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目的 应用基因芯片技术筛选泪腺腺样囊性癌(adenoid cystic carcinoma,ACC)与正常泪腺组织的差异表达基因并对其进行生物学信息分析.方法 ACC与正常泪腺标本各5例,分别制成cRNA探针,与含30 968个明确人类基因的Human OneArray芯片杂交,用Axon GenePix 4000B芯片扫描仪扫描芯片结果,运用生物信息学方法筛选出差异表达基因.结果 与正常泪腺组织相比,ACC有1103个基因显著上调表达,1001个基因显著下调表达.这些基因与细胞的代谢与调节、通讯与定位及细胞周期等有关.经京都基因和基因组百科全书数据库检索,这些上调基因与细胞黏附、细胞通讯和细胞外基质与受体的相互作用等有关,下调基因与MAPK信号通路和Toll样受体信号通路等有关.结论 基因芯片是研究差异表达基因的有力工具,深入研究有助于揭示ACC发病机制和发现新的治疗靶点.

作者:王毅;康莉;黑砚;肖利华

来源:眼科新进展 2010 年 30卷 9期

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作者:
王毅;康莉;黑砚;肖利华
来源:
眼科新进展 2010 年 30卷 9期
标签:
腺样囊性癌 泪腺 基因芯片 差异表达基因
目的 应用基因芯片技术筛选泪腺腺样囊性癌(adenoid cystic carcinoma,ACC)与正常泪腺组织的差异表达基因并对其进行生物学信息分析.方法 ACC与正常泪腺标本各5例,分别制成cRNA探针,与含30 968个明确人类基因的Human OneArray芯片杂交,用Axon GenePix 4000B芯片扫描仪扫描芯片结果,运用生物信息学方法筛选出差异表达基因.结果 与正常泪腺组织相比,ACC有1103个基因显著上调表达,1001个基因显著下调表达.这些基因与细胞的代谢与调节、通讯与定位及细胞周期等有关.经京都基因和基因组百科全书数据库检索,这些上调基因与细胞黏附、细胞通讯和细胞外基质与受体的相互作用等有关,下调基因与MAPK信号通路和Toll样受体信号通路等有关.结论 基因芯片是研究差异表达基因的有力工具,深入研究有助于揭示ACC发病机制和发现新的治疗靶点.