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目的:阐明椭圆食粉螨体内微生物群落结构及多样性.方法:实验室饲养椭圆食粉螨,利用Illumina MiSeq技术对其体内细菌16S rRNA基因的V4区和真菌ITS1序列进行测序,统计体内微生物的操作分类单元(OTUs)数量,分析其体内微生物群落结构及Alpha多样性.结果:获得椭圆食粉螨体内细菌16s rRNA和真菌ITS1有效序列209 643和145 646条,根据序列相似性>97%进行聚类分析,分别得到了 248和146个OTUs.基于OTUs进行物种注释,共注释到细菌类群20门,32纲,110目,177科,128属;共注释到真菌类群3门,15纲,36目,65科,92属.其中,在门分类水平,本实验室饲养椭圆食粉螨体内细菌群落主要注释到厚壁菌门Firmicutes(43.52%)、拟杆菌门Bacteroidota(31.94%)、放线菌门Actinobacteriota(20.04%)、变形菌门Proteobacteria(4.40%);真菌类群以子囊菌门Ascomycota(98.60%)为绝对优势菌门.在属分类水平,细菌类群主要注释到葡萄球菌属Staphylococcus(43.27%)、土壤杆形菌属Solitalea(31.81%)、棒杆菌属Corynebacterium(7.61%)、考克氏菌属Kocuria(7.06%)、短杆菌属 Brevibacterium(4.11%)、鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas(2.45%);真菌优势属为Trichomonascus(71.52%)、曲霉属Aspergillus(10.38%)、链格孢属Alternaria(9.29%).Alpha

作者:王睿怡;周小倩;吴毅强;杨欣宴;王若航;马杰;周姝雅;凡哲玮;杨宇哲;陈玉娟;孙恩涛

来源:皖南医学院学报 2023 年 42卷 4期

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作者:
王睿怡;周小倩;吴毅强;杨欣宴;王若航;马杰;周姝雅;凡哲玮;杨宇哲;陈玉娟;孙恩涛
来源:
皖南医学院学报 2023 年 42卷 4期
标签:
椭圆食粉螨 微生物 多样性 高通量测序 Aleuroglyphus ovatus microorganism diversity high-throughput sequencing
目的:阐明椭圆食粉螨体内微生物群落结构及多样性.方法:实验室饲养椭圆食粉螨,利用Illumina MiSeq技术对其体内细菌16S rRNA基因的V4区和真菌ITS1序列进行测序,统计体内微生物的操作分类单元(OTUs)数量,分析其体内微生物群落结构及Alpha多样性.结果:获得椭圆食粉螨体内细菌16s rRNA和真菌ITS1有效序列209 643和145 646条,根据序列相似性>97%进行聚类分析,分别得到了 248和146个OTUs.基于OTUs进行物种注释,共注释到细菌类群20门,32纲,110目,177科,128属;共注释到真菌类群3门,15纲,36目,65科,92属.其中,在门分类水平,本实验室饲养椭圆食粉螨体内细菌群落主要注释到厚壁菌门Firmicutes(43.52%)、拟杆菌门Bacteroidota(31.94%)、放线菌门Actinobacteriota(20.04%)、变形菌门Proteobacteria(4.40%);真菌类群以子囊菌门Ascomycota(98.60%)为绝对优势菌门.在属分类水平,细菌类群主要注释到葡萄球菌属Staphylococcus(43.27%)、土壤杆形菌属Solitalea(31.81%)、棒杆菌属Corynebacterium(7.61%)、考克氏菌属Kocuria(7.06%)、短杆菌属 Brevibacterium(4.11%)、鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas(2.45%);真菌优势属为Trichomonascus(71.52%)、曲霉属Aspergillus(10.38%)、链格孢属Alternaria(9.29%).Alpha