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热休克蛋白90( Heat shock protein 90,Hsp90)是生物体受到刺激时发生应激反应而产生的一类应激蛋白。 Hsp90包含Hsp90A, Hsp90B, Hsp90C, TRAP和HtpG5个亚家族。本文采用生物信息学方法对所选11个物种的Hsp90基因进行了分析。统计Hsp90亚家族在物种间的分布情况,验证了Hsp90亚家族在物种间的分布规律,即Hsp90A亚家族分布于除细菌外的其他所有物种中,Hsp90B和TRAP1亚家族在物种间的分布无明显规律,Hsp90C亚家族只存在于植物中,HtpG亚家族大部分存在于细菌中。通过构建系统发育树,发现Hsp90家族在进化过程中具有保守性。使用Cell-PLoc, SubLoc v1.0, PSORT II和MultiLoc四种亚细胞定位软件对所选的11个物种的Hsp90进行亚细胞定位分析,发现Hsp90A,HtpG亚家族偏好出现在细胞质中,Hsp90B亚家族除存在于细胞质外还存在于内质网中,Hsp90C亚家族则集中于细胞质和线粒体中,TRAP1亚家族基本位于线粒体中。

作者:叶静;陈伟;金殿川

来源:生物信息学 2016 年 14卷 3期

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叶静;陈伟;金殿川
来源:
生物信息学 2016 年 14卷 3期
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热休克蛋白90 系统发育树 基因结构 亚细胞定位 Hsp90 Phylogenetic tree Gene Structure Subcellular localization
热休克蛋白90( Heat shock protein 90,Hsp90)是生物体受到刺激时发生应激反应而产生的一类应激蛋白。 Hsp90包含Hsp90A, Hsp90B, Hsp90C, TRAP和HtpG5个亚家族。本文采用生物信息学方法对所选11个物种的Hsp90基因进行了分析。统计Hsp90亚家族在物种间的分布情况,验证了Hsp90亚家族在物种间的分布规律,即Hsp90A亚家族分布于除细菌外的其他所有物种中,Hsp90B和TRAP1亚家族在物种间的分布无明显规律,Hsp90C亚家族只存在于植物中,HtpG亚家族大部分存在于细菌中。通过构建系统发育树,发现Hsp90家族在进化过程中具有保守性。使用Cell-PLoc, SubLoc v1.0, PSORT II和MultiLoc四种亚细胞定位软件对所选的11个物种的Hsp90进行亚细胞定位分析,发现Hsp90A,HtpG亚家族偏好出现在细胞质中,Hsp90B亚家族除存在于细胞质外还存在于内质网中,Hsp90C亚家族则集中于细胞质和线粒体中,TRAP1亚家族基本位于线粒体中。