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目的:对Axenfeld-Rieger综合征(ARS)一家系进行临床检查和基因检测,寻找致病突变。方法:采用家系调查研究方法,纳入2018年于哈尔滨医科大学附属第二manbet官网登录 就诊的中国汉族ARS一家系,该家系3代共15人,其中患者3例。详细记录家族史,进行眼科及全身一般检查。采集受检者外周静脉血2~5 ml并提取淋巴细胞基因组DNA和RNA。对先证者DNA进行外显子测序,利用人群数据库及生物信息学分析筛选可疑突变,Sanger测序和实时荧光定量PCR进行验证,对可疑突变进行保守性和有害性预测,参照美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)遗传变异分类标准与指南对候选罕见变异进行致病性评估。结果:3例患者均存在ARS典型的眼部、牙齿和肚脐发育异常,且均携带 PITX2基因c.525delC(p.Asp175Glufs *)杂合突变,家系中其他人员无相应临床表型且未检测到该变异位点,符合家系共分离。3例患者PITX2 mRNA相对表达量为0.672±0.063,明显低于健康对照的1.015±0.179,差异有统计学意义( t=8.847, P<0.001)。dbSNP、1000G、gnomeAD、ExAC、Korea1K、EVS数据库中均未收录该变异,MutationTaster评为有害,受影响的氨基酸序列在9种动物中保守存在。ACMG遗传变异分类标准和指南评价该变异位点为致病变异。 结

作者:王琦;刘鑫娜;邵正波;原慧萍

来源:中华实验眼科杂志 2022 年 40卷 10期

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作者:
王琦;刘鑫娜;邵正波;原慧萍
来源:
中华实验眼科杂志 2022 年 40卷 10期
标签:
Axenfeld-Rieger综合征 家系 基因检测 全外显子组测序 PITX2基因 移码突变 Axenfeld-Rieger syndrome Pedigree Genetic testing Whole exome sequencing PITX2 gene Frameshift mutation
目的:对Axenfeld-Rieger综合征(ARS)一家系进行临床检查和基因检测,寻找致病突变。方法:采用家系调查研究方法,纳入2018年于哈尔滨医科大学附属第二manbet官网登录 就诊的中国汉族ARS一家系,该家系3代共15人,其中患者3例。详细记录家族史,进行眼科及全身一般检查。采集受检者外周静脉血2~5 ml并提取淋巴细胞基因组DNA和RNA。对先证者DNA进行外显子测序,利用人群数据库及生物信息学分析筛选可疑突变,Sanger测序和实时荧光定量PCR进行验证,对可疑突变进行保守性和有害性预测,参照美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)遗传变异分类标准与指南对候选罕见变异进行致病性评估。结果:3例患者均存在ARS典型的眼部、牙齿和肚脐发育异常,且均携带 PITX2基因c.525delC(p.Asp175Glufs *)杂合突变,家系中其他人员无相应临床表型且未检测到该变异位点,符合家系共分离。3例患者PITX2 mRNA相对表达量为0.672±0.063,明显低于健康对照的1.015±0.179,差异有统计学意义( t=8.847, P<0.001)。dbSNP、1000G、gnomeAD、ExAC、Korea1K、EVS数据库中均未收录该变异,MutationTaster评为有害,受影响的氨基酸序列在9种动物中保守存在。ACMG遗传变异分类标准和指南评价该变异位点为致病变异。 结