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酚氧化酶原PPO是昆虫免疫的关键酶,本文从牛物信息学角度对亚洲玉米螟Ostrinia furnacalis Guenee幼虫PPO进行分析,为进一步研究其高级结构与功能的关系提供理论依据.利用我们已提交到GenBank的数据,采用在线分析及MEGA4和RasMol软件对亚洲玉米螟酚氧化酶原(Of-PPO)的核苷酸和氨基酸序列、系统发生关系和蛋白质三级结构进行分析.结果表明:Of-PPO全长cDNA序列有2 686 bp,包含一个2 079 bp的开放阅读框,其推导的693个氨基酸序列中包含6个组氨酸残基构成的2个铜离子结合位点,以及保守的硫羟酸酯区域.Of-PPO属于PP为O2类群,其N端不含信号肽,无跨膜结构域区域,无糖基化位点,44个磷酸化位点均匀分布于整个多肽链中,有2段序列可能形成卷曲螺旋,有5个区域的氨基酸具较强疏水性,其二级结构中α-螺旋占22.54

作者:冯从经;陆剑锋;黄建华;郭晓丽;桑守亮

来源:昆虫学报 2009 年 52卷 10期

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作者:
冯从经;陆剑锋;黄建华;郭晓丽;桑守亮
来源:
昆虫学报 2009 年 52卷 10期
标签:
亚洲玉米螟 酚氧化酶原 生物信息学分析 三级结构 同源建模 Ostrinia furnacalis prophenoloxidase bioinformatical analysis tertiary structure comparative modeling
酚氧化酶原PPO是昆虫免疫的关键酶,本文从牛物信息学角度对亚洲玉米螟Ostrinia furnacalis Guenee幼虫PPO进行分析,为进一步研究其高级结构与功能的关系提供理论依据.利用我们已提交到GenBank的数据,采用在线分析及MEGA4和RasMol软件对亚洲玉米螟酚氧化酶原(Of-PPO)的核苷酸和氨基酸序列、系统发生关系和蛋白质三级结构进行分析.结果表明:Of-PPO全长cDNA序列有2 686 bp,包含一个2 079 bp的开放阅读框,其推导的693个氨基酸序列中包含6个组氨酸残基构成的2个铜离子结合位点,以及保守的硫羟酸酯区域.Of-PPO属于PP为O2类群,其N端不含信号肽,无跨膜结构域区域,无糖基化位点,44个磷酸化位点均匀分布于整个多肽链中,有2段序列可能形成卷曲螺旋,有5个区域的氨基酸具较强疏水性,其二级结构中α-螺旋占22.54