您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览11 | 下载1

目的 通过基因芯片技术分析Narasin处理对雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌细胞基因表达的影响.方法 选取ER+乳腺癌MCF-7细胞株,用0.05 mmol·L-1 Narasin进行处理,将处理后的细胞分为对照组C(未经Narasin处理的3个重复组C1、C2、C3)及实验组T(经0.05 mmol·L-1 Narasin处理的3个重复组T1、T2、T3),并进行RNA的提纯;将RNA通过Affymetrix Gene Chip Prime View人类基因表达阵列进行分析,利用R语言limma包筛选出未经Narasin处理和0.05 mmol·L-1 Narasin处理的MCF-7细胞中的差异表达基因(DEGs),进而通过KEGG通路和GO富集分析研究DEGs的功能分布.结果 根据基因芯片的数据进行分析,发现DEGs共111个,其中82个基因表达上调,29个基因表达下调(差异均在1.5倍以上),且细胞中过表达与乳腺癌预后不良相关基因CYP24A1、EYA2 等经Narasin处理后基因表达下调.GO富集分析结果显示,下调的DEGs主要富集在先天免疫系统、Ⅰ型干扰素信号通路、病毒基因组复制的负调控、免疫反应、伤口愈合、细胞迁移、基因表达调控、细胞黏附、膜的锚定组件、细胞因子活性、酶结合、DNA结合、双链RNA绑定等.KEGG通路分析结果显示,下调的DEGs主要富集于癌症中的小分子核糖核酸、单纯疱疹病毒感染、麻疹、黏着斑、ECM-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路

作者:蔡卫吉;凌珺;王宝祯;马磊;王彦凤;李涛;陈静

来源:宁夏医科大学学报 2023 年 45卷 5期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:11 | 下载:1
作者:
蔡卫吉;凌珺;王宝祯;马磊;王彦凤;李涛;陈静
来源:
宁夏医科大学学报 2023 年 45卷 5期
标签:
Narasin 乳腺癌 基因芯片 生物信息学分析 差异表达基因
目的 通过基因芯片技术分析Narasin处理对雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌细胞基因表达的影响.方法 选取ER+乳腺癌MCF-7细胞株,用0.05 mmol·L-1 Narasin进行处理,将处理后的细胞分为对照组C(未经Narasin处理的3个重复组C1、C2、C3)及实验组T(经0.05 mmol·L-1 Narasin处理的3个重复组T1、T2、T3),并进行RNA的提纯;将RNA通过Affymetrix Gene Chip Prime View人类基因表达阵列进行分析,利用R语言limma包筛选出未经Narasin处理和0.05 mmol·L-1 Narasin处理的MCF-7细胞中的差异表达基因(DEGs),进而通过KEGG通路和GO富集分析研究DEGs的功能分布.结果 根据基因芯片的数据进行分析,发现DEGs共111个,其中82个基因表达上调,29个基因表达下调(差异均在1.5倍以上),且细胞中过表达与乳腺癌预后不良相关基因CYP24A1、EYA2 等经Narasin处理后基因表达下调.GO富集分析结果显示,下调的DEGs主要富集在先天免疫系统、Ⅰ型干扰素信号通路、病毒基因组复制的负调控、免疫反应、伤口愈合、细胞迁移、基因表达调控、细胞黏附、膜的锚定组件、细胞因子活性、酶结合、DNA结合、双链RNA绑定等.KEGG通路分析结果显示,下调的DEGs主要富集于癌症中的小分子核糖核酸、单纯疱疹病毒感染、麻疹、黏着斑、ECM-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路