您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览159 | 下载0

【目的】筛选烟粉虱 Bemisia tabaci (Gennadius)若虫应对白僵菌 Beauveria bassiana 侵染的应答基因,以进一步研究烟粉虱免疫反应的分子机制。【方法】采用新一代高通量测序技术对感染和非感染白僵菌的烟粉虱4龄若虫进行了测序分析,并筛选了差异表达基因;利用生物信息学工具对转录组测序得到的基因进行了功能注释、分类以及参与的信号通路展示。【结果】组装得到非冗余 Unigene 232554个,其 N50和 N90分别为1153 bp 和260 bp,平均长度为67424 bp。对所有的基因进行差异表达分析发现:以 P<0.05为标准筛选得到了1166个差异表达基因,其中上调表达基因有474个,下调表达基因有692个,其中,与免疫相关的基因有405个;GO 富集分析发现:有416个 GO term 有富集现象,包括156个生物学过程(66402个 Unigenes),89个细胞组分(27645个 Unigenes)和154个分子功能(73417个Unigenes);KEGG 代谢通路分析将烟粉虱转录组1145个 DEG 匹配到309个通路上,其中76个通路得到了富集。【结论】对405个可能参与到烟粉虱若虫对白僵菌侵染的免疫识别和防御的基因进行了测序。研究结果为从分子水平上开展应用虫生真菌防治烟粉虱的研究奠定信息学基础。

作者:王登杰;吴圣勇;雷仲仁;王海鸿

来源:应用昆虫学报 2015 年 1期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:159 | 下载:0
作者:
王登杰;吴圣勇;雷仲仁;王海鸿
来源:
应用昆虫学报 2015 年 1期
标签:
白僵菌 侵染 烟粉虱 转录组 Beauveria bassiana infect Bemisia tabaci transcriptome
【目的】筛选烟粉虱 Bemisia tabaci (Gennadius)若虫应对白僵菌 Beauveria bassiana 侵染的应答基因,以进一步研究烟粉虱免疫反应的分子机制。【方法】采用新一代高通量测序技术对感染和非感染白僵菌的烟粉虱4龄若虫进行了测序分析,并筛选了差异表达基因;利用生物信息学工具对转录组测序得到的基因进行了功能注释、分类以及参与的信号通路展示。【结果】组装得到非冗余 Unigene 232554个,其 N50和 N90分别为1153 bp 和260 bp,平均长度为67424 bp。对所有的基因进行差异表达分析发现:以 P<0.05为标准筛选得到了1166个差异表达基因,其中上调表达基因有474个,下调表达基因有692个,其中,与免疫相关的基因有405个;GO 富集分析发现:有416个 GO term 有富集现象,包括156个生物学过程(66402个 Unigenes),89个细胞组分(27645个 Unigenes)和154个分子功能(73417个Unigenes);KEGG 代谢通路分析将烟粉虱转录组1145个 DEG 匹配到309个通路上,其中76个通路得到了富集。【结论】对405个可能参与到烟粉虱若虫对白僵菌侵染的免疫识别和防御的基因进行了测序。研究结果为从分子水平上开展应用虫生真菌防治烟粉虱的研究奠定信息学基础。