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背景:细胞色素P450同工酶2C19(CYP2C19)和白细胞介素-1β(IL-1β)基因多态性是幽门螺杆菌(Hp)感染根除率的重要影响因素,明确其基因多态性对根除治疗方案的制定具有指导意义.目的:采用高分辨率熔解曲线(HRM)技术鉴别CYP2C19、IL-1β基因单核苷酸多态性(SNPs)位点基因型.方法:采集200名健康体检者外周血,提取基因组DNA,以HRM技术确定CYP2C19*2、*3和IL-1β-31/-511引物的最佳Mg2+浓度,并检测相应SNPs位点基因型,检测结果以基因测序进行验证.结果:CYP2C19*2、*3和IL-1β-31/-511引物的最佳Mg2+浓度分别为3.0、3.0、2.5、2.5 mmol/L.HRM技术能精确鉴别CYP2C19*2、*3和IL-1β-31/-511基因型,与基因测序结果有良好的一致性(κ =0.985和0.968).结论:HRM技术能精确鉴别CYP2C19、IL-1β基因多态性,可用于指导Hp根除治疗方案的药物选择.

作者:洪军波;刘东升;舒徐;祝荫;汪安江;谢川;谢勇;张焜和;吕农华

来源:胃肠病学 2015 年 20卷 12期

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作者:
洪军波;刘东升;舒徐;祝荫;汪安江;谢川;谢勇;张焜和;吕农华
来源:
胃肠病学 2015 年 20卷 12期
标签:
高分辨率熔解曲线 细胞色素P450 CYP2C19 白细胞介素1β 多态性,单核苷酸 幽门螺杆菌 High-Resolution Melting Curve Cytochrome P-450 CYP2C19 Interleukin-1beta Polymorphism,Single Nucleotide Helicobacter pylori
背景:细胞色素P450同工酶2C19(CYP2C19)和白细胞介素-1β(IL-1β)基因多态性是幽门螺杆菌(Hp)感染根除率的重要影响因素,明确其基因多态性对根除治疗方案的制定具有指导意义.目的:采用高分辨率熔解曲线(HRM)技术鉴别CYP2C19、IL-1β基因单核苷酸多态性(SNPs)位点基因型.方法:采集200名健康体检者外周血,提取基因组DNA,以HRM技术确定CYP2C19*2、*3和IL-1β-31/-511引物的最佳Mg2+浓度,并检测相应SNPs位点基因型,检测结果以基因测序进行验证.结果:CYP2C19*2、*3和IL-1β-31/-511引物的最佳Mg2+浓度分别为3.0、3.0、2.5、2.5 mmol/L.HRM技术能精确鉴别CYP2C19*2、*3和IL-1β-31/-511基因型,与基因测序结果有良好的一致性(κ =0.985和0.968).结论:HRM技术能精确鉴别CYP2C19、IL-1β基因多态性,可用于指导Hp根除治疗方案的药物选择.