目的 为探寻药用植物灯盏花Erigeron breviscapus的遗传背景,利用低氮胁迫的灯盏花全植株构建了转录组文库,并利用新一代测序技术进行测序.方法 采用改良异硫氰酸胍-CTAB法,提取低氮胁迫灯盏花植株及其对照植株的总RNA,经富集mRNA、打断、构建测序用cDNA文库.结果 通过测序,低氮和正常样本分别获得3 587万条和2 582万条测序读长(raw reads),总数据量超过6G,碱基错误率低于1％ (Q20)的数据分别为98.37％和98.67％.经de novo组装,总共得到101、156条Unigene,平均读长768 bp,N50为1 290bp,其中44.39％长度超过500bp.101、156条Unigene中,58.86％在公共数据库中比对到相似序列,89.08％Unigene在Nr数据库比对到相似序列.得到灯盏花黄酮类合成途径中包括苯丙氨酸解氨酶(PAL)、肉桂酰-4-羟化酶(C4H)、查耳酮合成酶(CHS)、查耳酮异构酶(CHI)、黄烷酮3-羟化酶(F3H)、类黄酮3'-羟化酶(F3H)、花色素还原酶(ANS)等序列.结论 灯盏花的转录组信息得到较好的保存,为下一步灯盏花遗传环境互作研究及分子辅助育种奠定基础.
作者：田宝强；李玥；赖思晨；木佳；应宇翔；严胜柒；张云峰
来源：中草药 2015 年 46卷 21期
