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从GenBank上获得194株不同来源的H5N1亚型禽流感病毒HA基因核酸序列,利用MEGA3分析了HA基因核酸序列碱基突变的特点.并通过比较序列同源性,构建NJ系统进化树,探讨了不同来源的H5N1病毒的系统进化关系.序列分析结果表明,被研究的194条H5N1亚型禽流感病毒HA基因核酸序列,碱基长度大约在1700bp左右,共发现了757个可变位点,其中Parsimony-informative sites有537个,Singleton sites有220个;病毒的变异速率很快,平均变异率为3.23
作者：李佳；张智俊；田兴军
来源：生物信息学 2006 年 4卷 3期
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