目的 基于GEO数据库数据分析原发性干燥综合征(pSS)外周血和唇腺组织中差异表达基因的生物学功能,筛选调控pSS发生发展的关键基因,并观察pSS患者唇腺组织中的免疫细胞变化情况.方法 从GEO数据库获取pSS相关基因表达谱芯片GSE51092,利用R软件筛选出pSS患者外周血和唇腺组织中的差异表达基因,并进行GO功能富集分析、KEGG信号通路富集分析、基因集富集分析(GSEA),观察差异表达基因的生物学功能.通过STRING数据库构建差异表达基因的蛋白互作网络,利用Cytoscape软件筛选连接度值排序前10的差异表达基因.通过CIBERSORT反卷积算法获取22种免疫细胞的细胞占比,分析各类免疫细胞间的相关性,并观察pSS患者和健康人之间的免疫细胞浸润差异.结果 筛选出282个差异表达基因.GO功能富集分析结果显示,差异表达基因在生物学过程中体现在病毒应答、病毒防御应答、Ⅰ型干扰素(IFN)信号通路传导等过程上;分子功能变化主要集中在双链RNA结合、翻译调节活性、NAD+ADP?核糖转移酶活性等功能上.KEGG信号通路富集分析发现,显著富集的信号通路包括冠状病毒(COVID)-19、人乳头瘤病毒感染、甲型流感等.GSEA分析结果显示,差异表达基因富集在免疫反应通路,包括对病毒的防御反应、对IFN-γ的应答、RIG-I样受体信号通路、调控破骨细胞分化
作者：饶钰君；田龙龙；张勇斌；闵星星；陈桂玉；李国青
来源：山东医药 2022 年 62卷 21期
