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肿瘤严重威胁人类健康,转录因子是肿瘤治疗的潜在靶点.作为重要的转录因子家族,E2F在细胞增殖与调控进程中发挥重要作用.然而,E2F家族转录因子在肿瘤发生进程中的表达规律、基因功能和分子互作等关键信息尚不清晰.基于此,本研究对TCGA数据库中我国 10 种高发肿瘤的转录组测序数据、突变数据和蛋白质互作数据进行整合分析,探究E2F家族转录因子的表达、结构、功能、突变和系统发生特征.结果显示,E2F 家族转录因子中的E2F1和E2F7基因在多种肿瘤样本中规律性上调表达,参与调控细胞周期、细胞衰老等信号通路;其中,E2F1 作为重要的调控因子与其他蛋白的相互作用最多.值得指出的是,E2F 家族转录因子的基因突变类型在肿瘤类型和患者性别中均存在差异,基因扩增占比最大.系统发生分析显示,E2F家族转录因子的结构在包括果蝇、线虫和人类在内 41 个物种中保守,并且它们在物种演化过程中表现出基因扩张倾向.综上所述,本研究阐明了 E2F 家族转录因子在我国高发肿瘤中的表达规律、突变特征和演化规律,提示E2F家族转录因子是相关肿瘤疾病的新型分子诊断标志物,为抗肿瘤靶向药物研发提供理论依据.

作者:李飞飞;王韵;顾冀海;张玉明;柳峰松;倪志华

来源:遗传 2023 年 45卷 7期

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作者:
李飞飞;王韵;顾冀海;张玉明;柳峰松;倪志华
来源:
遗传 2023 年 45卷 7期
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E2F1 E2F7 基因家族 结构 E2F1 E2F7 gene family structure
肿瘤严重威胁人类健康,转录因子是肿瘤治疗的潜在靶点.作为重要的转录因子家族,E2F在细胞增殖与调控进程中发挥重要作用.然而,E2F家族转录因子在肿瘤发生进程中的表达规律、基因功能和分子互作等关键信息尚不清晰.基于此,本研究对TCGA数据库中我国 10 种高发肿瘤的转录组测序数据、突变数据和蛋白质互作数据进行整合分析,探究E2F家族转录因子的表达、结构、功能、突变和系统发生特征.结果显示,E2F 家族转录因子中的E2F1和E2F7基因在多种肿瘤样本中规律性上调表达,参与调控细胞周期、细胞衰老等信号通路;其中,E2F1 作为重要的调控因子与其他蛋白的相互作用最多.值得指出的是,E2F 家族转录因子的基因突变类型在肿瘤类型和患者性别中均存在差异,基因扩增占比最大.系统发生分析显示,E2F家族转录因子的结构在包括果蝇、线虫和人类在内 41 个物种中保守,并且它们在物种演化过程中表现出基因扩张倾向.综上所述,本研究阐明了 E2F 家族转录因子在我国高发肿瘤中的表达规律、突变特征和演化规律,提示E2F家族转录因子是相关肿瘤疾病的新型分子诊断标志物,为抗肿瘤靶向药物研发提供理论依据.