[目的]蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis,简称球囊菌)专性侵染蜜蜂幼虫而导致白垩病,危害蜜蜂健康和养蜂生产.本研究旨在探究中华蜜蜂(Apis cerana cerana,简称中蜂)6日龄幼虫响应球囊菌胁迫的环状RNA(circular RNA,circRNA)差异表达谱及差异表达circRNA (differentially expressed circRNA,DEcircRNA)在宿主胁迫应答中的潜在功能.[方法]利用去除线性RNA的circRNA-seq技术对正常和球囊菌侵染的中蜂6日龄幼虫肠道(AcCK和AcT)进行测序.利用find circ软件鉴定circRNA,统计circRNA的长度和环化类型.根据|log2(Fold change)|≥1和P≤0.05的标准筛选DEcircRNA.将DEcircRNA的来源基因比对Gene ontology (GO)数据库和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)数据库,从而获得功能及通路(pathway)注释.随机挑选3个DEcircRNA进行RT-qPCR验证.[结果]AcCK和AcT的circRNA-seq分别得到76342570和68269362条原始读段(raw reads),经严格质控得到74524108和66974392条有效读段(clean reads),Q30分别为92.75％和94％,GC含量分别为54.31％和54.90％.比对上东方蜜蜂(Apis cerana)参考基因组的短序列读段(anchor reads)共计23648400条.AcCK和AcT中分别鉴定到805和702个circRNA,长度均介于201-1000 nt,数量最多的环化类型均

作者：陈华枝；付中民；王杰；祝智威；范小雪；蒋海宾；范元婵；周丁丁；李汶东；熊翠玲；郑燕珍；徐国钧；陈大福；郭睿

来源：微生物学报 2020 年 60卷 10期