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藏羚羊是我国特有的珍稀濒危动物,对其开展遗传多样性的研究具有非常重要的科学价值.为了获取足够的遗传信息并进一步研究藏羚羊在核基因水平上的遗传多样性,对来自可可西里地区的75个藏羚羊干皮张样本进行了微卫星遗传多样性研究.研究从来自牛和绵羊的25个微卫星基因座中筛选到9个具有高度多态性的微卫星基因座(MCM38,MNS64,IOBT395,MCMAI, TGLA68,BM1329,BMS1341,BM3501和MB066).用非变性聚丙烯凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,计算了这9个微卫星基因座的等位基因频率、多态信息含量、基因杂合度等指标并估算了种群数量.结果在75只藏羚羊中共检测到85个等位基因,9个微卫星基因座的等位基因数为7~12个,平均每个基因座检测到9.4个等位基因,有效等位基因数为处于4.676~9.169之间,平均为6.519;基因频率分布在0.007~0.313之间,多态信息含量在0.753~0.881之间,平均为0.818;观察杂合度为0.791~0.897,平均为0.844,期望杂合度为0.786~0.891之间,平均为0.838±0.0132,各基因座观察杂合度与期望杂合度比较接近.固定指数为-0.269~-0.097,平均为-0.163.Shannon's指数为1.660~2.315,平均为1.990.种群数量的估算结果显示这75个体均来自同一种群.结果表明该种群在核基因水平仍具有丰富的遗传多样性.

作者:周慧;李迪强;张于光;杨涛;刘毅

来源:遗传学报 2007 年 34卷 7期

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作者:
周慧;李迪强;张于光;杨涛;刘毅
来源:
遗传学报 2007 年 34卷 7期
标签:
藏羚羊 微卫星基因座 遗传多样性 可可西里自然保护区 genetic diversity microsatellite locus Tibetan antelope
藏羚羊是我国特有的珍稀濒危动物,对其开展遗传多样性的研究具有非常重要的科学价值.为了获取足够的遗传信息并进一步研究藏羚羊在核基因水平上的遗传多样性,对来自可可西里地区的75个藏羚羊干皮张样本进行了微卫星遗传多样性研究.研究从来自牛和绵羊的25个微卫星基因座中筛选到9个具有高度多态性的微卫星基因座(MCM38,MNS64,IOBT395,MCMAI, TGLA68,BM1329,BMS1341,BM3501和MB066).用非变性聚丙烯凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,计算了这9个微卫星基因座的等位基因频率、多态信息含量、基因杂合度等指标并估算了种群数量.结果在75只藏羚羊中共检测到85个等位基因,9个微卫星基因座的等位基因数为7~12个,平均每个基因座检测到9.4个等位基因,有效等位基因数为处于4.676~9.169之间,平均为6.519;基因频率分布在0.007~0.313之间,多态信息含量在0.753~0.881之间,平均为0.818;观察杂合度为0.791~0.897,平均为0.844,期望杂合度为0.786~0.891之间,平均为0.838±0.0132,各基因座观察杂合度与期望杂合度比较接近.固定指数为-0.269~-0.097,平均为-0.163.Shannon's指数为1.660~2.315,平均为1.990.种群数量的估算结果显示这75个体均来自同一种群.结果表明该种群在核基因水平仍具有丰富的遗传多样性.