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目的:通过网络药理学和分子对接探究丹参-郁金治疗多囊卵巢综合征(PCOS)的作用机制.方法:获取丹参、郁金的中药活性成分及其作用靶点,检索PCOS疾病相关靶点,将二者取交集后利用Cytoscape 3.7.2构建"药物-成分-共同靶点"网络.并将共同靶点导入string数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图.再将共同靶点基因导入DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析.最后根据活性成分、作用靶点的相关节点参数进行排序,使用AutoDock Tools将核心活性成分和筛选出的靶基因编码的蛋白进行分子对接.结果:丹参、郁金共筛选出潜在活性成分80个,其中木犀草素、丹参酮Ⅱa、β谷甾醇等19种为主要活性成分,活性成分的作用靶点共157个.PCOS疾病相关靶点1847个,交集靶点为93个,PPI网络及拓扑学分析显示AKT1、TP53、IL6、VEGFA、MAPK3、MAPK1是丹参、郁金治疗PCOS的核心靶点.GO功能富集分析显示丹参-郁金主要参与RNA信号转导、酶的调控等生物过程,KEGG通路富集分析得到了癌症信号通路、PI3K/AKT、FoxO、HIF-1等20条相关性最高的通路.将核心靶点编码的蛋白作为靶点分别与对应的药物核心活性成分对接,结果良好.结论:通过网络药理学研究及分子对接验证,显示丹参-郁金可通过多靶点、多信号

作者:孔鑫靓;刘雁峰

来源:世界中医药 2022 年 17卷 15期

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孔鑫靓;刘雁峰
来源:
世界中医药 2022 年 17卷 15期
标签:
丹参 郁金 多囊卵巢综合征 网络药理学 分子对接 活性成分 作用靶点
目的:通过网络药理学和分子对接探究丹参-郁金治疗多囊卵巢综合征(PCOS)的作用机制.方法:获取丹参、郁金的中药活性成分及其作用靶点,检索PCOS疾病相关靶点,将二者取交集后利用Cytoscape 3.7.2构建"药物-成分-共同靶点"网络.并将共同靶点导入string数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图.再将共同靶点基因导入DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析.最后根据活性成分、作用靶点的相关节点参数进行排序,使用AutoDock Tools将核心活性成分和筛选出的靶基因编码的蛋白进行分子对接.结果:丹参、郁金共筛选出潜在活性成分80个,其中木犀草素、丹参酮Ⅱa、β谷甾醇等19种为主要活性成分,活性成分的作用靶点共157个.PCOS疾病相关靶点1847个,交集靶点为93个,PPI网络及拓扑学分析显示AKT1、TP53、IL6、VEGFA、MAPK3、MAPK1是丹参、郁金治疗PCOS的核心靶点.GO功能富集分析显示丹参-郁金主要参与RNA信号转导、酶的调控等生物过程,KEGG通路富集分析得到了癌症信号通路、PI3K/AKT、FoxO、HIF-1等20条相关性最高的通路.将核心靶点编码的蛋白作为靶点分别与对应的药物核心活性成分对接,结果良好.结论:通过网络药理学研究及分子对接验证,显示丹参-郁金可通过多靶点、多信号