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人体细胞中含有超过 146 种GPI锚定蛋白(glycosylphosphatidylinositol-anchored protein,GPI-AP),包括受体、配体、粘附分子和酶等.这些蛋白通过GPI锚定在细胞膜表面的脂筏中,发挥多种重要生物学功能.目前,已经对 GPI 锚定蛋白的生物合成开展了大量研究,其中 GPI-AP 的生物合成包括至少 20 步反应,已鉴定出超过 40 个GPI-AP合成相关基因,但是仍缺乏对于GPI-AP相关基因在正常组织与癌症组织中表达调控的研究.本研究利用来自于TCGA数据库和GTEx portal的基因表达数据,同时结合使用GlycoMaple糖基化通路分析工具,对正常组织与癌症组织中参与 GPI-AP 合成和编码 GPI-AP 的基因的表达情况进行了全面分析.研究发现,与正常组织相比,在早期胶质瘤、多形性胶质母细胞瘤、胰腺癌、睾丸生殖细胞癌、原发性皮肤黑色素瘤和转移性皮肤黑色素瘤中,参与 GPI-AP合成的基因表达发生了显著变化,其中PIGY在这 6 种癌症中表达量均有上升.此外,GPI锚定蛋白编码基因CD14在这6种癌症中的表达量上升.GPI锚定蛋白编码基因GAS1、GPC2、GPC4仅在早期胶质瘤和多形性胶质母细胞瘤中表达量上升,说明部分 GPI 锚定蛋白如 GAS1 等可以作为早期胶质瘤和多形性胶质母细胞瘤生物标志物.本研究为GPI-AP相关基因在正常组织与癌症组织中的表达情

作者:孔维泽;柳艺石;高晓冬;藤田盛久

来源:遗传 2023 年 45卷 8期

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作者:
孔维泽;柳艺石;高晓冬;藤田盛久
来源:
遗传 2023 年 45卷 8期
标签:
糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白(GPI-AP) TCGA 癌症 胶质瘤 标志物 Glycosylphosphatidylinositol anchored protein(GPI-AP) TCGA Cancer Glioma biomarkers
人体细胞中含有超过 146 种GPI锚定蛋白(glycosylphosphatidylinositol-anchored protein,GPI-AP),包括受体、配体、粘附分子和酶等.这些蛋白通过GPI锚定在细胞膜表面的脂筏中,发挥多种重要生物学功能.目前,已经对 GPI 锚定蛋白的生物合成开展了大量研究,其中 GPI-AP 的生物合成包括至少 20 步反应,已鉴定出超过 40 个GPI-AP合成相关基因,但是仍缺乏对于GPI-AP相关基因在正常组织与癌症组织中表达调控的研究.本研究利用来自于TCGA数据库和GTEx portal的基因表达数据,同时结合使用GlycoMaple糖基化通路分析工具,对正常组织与癌症组织中参与 GPI-AP 合成和编码 GPI-AP 的基因的表达情况进行了全面分析.研究发现,与正常组织相比,在早期胶质瘤、多形性胶质母细胞瘤、胰腺癌、睾丸生殖细胞癌、原发性皮肤黑色素瘤和转移性皮肤黑色素瘤中,参与 GPI-AP合成的基因表达发生了显著变化,其中PIGY在这 6 种癌症中表达量均有上升.此外,GPI锚定蛋白编码基因CD14在这6种癌症中的表达量上升.GPI锚定蛋白编码基因GAS1、GPC2、GPC4仅在早期胶质瘤和多形性胶质母细胞瘤中表达量上升,说明部分 GPI 锚定蛋白如 GAS1 等可以作为早期胶质瘤和多形性胶质母细胞瘤生物标志物.本研究为GPI-AP相关基因在正常组织与癌症组织中的表达情