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[目的]揭示浑善达克沙地不同类型生物土壤结皮(Biological soil crusts,BSCs)及其下层土壤好氧不产氧光营养细菌(Aerobic anoxygenic phototrophic bacteria,AAPB)群落结构及多样性.[方法]利用Illumina MiSeq二代高通量测序平台对pufM基因进行测序,使用生物信息学分析方法对序列进行比对分析AAPB的群落结构和多样性.[结果]生物土壤结皮及其下层土壤中,Proteobacteria和Alpha-Proteobacteria是优势门和纲,主要有6个属Bradyrhizobium (9.69%-90.02%)、Brevundimonas (0.83%-16.04%)、Methylobacterium(1.74%-12.56%)、Rhodospirillum (0.91%-32.87%)、Roseiflexus (0.02%-1.79%)和Sphingomonas (0.13%-11.23%);结皮层样品间及下层土壤样品间AAPB种类相似,但丰度有差异;随结皮的发育,结皮层及其下层土壤中AAPB群落多样性升高.[结论]浑善达克沙地BSCs中AAPB群落结构相对复杂,与水体和一般土壤环境中的组成区别明显;AAPB多样性高,且多样性随发育阶段升高而升高,预示着AAPB在荒漠生态系统稳定中有重要的作用.

作者:唐凯;贾丽娟;高晓丹;陶羽;孟建宇;李蘅;袁立敏;冯福应

来源:微生物学报 2018 年 58卷 2期

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唐凯;贾丽娟;高晓丹;陶羽;孟建宇;李蘅;袁立敏;冯福应
来源:
微生物学报 2018 年 58卷 2期
标签:
BSCs AAPB pufM 高通量测序 多样性 BSCs AAPB pufM high-throughput sequencing diversity
[目的]揭示浑善达克沙地不同类型生物土壤结皮(Biological soil crusts,BSCs)及其下层土壤好氧不产氧光营养细菌(Aerobic anoxygenic phototrophic bacteria,AAPB)群落结构及多样性.[方法]利用Illumina MiSeq二代高通量测序平台对pufM基因进行测序,使用生物信息学分析方法对序列进行比对分析AAPB的群落结构和多样性.[结果]生物土壤结皮及其下层土壤中,Proteobacteria和Alpha-Proteobacteria是优势门和纲,主要有6个属Bradyrhizobium (9.69%-90.02%)、Brevundimonas (0.83%-16.04%)、Methylobacterium(1.74%-12.56%)、Rhodospirillum (0.91%-32.87%)、Roseiflexus (0.02%-1.79%)和Sphingomonas (0.13%-11.23%);结皮层样品间及下层土壤样品间AAPB种类相似,但丰度有差异;随结皮的发育,结皮层及其下层土壤中AAPB群落多样性升高.[结论]浑善达克沙地BSCs中AAPB群落结构相对复杂,与水体和一般土壤环境中的组成区别明显;AAPB多样性高,且多样性随发育阶段升高而升高,预示着AAPB在荒漠生态系统稳定中有重要的作用.