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目的 构建两面针干预炎症的“活性成分-炎症靶点-抗炎通路”网络关系,预测其干预炎症的靶点及机制.方法 通过国内外文献调研和中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库及Pharmmapper服务器,以口服利用度(OB)和类药性(DL)作为限定条件对两面针成分进行筛选并预测和收集相关靶点.利用OMIM等数据库筛选炎症相关的基因和蛋白靶点;STRING数据库构建炎症靶点之间的交互网络;蛋白互作(PPI)网络分析获得“活性成分-预测靶点-炎症靶点”网络文件,并将其导入Cytoscape 3.5.1软件构建“活性成分-炎症靶点”网络,从而获得与两面针抗炎直接相关的靶点;利用DAVID数据库对筛选后的靶点进行KEGG通路富集,使用Cytoscape 3.5.1的插件ClueGO对其涉及的靶点进行生物学功能分析,最终合并以上关系构建“活性成分-炎症靶点-抗炎通路”网络.结果 经筛选和分析获得两面针活性成分23个,抗炎靶点9个,包括COX-2、iNOS、PPARG、COX1、MAPK-14、JUN等,两面针抗炎的可能通路包括TNF信号通路、TRLs信号通路.结论 初步揭示了两面针的抗炎作用是通过多成分和多靶点的相互作用,调控多条通路共同干预实现的,但关键的靶标和具体的调控机制尚待进一步的实验研究加以探索及验证.

作者:邬国松;郑丽婷;马庆;韩正洲;詹若挺;陈蔚文;牛明

来源:中草药 2019 年 50卷 3期

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作者:
邬国松;郑丽婷;马庆;韩正洲;詹若挺;陈蔚文;牛明
来源:
中草药 2019 年 50卷 3期
标签:
两面针 网络药理学 活性成分 作用靶点 抗炎机制
目的 构建两面针干预炎症的“活性成分-炎症靶点-抗炎通路”网络关系,预测其干预炎症的靶点及机制.方法 通过国内外文献调研和中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库及Pharmmapper服务器,以口服利用度(OB)和类药性(DL)作为限定条件对两面针成分进行筛选并预测和收集相关靶点.利用OMIM等数据库筛选炎症相关的基因和蛋白靶点;STRING数据库构建炎症靶点之间的交互网络;蛋白互作(PPI)网络分析获得“活性成分-预测靶点-炎症靶点”网络文件,并将其导入Cytoscape 3.5.1软件构建“活性成分-炎症靶点”网络,从而获得与两面针抗炎直接相关的靶点;利用DAVID数据库对筛选后的靶点进行KEGG通路富集,使用Cytoscape 3.5.1的插件ClueGO对其涉及的靶点进行生物学功能分析,最终合并以上关系构建“活性成分-炎症靶点-抗炎通路”网络.结果 经筛选和分析获得两面针活性成分23个,抗炎靶点9个,包括COX-2、iNOS、PPARG、COX1、MAPK-14、JUN等,两面针抗炎的可能通路包括TNF信号通路、TRLs信号通路.结论 初步揭示了两面针的抗炎作用是通过多成分和多靶点的相互作用,调控多条通路共同干预实现的,但关键的靶标和具体的调控机制尚待进一步的实验研究加以探索及验证.