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介绍产电微生物胞外电子传递(extracellular electron transfer,EET)研究的背景和意义,概述细胞色素c、菌毛蛋白、电子介体等多种分子在EET过程中的作用,综述近年来利用网络方法和组学方法研究产电微生物EET过程的相关工作.从蛋白网络、调控网络与整合网络等方面总结网络分析方法在关键电子传递分子识别、电子传递模块挖掘、电子传递途径推断等方面的应用;从基因组、转录组、蛋白组、多组学与宏组学等方面总结使用组学方法识别电子传递基因及其功能分析方面的研究;介绍整合生物网络与组学数据在产电微生物EET过程生物分子协调利用、关键基因与基因簇识别等方面的研究.探讨当前存在的问题,展望未来整合多种生物网络和组学数据开展产电微生物EET研究的方向.

作者:丁德武;张鵾;何小青;谢建明

来源:生物学杂志 2024 年 41卷 1期

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作者:
丁德武;张鵾;何小青;谢建明
来源:
生物学杂志 2024 年 41卷 1期
标签:
生物信息学 生物网络 组学方法 胞外电子传递 产电微生物 bioinformatics biological networks omics methods extracellular electron transfer electricigens
介绍产电微生物胞外电子传递(extracellular electron transfer,EET)研究的背景和意义,概述细胞色素c、菌毛蛋白、电子介体等多种分子在EET过程中的作用,综述近年来利用网络方法和组学方法研究产电微生物EET过程的相关工作.从蛋白网络、调控网络与整合网络等方面总结网络分析方法在关键电子传递分子识别、电子传递模块挖掘、电子传递途径推断等方面的应用;从基因组、转录组、蛋白组、多组学与宏组学等方面总结使用组学方法识别电子传递基因及其功能分析方面的研究;介绍整合生物网络与组学数据在产电微生物EET过程生物分子协调利用、关键基因与基因簇识别等方面的研究.探讨当前存在的问题,展望未来整合多种生物网络和组学数据开展产电微生物EET研究的方向.