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目的 影响胰腺癌中免疫细胞浸润的机制尚未明确.文章旨在研究胰腺癌中影响免疫浸润相关的lncRNA-mRNA调控通路.方法 利用TCGA以及GEO基因表达数据筛选共同的差异lncRNAs,并对筛选出的差异lncRNAs进行生存分析、靶基因预测、GO、KEGG富集分析、免疫浸润分析以及基因集富集分析(GSEA),找到免疫浸润相关通路.结果 ADAMTS9-AS1高表达的胰腺癌患者较低表达患者有更高的生存率(P=0.010).ADAMTS9-AS1相关性较强的差异mRNA,GO富集结果共筛选到356个条目,结果与免疫相关,如白细胞-细胞黏附、肿瘤坏死因子超家族细胞因子产生的调控等;KEGG结果共筛选到9个通路,分别为金黄色葡萄球菌感染、细胞周期、补体和凝血级联、卵母细胞减数分裂、孕酮介导的卵母细胞成熟、破骨细胞分化、类风湿关节炎、百日咳以及人T细胞白血病病毒1感染.对照IMMPORT数据库中2498个肿瘤免疫相关基因,发现SEMA3G为免疫相关基因,且与ADAMTS9-AS1相关性最高(r=0.657,P<0.05).ADAMTS9-AS1及SEMA3G的表达与免疫细胞浸润呈正相关(P<0.05).GSEA富集分析结果显示ADAMTS9-AS1也可能与柠檬酸盐循环、脂肪酸代谢、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、溶酶体、过氧化物酶体、丙酸盐代谢、蛋白酶体、丙酮酸盐代谢、核糖体、缬氨酸-亮氨酸和异亮氨酸降解通路相关.

作者:马佳康;任凯凯;蔺小艳;侯明宇;周博;马军

来源:医学研究生学报 2020 年 33卷 2期

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作者:
马佳康;任凯凯;蔺小艳;侯明宇;周博;马军
来源:
医学研究生学报 2020 年 33卷 2期
标签:
胰腺癌 长链非编码RNA 免疫浸润 通路 生存
目的 影响胰腺癌中免疫细胞浸润的机制尚未明确.文章旨在研究胰腺癌中影响免疫浸润相关的lncRNA-mRNA调控通路.方法 利用TCGA以及GEO基因表达数据筛选共同的差异lncRNAs,并对筛选出的差异lncRNAs进行生存分析、靶基因预测、GO、KEGG富集分析、免疫浸润分析以及基因集富集分析(GSEA),找到免疫浸润相关通路.结果 ADAMTS9-AS1高表达的胰腺癌患者较低表达患者有更高的生存率(P=0.010).ADAMTS9-AS1相关性较强的差异mRNA,GO富集结果共筛选到356个条目,结果与免疫相关,如白细胞-细胞黏附、肿瘤坏死因子超家族细胞因子产生的调控等;KEGG结果共筛选到9个通路,分别为金黄色葡萄球菌感染、细胞周期、补体和凝血级联、卵母细胞减数分裂、孕酮介导的卵母细胞成熟、破骨细胞分化、类风湿关节炎、百日咳以及人T细胞白血病病毒1感染.对照IMMPORT数据库中2498个肿瘤免疫相关基因,发现SEMA3G为免疫相关基因,且与ADAMTS9-AS1相关性最高(r=0.657,P<0.05).ADAMTS9-AS1及SEMA3G的表达与免疫细胞浸润呈正相关(P<0.05).GSEA富集分析结果显示ADAMTS9-AS1也可能与柠檬酸盐循环、脂肪酸代谢、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、溶酶体、过氧化物酶体、丙酸盐代谢、蛋白酶体、丙酮酸盐代谢、核糖体、缬氨酸-亮氨酸和异亮氨酸降解通路相关.