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目的 研究色素播散综合征(PDS)和色素性青光眼(PG)致病基因糖蛋白神经调节肽B相关基因(Gpnmb)在BXD重组近交系(BXD RI)小鼠眼组织的表达差异及其基因调控网络.方法 采用Affymetrix基因芯片检测确定68个品系的BXD RI小鼠眼组织中Gpnmb基因的表达差异.采用基因表达数量性状基因座(eQTL)分析方法,结合GeneNetwork网站上的在线分析工具,研究差异表达的特征,进而构建Gpnmb基因调控网络.结果 Gpnmb在BXD RI眼组织中平均表达水平为10.92,不同品系小鼠表达量存在差异.Gpnmb基因为顺式作用的eQTL,End3基因是其下游候选基因.基于和Gpnmb高度相关基因的基因网络得以构建.结论 构建Gpnmb基因调控网络,为PDS和PG发病机制的深入研究提供线索.

作者:陆宏;张俊芳;管怀进;胡楠;帅捷;陆璐

来源:江苏医药 2014 年 40卷 2期

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作者:
陆宏;张俊芳;管怀进;胡楠;帅捷;陆璐
来源:
江苏医药 2014 年 40卷 2期
标签:
糖蛋白神经调节肽B相关基因 色素性青光眼 基因网络 BXD重组近交系小鼠 Gpnmb gene Pigmentary glaucoma Gene network BXD recombinant inbred mice
目的 研究色素播散综合征(PDS)和色素性青光眼(PG)致病基因糖蛋白神经调节肽B相关基因(Gpnmb)在BXD重组近交系(BXD RI)小鼠眼组织的表达差异及其基因调控网络.方法 采用Affymetrix基因芯片检测确定68个品系的BXD RI小鼠眼组织中Gpnmb基因的表达差异.采用基因表达数量性状基因座(eQTL)分析方法,结合GeneNetwork网站上的在线分析工具,研究差异表达的特征,进而构建Gpnmb基因调控网络.结果 Gpnmb在BXD RI眼组织中平均表达水平为10.92,不同品系小鼠表达量存在差异.Gpnmb基因为顺式作用的eQTL,End3基因是其下游候选基因.基于和Gpnmb高度相关基因的基因网络得以构建.结论 构建Gpnmb基因调控网络,为PDS和PG发病机制的深入研究提供线索.