;王晓栋;王玉;李春涛;尹崇高;李洪利

来源:解剖学报 2021 年 52卷 2期

知识库介绍

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作者:
张琳;王雪婷;王晓栋;王玉;李春涛;尹崇高;李洪利
来源:
解剖学报 2021 年 52卷 2期
标签:
轴丝动力蛋白中链基因1 肺腺癌 基因芯片 免疫印迹法 实时定量聚合酶链反应
目的 探讨轴丝动力蛋白中链基因1(DNAI1)在肺腺癌(LUAD)中的表达情况以及对肺腺癌侵袭能力的影响.方法 微阵列基因芯片筛选肺腺癌组织(3例)与癌旁组织(3例)的差异表达基因;聚类热图(heatmap)、火山图(volcano plot)展示筛选后mRNA的表达和分布情况;利用DAVID数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析;STRING数据库和Cytoscape 3.6.1软件进行蛋白相互作用(PPI)分析并筛选核心基因(Hub基因);结合DEGs、Ualcan数据库中各Hub基因在肺腺癌中的差异表达情况选择目的基因DNAI1;Real-time PCR、Western blotting检测DNAI1在人正常肺上皮细胞系BEAS-2B和肺腺癌细胞系H1299、A549中的表达情况;过表达DNAI1后观察细胞形态学变化;侵袭实验检测对A549细胞侵袭能力的影响.结果 基因芯片结果筛选出86个上调基因和396个下调基因;差异基因参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控,凋亡过程的负调控,蛋白结合等功能,在胞内广泛分布,与代谢途径和癌症相关途径等信号通路有密切联系;DEGs和Ualcan数据库显示,筛选出的10个Hub基因中,DNAI1在肺腺癌组织中下调且差异表达较为显著;Real-time PCR和Western blotting结果显示,相较于人正常肺上皮细胞系BEAS-2B,DNAI1在肺腺癌细胞系H1299、A549中低表达;过表达DNAI1