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[目的]本研究旨在筛选小菜蛾Plutella xylostella应对玫烟色棒束孢Isaria fumosorosea侵染的免疫应答及其网络调控基因,以进一步探讨小菜蛾对玫烟色棒束孢的防御机制.[方法]采用第二代高通量测序技术RNA-seq,对处理后12h的感染玫烟色棒束孢和健康(平行对照)的小菜蛾4龄幼虫转录组进行了测序,通过生物信息学分析对得到的差异基因进行了功能注释和分类,对差异基因参与的信号通路进行了分析.[结果]在感菌和健康小菜蛾幼虫转录组两个表达谱里,分别获得了12 346 987和12 315 210个clean reads,有60.93%和61.26%的reads分别能比对到参考基因库里,其中完美匹配(perfect match)的比例分别为32.15%和32.73%.共得到351个显著差异表达基因(differentially expressed unigenes,DEUs),上调表达基因有275个,下调表达基因有76个,与免疫防御反应潜在相关的基因有156个.GO(Gene Ontology)富集分析有102个DEUs分布到46个GO term里,KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) pathway富集分析结果显示,有132个DEUs显著富集在13个代谢通路(pathway)里.[结论]这些差异表达基因中,大部分编码潜在的与免疫识别及调控相关的基因,集中在能量代谢、疾病反应和防御反应等相关通路.研究结果为挖掘与玫烟色棒束孢侵染相关的小

作者:雷妍圆;何余容;谢梅琼;吕利华;顾家睿

来源:昆虫学报 2016 年 59卷 9期

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作者:
雷妍圆;何余容;谢梅琼;吕利华;顾家睿
来源:
昆虫学报 2016 年 59卷 9期
标签:
小菜蛾 玫烟色棒束孢 免疫应答 转录组 RNA-seq 表达谱 生物信息学 Plutella xylostella Isaria fumosorosea immune response transcriptome RNA-seq expression profile bioinformatics
[目的]本研究旨在筛选小菜蛾Plutella xylostella应对玫烟色棒束孢Isaria fumosorosea侵染的免疫应答及其网络调控基因,以进一步探讨小菜蛾对玫烟色棒束孢的防御机制.[方法]采用第二代高通量测序技术RNA-seq,对处理后12h的感染玫烟色棒束孢和健康(平行对照)的小菜蛾4龄幼虫转录组进行了测序,通过生物信息学分析对得到的差异基因进行了功能注释和分类,对差异基因参与的信号通路进行了分析.[结果]在感菌和健康小菜蛾幼虫转录组两个表达谱里,分别获得了12 346 987和12 315 210个clean reads,有60.93%和61.26%的reads分别能比对到参考基因库里,其中完美匹配(perfect match)的比例分别为32.15%和32.73%.共得到351个显著差异表达基因(differentially expressed unigenes,DEUs),上调表达基因有275个,下调表达基因有76个,与免疫防御反应潜在相关的基因有156个.GO(Gene Ontology)富集分析有102个DEUs分布到46个GO term里,KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) pathway富集分析结果显示,有132个DEUs显著富集在13个代谢通路(pathway)里.[结论]这些差异表达基因中,大部分编码潜在的与免疫识别及调控相关的基因,集中在能量代谢、疾病反应和防御反应等相关通路.研究结果为挖掘与玫烟色棒束孢侵染相关的小