目的 了解泛太平洋西岸各个国家H5N1亚型人禽流感病毒血凝素(HA)基因分子特征,寻求HA基因变异规律.方法 从Genebank中下载泛太平洋西岸国家或地区(包括泰国、越南、香港、印度尼西亚、中国大陆、蒙古、俄罗斯)50株H5N1亚型高致病性流感病毒(HAPI)毒株血凝素基因序列,利用生物信息学软件DNASTAR 5.0进行核酸同源性分析,用MEGA 3.1进行核酸和氨基酸序列比对和进化树分析.结果 50株高致病性H5N1亚型流感病毒毒株可以分成3个相对独立的进化簇.第1簇为泰国越南簇;第2簇为中国印尼北亚簇(包含中国、印度尼西亚、蒙古以及俄罗斯);第3簇主要为1996～2001年期间分离的毒株,该簇毒株HA基因与Gs/Gd like毒株核酸同源性更为接近,其基因亚型更多表现为Gs/Gd like或其他基因亚型.HA基因分子特征分析表明在HA蛋白抗原性上,泰国越南分离株表现基本一致,而其他地域分离株存在表现各异,但也存在地域的一致性.结论 泛太平洋西岸地区分离的H5N1亚型禽流感病毒血凝素蛋白在分子特征上表现出一定的地域特异性,在一定地域范围内保持一致性.
作者：房师松；何建凡；程小雯；吕星；逯建华；张顺祥
来源：卫生研究 2008 年 37卷 4期
