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目的 对西洋参Panax quinquefolium种子休眠与萌发过程中赤霉素20-氧化酶(GA20ox)基因编码区进行克隆及生物信息学分析.方法 根据西洋参种子转录组的注释信息,得到9条GA20ox相关序列,通过比对分析确定了GA20ox的转录本.采用qRT-PCR方法得到西洋参GA20ox (PqGA20ox)的cDNA全长,并对其编码蛋白进行生物信息学分析.采用实时荧光定量PCR方法检测PqGA20ox基因在根、茎、叶和种子休眠不同时期的表达水平.结果 生物信息学分析表明,PqGA20ox基因全长1 092 bp,编码363个氨基酸残基,PqGA20ox编码蛋白不含跨膜区,不含信号肽.qRT-PCR实验结果显示PqGA20ox基因在形态休眠起始期和生理休眠起始期表达量高于其他时期.结论 首次获得PqGA20ox基因的编码区序列,为进一步研究西洋参种子解除休眠的分子机制奠定基础.

作者:孙同玉;祝娟;孙鹏;廖登群;李先恩;祁建军

来源:中草药 2015 年 46卷 11期

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作者:
孙同玉;祝娟;孙鹏;廖登群;李先恩;祁建军
来源:
中草药 2015 年 46卷 11期
标签:
西洋参 种子休眠与萌发 赤霉素20-氧化酶 克隆 实时荧光定量PCR Panax quinquefolium L. seed dormancy and germination GA20ox cloning real time fluorescent quantitative PCR
目的 对西洋参Panax quinquefolium种子休眠与萌发过程中赤霉素20-氧化酶(GA20ox)基因编码区进行克隆及生物信息学分析.方法 根据西洋参种子转录组的注释信息,得到9条GA20ox相关序列,通过比对分析确定了GA20ox的转录本.采用qRT-PCR方法得到西洋参GA20ox (PqGA20ox)的cDNA全长,并对其编码蛋白进行生物信息学分析.采用实时荧光定量PCR方法检测PqGA20ox基因在根、茎、叶和种子休眠不同时期的表达水平.结果 生物信息学分析表明,PqGA20ox基因全长1 092 bp,编码363个氨基酸残基,PqGA20ox编码蛋白不含跨膜区,不含信号肽.qRT-PCR实验结果显示PqGA20ox基因在形态休眠起始期和生理休眠起始期表达量高于其他时期.结论 首次获得PqGA20ox基因的编码区序列,为进一步研究西洋参种子解除休眠的分子机制奠定基础.