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目的 通过网络药理学及分子对接法探讨三仁汤主要成分对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)及中医整合药理学研究平台V2.0 (TCMIP V2.0)获得三仁汤君药(苦杏仁、白蔻仁、薏苡仁)全部化学成分并筛选,结合相关文献筛得主要活性成分.借助UniPort数据库查询活性成分对应靶标蛋白,Cytoscape3.7.2构建成分-靶点网络.通过STRING网站构建PPI蛋白互作网络,运用cytoHubba分析关键子网络.CTD数据库对三仁汤君药活性成分靶蛋白进行GO、KEGG富集分析.以三仁汤君药活性成分及洛匹那韦等相关化学药物为配体,通过CB-Dock网站分别与新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 3CL水解酶进行分子对接.结果 三仁汤君药共有39个活性成分,对应有效靶标168个.GO功能富集分析筛得生物学过程(BP)、细胞组成(CC)、分子功能(MF)分别为25条、14条及2条.KEGG富集筛得先天免疫系统(innate immune system)、免疫系统中的细胞因子信号转导(cytokine signaling in immune system)及白介素信号通路(signaling by interleukins)等信号通路,共36条.分子对接提示三仁汤君药活性成分白桦脂酸、枣素及齐墩果酸与SARS-CoV-2 3CL水解酶结合性较好,三者的Vina得分与3CLpro抑制剂洛匹那韦及RdRp抑制剂瑞德西韦的得分相近.

作者:李嘉丽;杨良俊;周恒立;林琨洋;梁绮婷;何维;赵自明;潘华峰

来源:中草药 2020 年 51卷 9期

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作者:
李嘉丽;杨良俊;周恒立;林琨洋;梁绮婷;何维;赵自明;潘华峰
来源:
中草药 2020 年 51卷 9期
标签:
新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 三仁汤 网络药理学 分子对接 3CL水解酶 白桦脂酸 枣素 齐墩果酸
目的 通过网络药理学及分子对接法探讨三仁汤主要成分对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)及中医整合药理学研究平台V2.0 (TCMIP V2.0)获得三仁汤君药(苦杏仁、白蔻仁、薏苡仁)全部化学成分并筛选,结合相关文献筛得主要活性成分.借助UniPort数据库查询活性成分对应靶标蛋白,Cytoscape3.7.2构建成分-靶点网络.通过STRING网站构建PPI蛋白互作网络,运用cytoHubba分析关键子网络.CTD数据库对三仁汤君药活性成分靶蛋白进行GO、KEGG富集分析.以三仁汤君药活性成分及洛匹那韦等相关化学药物为配体,通过CB-Dock网站分别与新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 3CL水解酶进行分子对接.结果 三仁汤君药共有39个活性成分,对应有效靶标168个.GO功能富集分析筛得生物学过程(BP)、细胞组成(CC)、分子功能(MF)分别为25条、14条及2条.KEGG富集筛得先天免疫系统(innate immune system)、免疫系统中的细胞因子信号转导(cytokine signaling in immune system)及白介素信号通路(signaling by interleukins)等信号通路,共36条.分子对接提示三仁汤君药活性成分白桦脂酸、枣素及齐墩果酸与SARS-CoV-2 3CL水解酶结合性较好,三者的Vina得分与3CLpro抑制剂洛匹那韦及RdRp抑制剂瑞德西韦的得分相近.