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目的 通过构建乙肝病毒(HBV)重组质粒来制备共价闭合环状DNA(cccDNA),为cccDNA定量检测提供合适的标准品.方法 选择本院就诊的2名慢性乙肝患者,采取蛋白酶K消化法提取其血清病毒DNA,运用高保真聚合酶扩增HBV DNA,然后将扩增片段插入克隆载体构建HBV重组质粒.以重组质粒为模板制备环状DNA,经测序鉴定和PCR定量检测.结果 HBV DNA全长序列被成功扩增,并顺利构建重组质粒.2个重组质粒经内切酶消化均能得到预期的HBV DNA片段(约3.2 kb)和载体DNA片段(约2.7 kb);经测序鉴定,2个质粒分别为HBV B和C基因型,其插入序列保真性好,错配率低,每kb分别为1.24 bp和1.56 bp;以重组质粒为模板制备的2个环状DNA长度均约为2.1 kb,测序证实为HBV cccDNA;经定量检测,其纯度高,浓度分别为1.05×1010 IU/ml和6.19 × 109 IU/ml.结论 利用重组质粒方式制备的HBV cccDNA具有纯度高、获取量大等优点,可作为cccDNA定量检测和方法性能验证的标准品.

作者:郭永灿;王友强;张丹;邓冲;赵容;涂植光

来源:现代预防医学 2018 年 45卷 1期

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作者:
郭永灿;王友强;张丹;邓冲;赵容;涂植光
来源:
现代预防医学 2018 年 45卷 1期
标签:
乙型肝炎病毒 全长基因组 重组质粒 共价闭合环状DNA 标准品 Hepatitis B virus Complete genome Recombinant plasmids Covalently closed circle DNA Standard material
目的 通过构建乙肝病毒(HBV)重组质粒来制备共价闭合环状DNA(cccDNA),为cccDNA定量检测提供合适的标准品.方法 选择本院就诊的2名慢性乙肝患者,采取蛋白酶K消化法提取其血清病毒DNA,运用高保真聚合酶扩增HBV DNA,然后将扩增片段插入克隆载体构建HBV重组质粒.以重组质粒为模板制备环状DNA,经测序鉴定和PCR定量检测.结果 HBV DNA全长序列被成功扩增,并顺利构建重组质粒.2个重组质粒经内切酶消化均能得到预期的HBV DNA片段(约3.2 kb)和载体DNA片段(约2.7 kb);经测序鉴定,2个质粒分别为HBV B和C基因型,其插入序列保真性好,错配率低,每kb分别为1.24 bp和1.56 bp;以重组质粒为模板制备的2个环状DNA长度均约为2.1 kb,测序证实为HBV cccDNA;经定量检测,其纯度高,浓度分别为1.05×1010 IU/ml和6.19 × 109 IU/ml.结论 利用重组质粒方式制备的HBV cccDNA具有纯度高、获取量大等优点,可作为cccDNA定量检测和方法性能验证的标准品.